Protein–RNA interactions for Protein: P36062

AVT3, Vacuolar amino acid transporter 3, yeastyeast

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Length 692 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT3P36062 MOT3YMR070W 1473 nt22.45■■□□□ 1.18
AVT3P36062 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.39■■□□□ 1.17
AVT3P36062 Q0182Q0182 405 nt22.36■■□□□ 1.17
AVT3P36062 YGR139WYGR139W 339 nt22.28■■□□□ 1.16
AVT3P36062 NOP1YDL014W 984 nt22.16■■□□□ 1.14
AVT3P36062 NSR1YGR159C 1245 nt21.85■■□□□ 1.09
AVT3P36062 NME1NME1 340 nt21.09■□□□□ 0.97
AVT3P36062 YKL036CYKL036C 393 nt20.97■□□□□ 0.95
AVT3P36062 CSM2YIL132C 642 nt20.22■□□□□ 0.83
AVT3P36062 PAU21YOR394W 495 nt19.87■□□□□ 0.77
AVT3P36062 PAU22YPL282C 495 nt19.87■□□□□ 0.77
AVT3P36062 YJL027CYJL027C 417 nt19.65■□□□□ 0.74
AVT3P36062 ARO7YPR060C 771 nt19.64■□□□□ 0.73
AVT3P36062 Q0297Q0297 156 nt19.59■□□□□ 0.73
AVT3P36062 SRX1YKL086W 384 nt19.34■□□□□ 0.69
AVT3P36062 SCS3YGL126W 1143 nt19.33■□□□□ 0.68
AVT3P36062 PAM17YKR065C 594 nt19.21■□□□□ 0.67
AVT3P36062 REG2YBR050C 1017 nt19.11■□□□□ 0.65
AVT3P36062 BUR6YER159C 429 nt18.65■□□□□ 0.58
AVT3P36062 MDJ1YFL016C 1536 nt18.62■□□□□ 0.57
AVT3P36062 YDR509WYDR509W 348 nt18.58■□□□□ 0.56
AVT3P36062 Q0010Q0010 387 nt18.54■□□□□ 0.56
AVT3P36062 BMT5YIL096C 1011 nt18.53■□□□□ 0.56
AVT3P36062 YCR051WYCR051W 669 nt18.31■□□□□ 0.52
AVT3P36062 ARA2YMR041C 1008 nt18.3■□□□□ 0.52
AVT3P36062 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt18.27■□□□□ 0.52
AVT3P36062 VAR1Q0140 1197 nt18.25■□□□□ 0.51
AVT3P36062 SRN2YLR119W 642 nt18.23■□□□□ 0.51
AVT3P36062 SSA3YBL075C 1950 nt18.22■□□□□ 0.51
AVT3P36062 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt18.17■□□□□ 0.5
AVT3P36062 YOL085CYOL085C 342 nt18.1■□□□□ 0.49
AVT3P36062 SCJ1YMR214W 1134 nt18.09■□□□□ 0.49
AVT3P36062 Q0144Q0144 330 nt18.06■□□□□ 0.48
AVT3P36062 MET8YBR213W 825 nt18.06■□□□□ 0.48
AVT3P36062 SEM1YDR363W-A 270 nt18.03■□□□□ 0.48
AVT3P36062 YLR122CYLR122C 378 nt18.02■□□□□ 0.48
AVT3P36062 CLB6YGR109C 1143 nt17.99■□□□□ 0.47
AVT3P36062 ABZ2YMR289W 1125 nt17.82■□□□□ 0.44
AVT3P36062 ARP10YDR106W 855 nt17.69■□□□□ 0.42
AVT3P36062 TOM20YGR082W 552 nt17.67■□□□□ 0.42
AVT3P36062 PKP1YIL042C 1185 nt17.64■□□□□ 0.41
AVT3P36062 RPP1BYDL130W 321 nt17.54■□□□□ 0.4
AVT3P36062 ATS1YAL020C 1002 nt17.5■□□□□ 0.39
AVT3P36062 LCP5YER127W 1074 nt17.49■□□□□ 0.39
AVT3P36062 URH1YDR400W 1023 nt17.47■□□□□ 0.39
AVT3P36062 YCR099CYCR099C 468 nt17.43■□□□□ 0.38
AVT3P36062 UTP6YDR449C 1323 nt17.42■□□□□ 0.38
AVT3P36062 AI5_BETAQ0075 1065 nt17.33■□□□□ 0.36
AVT3P36062 AI3Q0060 1248 nt17.28■□□□□ 0.36
AVT3P36062 PET20YPL159C 762 nt17.28■□□□□ 0.36
AVT3P36062 HMT1YBR034C 1047 nt17.27■□□□□ 0.36
AVT3P36062 SKG1YKR100C 1068 nt17.18■□□□□ 0.34
AVT3P36062 snR78snR78 87 nt17.11■□□□□ 0.33
AVT3P36062 YPL071CYPL071C 471 nt17.1■□□□□ 0.33
AVT3P36062 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.08■□□□□ 0.32
AVT3P36062 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.08■□□□□ 0.32
AVT3P36062 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.08■□□□□ 0.32
AVT3P36062 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.08■□□□□ 0.32
AVT3P36062 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.08■□□□□ 0.32
AVT3P36062 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.08■□□□□ 0.32
AVT3P36062 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.08■□□□□ 0.32
AVT3P36062 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.08■□□□□ 0.32
AVT3P36062 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.08■□□□□ 0.32
AVT3P36062 YJL118WYJL118W 660 nt17.01■□□□□ 0.31
AVT3P36062 YHM2YMR241W 945 nt16.94■□□□□ 0.3
AVT3P36062 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt16.93■□□□□ 0.3
AVT3P36062 YNR068CYNR068C 819 nt16.9■□□□□ 0.3
AVT3P36062 YMR057CYMR057C 372 nt16.89■□□□□ 0.29
AVT3P36062 Q0142Q0142 177 nt16.84■□□□□ 0.29
AVT3P36062 CCC1YLR220W 969 nt16.82■□□□□ 0.28
AVT3P36062 YPL168WYPL168W 1293 nt16.79■□□□□ 0.28
AVT3P36062 DBP2YNL112W 1641 nt16.78■□□□□ 0.28
AVT3P36062 SCR1SCR1 522 nt16.72■□□□□ 0.27
AVT3P36062 URE2YNL229C 1065 nt16.65■□□□□ 0.26
AVT3P36062 PET122YER153C 765 nt16.6■□□□□ 0.25
AVT3P36062 YJL107CYJL107C 1164 nt16.59■□□□□ 0.25
AVT3P36062 YJR154WYJR154W 1041 nt16.59■□□□□ 0.25
AVT3P36062 Q0255Q0255 1419 nt16.58■□□□□ 0.24
AVT3P36062 RSM23YGL129C 1353 nt16.49■□□□□ 0.23
AVT3P36062 AIR1YIL079C 1083 nt16.43■□□□□ 0.22
AVT3P36062 THP3YPR045C 1413 nt16.43■□□□□ 0.22
AVT3P36062 YOR169CYOR169C 465 nt16.42■□□□□ 0.22
AVT3P36062 YPL041CYPL041C 624 nt16.4■□□□□ 0.22
AVT3P36062 YGL188CYGL188C 174 nt16.39■□□□□ 0.21
AVT3P36062 PAB1YER165W 1734 nt16.39■□□□□ 0.21
AVT3P36062 COG1YGL223C 1254 nt16.38■□□□□ 0.21
AVT3P36062 FTH1YBR207W 1398 nt16.37■□□□□ 0.21
AVT3P36062 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.35■□□□□ 0.21
AVT3P36062 ATP6Q0085 780 nt16.34■□□□□ 0.21
AVT3P36062 STB1YNL309W 1263 nt16.33■□□□□ 0.2
AVT3P36062 Q0017Q0017 162 nt16.33■□□□□ 0.2
AVT3P36062 YEL074WYEL074W 339 nt16.32■□□□□ 0.2
AVT3P36062 FTR1YER145C 1215 nt16.31■□□□□ 0.2
AVT3P36062 RTC3YHR087W 336 nt16.27■□□□□ 0.2
AVT3P36062 LSM12YHR121W 564 nt16.25■□□□□ 0.19
AVT3P36062 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt16.25■□□□□ 0.19
AVT3P36062 KTR3YBR205W 1215 nt16.24■□□□□ 0.19
AVT3P36062 RRN5YLR141W 1092 nt16.21■□□□□ 0.19
AVT3P36062 NEM1YHR004C 1341 nt16.18■□□□□ 0.18
AVT3P36062 YGL118CYGL118C 438 nt16.17■□□□□ 0.18
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