Protein–RNA interactions for Protein: P05740

RPL17A, 60S ribosomal protein L17-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17AP05740 YGR139WYGR139W 339 nt20.96■□□□□ 0.95
RPL17AP05740 MOT3YMR070W 1473 nt19.41■□□□□ 0.7
RPL17AP05740 Q0182Q0182 405 nt19.21■□□□□ 0.67
RPL17AP05740 NME1NME1 340 nt19.12■□□□□ 0.65
RPL17AP05740 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.1■□□□□ 0.65
RPL17AP05740 VAR1Q0140 1197 nt19.06■□□□□ 0.64
RPL17AP05740 CSM2YIL132C 642 nt18.75■□□□□ 0.59
RPL17AP05740 NSR1YGR159C 1245 nt18.74■□□□□ 0.59
RPL17AP05740 NOP1YDL014W 984 nt18.73■□□□□ 0.59
RPL17AP05740 PAU21YOR394W 495 nt18.57■□□□□ 0.56
RPL17AP05740 PAU22YPL282C 495 nt18.57■□□□□ 0.56
RPL17AP05740 YDR509WYDR509W 348 nt18.45■□□□□ 0.54
RPL17AP05740 ARO7YPR060C 771 nt18.36■□□□□ 0.53
RPL17AP05740 PAM17YKR065C 594 nt18.27■□□□□ 0.52
RPL17AP05740 REG2YBR050C 1017 nt18■□□□□ 0.47
RPL17AP05740 BMT5YIL096C 1011 nt17.81■□□□□ 0.44
RPL17AP05740 BUR6YER159C 429 nt17.78■□□□□ 0.44
RPL17AP05740 Q0144Q0144 330 nt17.76■□□□□ 0.43
RPL17AP05740 YKL036CYKL036C 393 nt17.55■□□□□ 0.4
RPL17AP05740 SEM1YDR363W-A 270 nt17.54■□□□□ 0.4
RPL17AP05740 Q0010Q0010 387 nt17.52■□□□□ 0.4
RPL17AP05740 Q0142Q0142 177 nt17.41■□□□□ 0.38
RPL17AP05740 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt17.38■□□□□ 0.37
RPL17AP05740 Q0017Q0017 162 nt17.3■□□□□ 0.36
RPL17AP05740 SRN2YLR119W 642 nt17.29■□□□□ 0.36
RPL17AP05740 ARA2YMR041C 1008 nt16.98■□□□□ 0.31
RPL17AP05740 AI3Q0060 1248 nt16.97■□□□□ 0.31
RPL17AP05740 YCR099CYCR099C 468 nt16.91■□□□□ 0.3
RPL17AP05740 ARP10YDR106W 855 nt16.87■□□□□ 0.29
RPL17AP05740 Q0255Q0255 1419 nt16.81■□□□□ 0.28
RPL17AP05740 AI5_BETAQ0075 1065 nt16.74■□□□□ 0.27
RPL17AP05740 YOR169CYOR169C 465 nt16.73■□□□□ 0.27
RPL17AP05740 YLR122CYLR122C 378 nt16.71■□□□□ 0.27
RPL17AP05740 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt16.68■□□□□ 0.26
RPL17AP05740 YGL188CYGL188C 174 nt16.67■□□□□ 0.26
RPL17AP05740 PET20YPL159C 762 nt16.61■□□□□ 0.25
RPL17AP05740 ABZ2YMR289W 1125 nt16.56■□□□□ 0.24
RPL17AP05740 Q0297Q0297 156 nt16.48■□□□□ 0.23
RPL17AP05740 UTP6YDR449C 1323 nt16.44■□□□□ 0.22
RPL17AP05740 YJL027CYJL027C 417 nt16.42■□□□□ 0.22
RPL17AP05740 snR78snR78 87 nt16.41■□□□□ 0.22
RPL17AP05740 ATP6Q0085 780 nt16.37■□□□□ 0.21
RPL17AP05740 SRX1YKL086W 384 nt16.35■□□□□ 0.21
RPL17AP05740 YNR068CYNR068C 819 nt16.35■□□□□ 0.21
RPL17AP05740 SKG1YKR100C 1068 nt16.32■□□□□ 0.2
RPL17AP05740 MDJ1YFL016C 1536 nt16.31■□□□□ 0.2
RPL17AP05740 AIR1YIL079C 1083 nt16.31■□□□□ 0.2
RPL17AP05740 YPL168WYPL168W 1293 nt16.3■□□□□ 0.2
RPL17AP05740 TOM20YGR082W 552 nt16.23■□□□□ 0.19
RPL17AP05740 MET8YBR213W 825 nt16.18■□□□□ 0.18
RPL17AP05740 SCS3YGL126W 1143 nt16.1■□□□□ 0.17
RPL17AP05740 KTR3YBR205W 1215 nt16.05■□□□□ 0.16
RPL17AP05740 LCP5YER127W 1074 nt16.04■□□□□ 0.16
RPL17AP05740 CLB6YGR109C 1143 nt16.02■□□□□ 0.16
RPL17AP05740 YPL071CYPL071C 471 nt16.02■□□□□ 0.16
RPL17AP05740 HMT1YBR034C 1047 nt16.01■□□□□ 0.15
RPL17AP05740 NEM1YHR004C 1341 nt15.91■□□□□ 0.14
RPL17AP05740 URH1YDR400W 1023 nt15.9■□□□□ 0.14
RPL17AP05740 URE2YNL229C 1065 nt15.88■□□□□ 0.13
RPL17AP05740 SCJ1YMR214W 1134 nt15.75■□□□□ 0.11
RPL17AP05740 PHO92YDR374C 921 nt15.73■□□□□ 0.11
RPL17AP05740 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt15.68■□□□□ 0.1
RPL17AP05740 YHL044WYHL044W 708 nt15.66■□□□□ 0.1
RPL17AP05740 STD1YOR047C 1335 nt15.66■□□□□ 0.1
RPL17AP05740 AST1YBL069W 1290 nt15.62■□□□□ 0.09
RPL17AP05740 FTR1YER145C 1215 nt15.61■□□□□ 0.09
RPL17AP05740 YHM2YMR241W 945 nt15.54■□□□□ 0.08
RPL17AP05740 PEX27YOR193W 1131 nt15.54■□□□□ 0.08
RPL17AP05740 YCR051WYCR051W 669 nt15.52■□□□□ 0.08
RPL17AP05740 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt15.52■□□□□ 0.08
RPL17AP05740 YMR057CYMR057C 372 nt15.51■□□□□ 0.07
RPL17AP05740 YJL107CYJL107C 1164 nt15.49■□□□□ 0.07
RPL17AP05740 YJL118WYJL118W 660 nt15.49■□□□□ 0.07
RPL17AP05740 LSM12YHR121W 564 nt15.47■□□□□ 0.07
RPL17AP05740 YEL074WYEL074W 339 nt15.45■□□□□ 0.06
RPL17AP05740 THP3YPR045C 1413 nt15.43■□□□□ 0.06
RPL17AP05740 FAR3YMR052W 615 nt15.39■□□□□ 0.05
RPL17AP05740 GTT3YEL017W 1014 nt15.33■□□□□ 0.04
RPL17AP05740 YLR036CYLR036C 612 nt15.33■□□□□ 0.04
RPL17AP05740 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt15.33■□□□□ 0.04
RPL17AP05740 RSM23YGL129C 1353 nt15.33■□□□□ 0.04
RPL17AP05740 MPS2YGL075C 1164 nt15.27■□□□□ 0.04
RPL17AP05740 YML079WYML079W 606 nt15.18■□□□□ 0.02
RPL17AP05740 YOL085CYOL085C 342 nt15.18■□□□□ 0.02
RPL17AP05740 MOD5YOR274W 1287 nt15.18■□□□□ 0.02
RPL17AP05740 YGL118CYGL118C 438 nt15.17■□□□□ 0.02
RPL17AP05740 ARC19YKL013C 516 nt15.17■□□□□ 0.02
RPL17AP05740 COX3Q0275 810 nt15.16■□□□□ 0.02
RPL17AP05740 MPC1YGL080W 393 nt15.15■□□□□ 0.02
RPL17AP05740 UBC12YLR306W 567 nt15.15■□□□□ 0.02
RPL17AP05740 RPM1RPM1 483 nt15.15■□□□□ 0.02
RPL17AP05740 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt15.07■□□□□ 0
RPL17AP05740 RUF21RUF21 707 nt15.05■□□□□ -0
RPL17AP05740 ARP6YLR085C 1317 nt15.05■□□□□ -0
RPL17AP05740 YHP1YDR451C 1062 nt15.04■□□□□ -0
RPL17AP05740 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt15.02■□□□□ -0
RPL17AP05740 PUS9YDL036C 1389 nt15□□□□□ -0.01
RPL17AP05740 YNL040WYNL040W 1371 nt15□□□□□ -0.01
RPL17AP05740 VPS28YPL065W 729 nt15□□□□□ -0.01
RPL17AP05740 YPR1YDR368W 939 nt14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms