Protein–RNA interactions for Protein: Q12308

TFC8, Transcription factor tau 60 kDa subunit, yeastyeast

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFC8Q12308 NSR1YGR159C 1245 nt22.41■■□□□ 1.18
TFC8Q12308 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.32■■□□□ 1.16
TFC8Q12308 NOP1YDL014W 984 nt21.39■■□□□ 1.01
TFC8Q12308 MDJ1YFL016C 1536 nt20.39■□□□□ 0.85
TFC8Q12308 YKL036CYKL036C 393 nt19.93■□□□□ 0.78
TFC8Q12308 YGR139WYGR139W 339 nt19.26■□□□□ 0.67
TFC8Q12308 SRX1YKL086W 384 nt18.84■□□□□ 0.61
TFC8Q12308 Q0297Q0297 156 nt18.79■□□□□ 0.6
TFC8Q12308 YJL027CYJL027C 417 nt18.74■□□□□ 0.59
TFC8Q12308 SCS3YGL126W 1143 nt18.52■□□□□ 0.56
TFC8Q12308 DBP2YNL112W 1641 nt18.02■□□□□ 0.48
TFC8Q12308 VAR1Q0140 1197 nt18■□□□□ 0.47
TFC8Q12308 YCR051WYCR051W 669 nt17.81■□□□□ 0.44
TFC8Q12308 SCJ1YMR214W 1134 nt17.71■□□□□ 0.43
TFC8Q12308 MOT3YMR070W 1473 nt17.42■□□□□ 0.38
TFC8Q12308 NME1NME1 340 nt17.35■□□□□ 0.37
TFC8Q12308 YBR190WYBR190W 312 nt17.32■□□□□ 0.36
TFC8Q12308 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.31■□□□□ 0.36
TFC8Q12308 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.31■□□□□ 0.36
TFC8Q12308 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.31■□□□□ 0.36
TFC8Q12308 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.31■□□□□ 0.36
TFC8Q12308 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.31■□□□□ 0.36
TFC8Q12308 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.31■□□□□ 0.36
TFC8Q12308 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.31■□□□□ 0.36
TFC8Q12308 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.31■□□□□ 0.36
TFC8Q12308 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.31■□□□□ 0.36
TFC8Q12308 YDR509WYDR509W 348 nt17.19■□□□□ 0.34
TFC8Q12308 YOL085CYOL085C 342 nt17.18■□□□□ 0.34
TFC8Q12308 Q0182Q0182 405 nt17.16■□□□□ 0.34
TFC8Q12308 CSM2YIL132C 642 nt17.16■□□□□ 0.34
TFC8Q12308 CCC1YLR220W 969 nt17.06■□□□□ 0.32
TFC8Q12308 PAU21YOR394W 495 nt17.01■□□□□ 0.31
TFC8Q12308 PAU22YPL282C 495 nt17.01■□□□□ 0.31
TFC8Q12308 PKP1YIL042C 1185 nt16.88■□□□□ 0.29
TFC8Q12308 PAM17YKR065C 594 nt16.86■□□□□ 0.29
TFC8Q12308 RTC3YHR087W 336 nt16.85■□□□□ 0.29
TFC8Q12308 ATS1YAL020C 1002 nt16.85■□□□□ 0.29
TFC8Q12308 RPP1BYDL130W 321 nt16.84■□□□□ 0.29
TFC8Q12308 ARO7YPR060C 771 nt16.82■□□□□ 0.28
TFC8Q12308 Q0144Q0144 330 nt16.5■□□□□ 0.23
TFC8Q12308 REG2YBR050C 1017 nt16.5■□□□□ 0.23
TFC8Q12308 RVS167YDR388W 1449 nt16.46■□□□□ 0.23
TFC8Q12308 BMT5YIL096C 1011 nt16.43■□□□□ 0.22
TFC8Q12308 Q0017Q0017 162 nt16.42■□□□□ 0.22
TFC8Q12308 Q0142Q0142 177 nt16.4■□□□□ 0.22
TFC8Q12308 BUR6YER159C 429 nt16.39■□□□□ 0.21
TFC8Q12308 SEM1YDR363W-A 270 nt16.28■□□□□ 0.2
TFC8Q12308 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.24■□□□□ 0.19
TFC8Q12308 PET122YER153C 765 nt16.23■□□□□ 0.19
TFC8Q12308 PUT4YOR348C 1884 nt16.16■□□□□ 0.18
TFC8Q12308 Q0010Q0010 387 nt16.12■□□□□ 0.17
TFC8Q12308 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt16■□□□□ 0.15
TFC8Q12308 SHR5YOL110W 714 nt15.96■□□□□ 0.15
TFC8Q12308 SSA3YBL075C 1950 nt15.91■□□□□ 0.14
TFC8Q12308 SRN2YLR119W 642 nt15.91■□□□□ 0.14
TFC8Q12308 Q0255Q0255 1419 nt15.81■□□□□ 0.12
TFC8Q12308 SCR1SCR1 522 nt15.8■□□□□ 0.12
TFC8Q12308 ARE1YCR048W 1833 nt15.79■□□□□ 0.12
TFC8Q12308 AI3Q0060 1248 nt15.76■□□□□ 0.11
TFC8Q12308 URN1YPR152C 1398 nt15.75■□□□□ 0.11
TFC8Q12308 DEP1YAL013W 1218 nt15.71■□□□□ 0.11
TFC8Q12308 YCR099CYCR099C 468 nt15.69■□□□□ 0.1
TFC8Q12308 RRN5YLR141W 1092 nt15.69■□□□□ 0.1
TFC8Q12308 YOR169CYOR169C 465 nt15.68■□□□□ 0.1
TFC8Q12308 YDJ1YNL064C 1230 nt15.66■□□□□ 0.1
TFC8Q12308 SAH1YER043C 1350 nt15.65■□□□□ 0.1
TFC8Q12308 AI5_BETAQ0075 1065 nt15.64■□□□□ 0.09
TFC8Q12308 YGL188CYGL188C 174 nt15.61■□□□□ 0.09
TFC8Q12308 OPI9YLR338W 858 nt15.6■□□□□ 0.09
TFC8Q12308 ARP10YDR106W 855 nt15.56■□□□□ 0.08
TFC8Q12308 ARA2YMR041C 1008 nt15.55■□□□□ 0.08
TFC8Q12308 POA1YBR022W 534 nt15.55■□□□□ 0.08
TFC8Q12308 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.48■□□□□ 0.07
TFC8Q12308 PST2YDR032C 597 nt15.44■□□□□ 0.06
TFC8Q12308 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.41■□□□□ 0.06
TFC8Q12308 GAR1YHR089C 618 nt15.39■□□□□ 0.05
TFC8Q12308 PET20YPL159C 762 nt15.36■□□□□ 0.05
TFC8Q12308 YKL097CYKL097C 411 nt15.35■□□□□ 0.05
TFC8Q12308 ATP6Q0085 780 nt15.34■□□□□ 0.05
TFC8Q12308 YNL208WYNL208W 600 nt15.3■□□□□ 0.04
TFC8Q12308 BSC6YOL137W 1494 nt15.3■□□□□ 0.04
TFC8Q12308 YLR122CYLR122C 378 nt15.24■□□□□ 0.03
TFC8Q12308 RPN10YHR200W 807 nt15.23■□□□□ 0.03
TFC8Q12308 RSB1YOR049C 1065 nt15.23■□□□□ 0.03
TFC8Q12308 AIR1YIL079C 1083 nt15.22■□□□□ 0.03
TFC8Q12308 ABZ2YMR289W 1125 nt15.18■□□□□ 0.02
TFC8Q12308 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt15.17■□□□□ 0.02
TFC8Q12308 snR78snR78 87 nt15.12■□□□□ 0.01
TFC8Q12308 UTP6YDR449C 1323 nt15.11■□□□□ 0.01
TFC8Q12308 SPT5YML010W 3192 nt15.1■□□□□ 0.01
TFC8Q12308 YNR068CYNR068C 819 nt15.09■□□□□ 0.01
TFC8Q12308 PUN1YLR414C 792 nt15.04■□□□□ -0
TFC8Q12308 SKG1YKR100C 1068 nt15.03■□□□□ -0
TFC8Q12308 PTC2YER089C 1395 nt15.01□□□□□ -0.01
TFC8Q12308 BUD23YCR047C 828 nt15.01□□□□□ -0.01
TFC8Q12308 YPL168WYPL168W 1293 nt15.01□□□□□ -0.01
TFC8Q12308 YJR120WYJR120W 351 nt14.99□□□□□ -0.01
TFC8Q12308 YJR018WYJR018W 363 nt14.98□□□□□ -0.01
TFC8Q12308 KTR3YBR205W 1215 nt14.91□□□□□ -0.02
TFC8Q12308 SSA1YAL005C 1929 nt14.91□□□□□ -0.02
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