Protein–RNA interactions for Protein: P53009

SCY1, Protein kinase-like protein SCY1, yeastyeast

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCY1P53009 YGR139WYGR139W 339 nt18.52■□□□□ 0.56
SCY1P53009 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.92■□□□□ 0.46
SCY1P53009 VAR1Q0140 1197 nt17.86■□□□□ 0.45
SCY1P53009 NSR1YGR159C 1245 nt17.81■□□□□ 0.44
SCY1P53009 NOP1YDL014W 984 nt17.48■□□□□ 0.39
SCY1P53009 YDR509WYDR509W 348 nt16.82■□□□□ 0.28
SCY1P53009 NME1NME1 340 nt16.51■□□□□ 0.23
SCY1P53009 CSM2YIL132C 642 nt16.43■□□□□ 0.22
SCY1P53009 PAU21YOR394W 495 nt16.34■□□□□ 0.21
SCY1P53009 PAU22YPL282C 495 nt16.34■□□□□ 0.21
SCY1P53009 Q0017Q0017 162 nt16.34■□□□□ 0.21
SCY1P53009 PAM17YKR065C 594 nt16.27■□□□□ 0.2
SCY1P53009 MOT3YMR070W 1473 nt16.26■□□□□ 0.19
SCY1P53009 Q0142Q0142 177 nt16.23■□□□□ 0.19
SCY1P53009 ARO7YPR060C 771 nt16.15■□□□□ 0.18
SCY1P53009 Q0144Q0144 330 nt16.1■□□□□ 0.17
SCY1P53009 YKL036CYKL036C 393 nt16.08■□□□□ 0.16
SCY1P53009 Q0182Q0182 405 nt15.99■□□□□ 0.15
SCY1P53009 BMT5YIL096C 1011 nt15.92■□□□□ 0.14
SCY1P53009 REG2YBR050C 1017 nt15.91■□□□□ 0.14
SCY1P53009 BUR6YER159C 429 nt15.83■□□□□ 0.12
SCY1P53009 SEM1YDR363W-A 270 nt15.82■□□□□ 0.12
SCY1P53009 MDJ1YFL016C 1536 nt15.76■□□□□ 0.11
SCY1P53009 Q0255Q0255 1419 nt15.54■□□□□ 0.08
SCY1P53009 Q0010Q0010 387 nt15.52■□□□□ 0.08
SCY1P53009 YOR169CYOR169C 465 nt15.47■□□□□ 0.07
SCY1P53009 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt15.46■□□□□ 0.07
SCY1P53009 AI3Q0060 1248 nt15.39■□□□□ 0.05
SCY1P53009 YGL188CYGL188C 174 nt15.38■□□□□ 0.05
SCY1P53009 SRN2YLR119W 642 nt15.37■□□□□ 0.05
SCY1P53009 AI5_BETAQ0075 1065 nt15.32■□□□□ 0.04
SCY1P53009 YCR099CYCR099C 468 nt15.24■□□□□ 0.03
SCY1P53009 Q0297Q0297 156 nt15.22■□□□□ 0.03
SCY1P53009 SRX1YKL086W 384 nt15.21■□□□□ 0.03
SCY1P53009 ARP10YDR106W 855 nt15.04■□□□□ -0
SCY1P53009 ATP6Q0085 780 nt15.02■□□□□ -0
SCY1P53009 YJL027CYJL027C 417 nt15.02■□□□□ -0
SCY1P53009 AIR1YIL079C 1083 nt14.9□□□□□ -0.02
SCY1P53009 ARA2YMR041C 1008 nt14.89□□□□□ -0.03
SCY1P53009 PET20YPL159C 762 nt14.87□□□□□ -0.03
SCY1P53009 YNR068CYNR068C 819 nt14.66□□□□□ -0.06
SCY1P53009 snR78snR78 87 nt14.65□□□□□ -0.06
SCY1P53009 YPL168WYPL168W 1293 nt14.63□□□□□ -0.07
SCY1P53009 YLR122CYLR122C 378 nt14.6□□□□□ -0.07
SCY1P53009 SCS3YGL126W 1143 nt14.58□□□□□ -0.08
SCY1P53009 KTR3YBR205W 1215 nt14.57□□□□□ -0.08
SCY1P53009 UTP6YDR449C 1323 nt14.55□□□□□ -0.08
SCY1P53009 ABZ2YMR289W 1125 nt14.53□□□□□ -0.08
SCY1P53009 SKG1YKR100C 1068 nt14.52□□□□□ -0.09
SCY1P53009 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt14.5□□□□□ -0.09
SCY1P53009 YCR051WYCR051W 669 nt14.46□□□□□ -0.09
SCY1P53009 NEM1YHR004C 1341 nt14.41□□□□□ -0.1
SCY1P53009 PHO92YDR374C 921 nt14.4□□□□□ -0.1
SCY1P53009 YHL044WYHL044W 708 nt14.29□□□□□ -0.12
SCY1P53009 AST1YBL069W 1290 nt14.21□□□□□ -0.13
SCY1P53009 SCJ1YMR214W 1134 nt14.19□□□□□ -0.14
SCY1P53009 TOM20YGR082W 552 nt14.15□□□□□ -0.14
SCY1P53009 URE2YNL229C 1065 nt14.14□□□□□ -0.15
SCY1P53009 STD1YOR047C 1335 nt14.13□□□□□ -0.15
SCY1P53009 RPM1RPM1 483 nt14.12□□□□□ -0.15
SCY1P53009 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt14.12□□□□□ -0.15
SCY1P53009 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt14.09□□□□□ -0.15
SCY1P53009 YPL071CYPL071C 471 nt14.09□□□□□ -0.15
SCY1P53009 PEX27YOR193W 1131 nt14.06□□□□□ -0.16
SCY1P53009 HMT1YBR034C 1047 nt14.04□□□□□ -0.16
SCY1P53009 SSA3YBL075C 1950 nt14.03□□□□□ -0.16
SCY1P53009 FAR3YMR052W 615 nt14.01□□□□□ -0.17
SCY1P53009 YDR008CYDR008C 351 nt13.98□□□□□ -0.17
SCY1P53009 GTT3YEL017W 1014 nt13.92□□□□□ -0.18
SCY1P53009 FTR1YER145C 1215 nt13.91□□□□□ -0.18
SCY1P53009 LCP5YER127W 1074 nt13.9□□□□□ -0.18
SCY1P53009 YOL085CYOL085C 342 nt13.89□□□□□ -0.19
SCY1P53009 DBP2YNL112W 1641 nt13.89□□□□□ -0.19
SCY1P53009 MET8YBR213W 825 nt13.82□□□□□ -0.2
SCY1P53009 PUS9YDL036C 1389 nt13.8□□□□□ -0.2
SCY1P53009 URH1YDR400W 1023 nt13.78□□□□□ -0.2
SCY1P53009 LSM12YHR121W 564 nt13.76□□□□□ -0.21
SCY1P53009 HAS1YMR290C 1518 nt13.74□□□□□ -0.21
SCY1P53009 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SCY1P53009 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SCY1P53009 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SCY1P53009 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SCY1P53009 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SCY1P53009 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SCY1P53009 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SCY1P53009 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SCY1P53009 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SCY1P53009 MPS2YGL075C 1164 nt13.71□□□□□ -0.21
SCY1P53009 YLR036CYLR036C 612 nt13.71□□□□□ -0.21
SCY1P53009 IRC14YOR135C 342 nt13.71□□□□□ -0.21
SCY1P53009 CLB6YGR109C 1143 nt13.69□□□□□ -0.22
SCY1P53009 RPP1BYDL130W 321 nt13.68□□□□□ -0.22
SCY1P53009 YEL074WYEL074W 339 nt13.68□□□□□ -0.22
SCY1P53009 PKP1YIL042C 1185 nt13.66□□□□□ -0.22
SCY1P53009 YJL107CYJL107C 1164 nt13.65□□□□□ -0.22
SCY1P53009 CCC1YLR220W 969 nt13.63□□□□□ -0.23
SCY1P53009 THP3YPR045C 1413 nt13.61□□□□□ -0.23
SCY1P53009 SKI6YGR195W 741 nt13.6□□□□□ -0.23
SCY1P53009 ARC19YKL013C 516 nt13.59□□□□□ -0.23
SCY1P53009 CUS2YNL286W 858 nt13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.4 ms