Protein–RNA interactions for Protein: P35209

SPT21, Protein SPT21, yeastyeast

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT21P35209 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.71■■□□□ 1.39
SPT21P35209 NSR1YGR159C 1245 nt23.3■■□□□ 1.32
SPT21P35209 NOP1YDL014W 984 nt23.23■■□□□ 1.31
SPT21P35209 YKL036CYKL036C 393 nt21.86■■□□□ 1.09
SPT21P35209 Q0297Q0297 156 nt20.58■□□□□ 0.89
SPT21P35209 YJL027CYJL027C 417 nt20.44■□□□□ 0.86
SPT21P35209 SRX1YKL086W 384 nt20.37■□□□□ 0.85
SPT21P35209 MDJ1YFL016C 1536 nt20.25■□□□□ 0.83
SPT21P35209 SCS3YGL126W 1143 nt20.14■□□□□ 0.81
SPT21P35209 YGR139WYGR139W 339 nt20.13■□□□□ 0.81
SPT21P35209 YCR051WYCR051W 669 nt19.26■□□□□ 0.67
SPT21P35209 YOL085CYOL085C 342 nt18.97■□□□□ 0.63
SPT21P35209 MOT3YMR070W 1473 nt18.9■□□□□ 0.62
SPT21P35209 Q0182Q0182 405 nt18.66■□□□□ 0.58
SPT21P35209 PKP1YIL042C 1185 nt18.57■□□□□ 0.56
SPT21P35209 RPP1BYDL130W 321 nt18.43■□□□□ 0.54
SPT21P35209 NME1NME1 340 nt18.41■□□□□ 0.54
SPT21P35209 SCJ1YMR214W 1134 nt18.4■□□□□ 0.54
SPT21P35209 DBP2YNL112W 1641 nt18.2■□□□□ 0.5
SPT21P35209 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.19■□□□□ 0.5
SPT21P35209 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.19■□□□□ 0.5
SPT21P35209 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.19■□□□□ 0.5
SPT21P35209 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.19■□□□□ 0.5
SPT21P35209 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.19■□□□□ 0.5
SPT21P35209 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.19■□□□□ 0.5
SPT21P35209 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.19■□□□□ 0.5
SPT21P35209 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.19■□□□□ 0.5
SPT21P35209 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.19■□□□□ 0.5
SPT21P35209 ATS1YAL020C 1002 nt18.15■□□□□ 0.5
SPT21P35209 VAR1Q0140 1197 nt18.09■□□□□ 0.49
SPT21P35209 CSM2YIL132C 642 nt18.03■□□□□ 0.48
SPT21P35209 CCC1YLR220W 969 nt17.9■□□□□ 0.46
SPT21P35209 PAU21YOR394W 495 nt17.83■□□□□ 0.44
SPT21P35209 PAU22YPL282C 495 nt17.83■□□□□ 0.44
SPT21P35209 ARO7YPR060C 771 nt17.63■□□□□ 0.41
SPT21P35209 SSA3YBL075C 1950 nt17.59■□□□□ 0.41
SPT21P35209 YDR509WYDR509W 348 nt17.59■□□□□ 0.41
SPT21P35209 PET122YER153C 765 nt17.55■□□□□ 0.4
SPT21P35209 PAM17YKR065C 594 nt17.54■□□□□ 0.4
SPT21P35209 SCR1SCR1 522 nt17.4■□□□□ 0.38
SPT21P35209 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.33■□□□□ 0.36
SPT21P35209 REG2YBR050C 1017 nt17.22■□□□□ 0.35
SPT21P35209 YBR190WYBR190W 312 nt17.19■□□□□ 0.34
SPT21P35209 RRN5YLR141W 1092 nt17.09■□□□□ 0.33
SPT21P35209 BUR6YER159C 429 nt17.03■□□□□ 0.32
SPT21P35209 RVS167YDR388W 1449 nt17.03■□□□□ 0.32
SPT21P35209 BMT5YIL096C 1011 nt17■□□□□ 0.31
SPT21P35209 Q0144Q0144 330 nt16.95■□□□□ 0.3
SPT21P35209 Q0010Q0010 387 nt16.82■□□□□ 0.28
SPT21P35209 PST2YDR032C 597 nt16.79■□□□□ 0.28
SPT21P35209 RSB1YOR049C 1065 nt16.79■□□□□ 0.28
SPT21P35209 SEM1YDR363W-A 270 nt16.78■□□□□ 0.28
SPT21P35209 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.78■□□□□ 0.28
SPT21P35209 YDJ1YNL064C 1230 nt16.78■□□□□ 0.28
SPT21P35209 RTC3YHR087W 336 nt16.71■□□□□ 0.27
SPT21P35209 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt16.65■□□□□ 0.26
SPT21P35209 SHR5YOL110W 714 nt16.62■□□□□ 0.25
SPT21P35209 SRN2YLR119W 642 nt16.61■□□□□ 0.25
SPT21P35209 Q0142Q0142 177 nt16.53■□□□□ 0.24
SPT21P35209 Q0017Q0017 162 nt16.4■□□□□ 0.22
SPT21P35209 ARA2YMR041C 1008 nt16.35■□□□□ 0.21
SPT21P35209 GAR1YHR089C 618 nt16.26■□□□□ 0.19
SPT21P35209 YKL097CYKL097C 411 nt16.23■□□□□ 0.19
SPT21P35209 YCR099CYCR099C 468 nt16.21■□□□□ 0.19
SPT21P35209 AI3Q0060 1248 nt16.21■□□□□ 0.19
SPT21P35209 ARP10YDR106W 855 nt16.16■□□□□ 0.18
SPT21P35209 Q0255Q0255 1419 nt16.07■□□□□ 0.16
SPT21P35209 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt16.01■□□□□ 0.15
SPT21P35209 YLR122CYLR122C 378 nt16.01■□□□□ 0.15
SPT21P35209 SHU1YHL006C 453 nt15.97■□□□□ 0.15
SPT21P35209 DEP1YAL013W 1218 nt15.95■□□□□ 0.14
SPT21P35209 ABZ2YMR289W 1125 nt15.93■□□□□ 0.14
SPT21P35209 PET20YPL159C 762 nt15.91■□□□□ 0.14
SPT21P35209 AI5_BETAQ0075 1065 nt15.9■□□□□ 0.14
SPT21P35209 YOR169CYOR169C 465 nt15.89■□□□□ 0.13
SPT21P35209 URN1YPR152C 1398 nt15.87■□□□□ 0.13
SPT21P35209 YGL188CYGL188C 174 nt15.82■□□□□ 0.12
SPT21P35209 YNL208WYNL208W 600 nt15.78■□□□□ 0.12
SPT21P35209 UTP6YDR449C 1323 nt15.76■□□□□ 0.11
SPT21P35209 TIR1YER011W 765 nt15.73■□□□□ 0.11
SPT21P35209 RPN10YHR200W 807 nt15.67■□□□□ 0.1
SPT21P35209 snR78snR78 87 nt15.66■□□□□ 0.1
SPT21P35209 TOM20YGR082W 552 nt15.66■□□□□ 0.1
SPT21P35209 SKG1YKR100C 1068 nt15.66■□□□□ 0.1
SPT21P35209 ATP6Q0085 780 nt15.65■□□□□ 0.1
SPT21P35209 YOR139CYOR139C 393 nt15.61■□□□□ 0.09
SPT21P35209 AIR1YIL079C 1083 nt15.6■□□□□ 0.09
SPT21P35209 OPI9YLR338W 858 nt15.59■□□□□ 0.09
SPT21P35209 YNR068CYNR068C 819 nt15.57■□□□□ 0.08
SPT21P35209 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.55■□□□□ 0.08
SPT21P35209 MET8YBR213W 825 nt15.55■□□□□ 0.08
SPT21P35209 CLB6YGR109C 1143 nt15.52■□□□□ 0.08
SPT21P35209 SSA1YAL005C 1929 nt15.51■□□□□ 0.07
SPT21P35209 YPL168WYPL168W 1293 nt15.5■□□□□ 0.07
SPT21P35209 HMT1YBR034C 1047 nt15.44■□□□□ 0.06
SPT21P35209 SRB2YHR041C 633 nt15.39■□□□□ 0.05
SPT21P35209 SAH1YER043C 1350 nt15.36■□□□□ 0.05
SPT21P35209 URH1YDR400W 1023 nt15.35■□□□□ 0.05
SPT21P35209 LCP5YER127W 1074 nt15.35■□□□□ 0.05
SPT21P35209 PUT4YOR348C 1884 nt15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms