Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.36■■□□□ 1.01
SSP1P38871 NSR1YGR159C 1245 nt21.11■□□□□ 0.97
SSP1P38871 NOP1YDL014W 984 nt20.87■□□□□ 0.93
SSP1P38871 YKL036CYKL036C 393 nt19.35■□□□□ 0.69
SSP1P38871 Q0182Q0182 405 nt19.24■□□□□ 0.67
SSP1P38871 MOT3YMR070W 1473 nt19.19■□□□□ 0.66
SSP1P38871 MDJ1YFL016C 1536 nt18.9■□□□□ 0.62
SSP1P38871 YGR139WYGR139W 339 nt18.5■□□□□ 0.55
SSP1P38871 Q0297Q0297 156 nt18.27■□□□□ 0.52
SSP1P38871 SRX1YKL086W 384 nt18.19■□□□□ 0.5
SSP1P38871 YJL027CYJL027C 417 nt18.1■□□□□ 0.49
SSP1P38871 NME1NME1 340 nt17.78■□□□□ 0.44
SSP1P38871 SCS3YGL126W 1143 nt17.66■□□□□ 0.42
SSP1P38871 YCR051WYCR051W 669 nt17.28■□□□□ 0.36
SSP1P38871 CSM2YIL132C 642 nt16.87■□□□□ 0.29
SSP1P38871 YOL085CYOL085C 342 nt16.73■□□□□ 0.27
SSP1P38871 DBP2YNL112W 1641 nt16.62■□□□□ 0.25
SSP1P38871 PAU21YOR394W 495 nt16.51■□□□□ 0.23
SSP1P38871 PAU22YPL282C 495 nt16.51■□□□□ 0.23
SSP1P38871 PKP1YIL042C 1185 nt16.45■□□□□ 0.22
SSP1P38871 RPP1BYDL130W 321 nt16.4■□□□□ 0.22
SSP1P38871 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.35■□□□□ 0.21
SSP1P38871 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.35■□□□□ 0.21
SSP1P38871 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.35■□□□□ 0.21
SSP1P38871 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.35■□□□□ 0.21
SSP1P38871 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.35■□□□□ 0.21
SSP1P38871 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.35■□□□□ 0.21
SSP1P38871 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.35■□□□□ 0.21
SSP1P38871 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.35■□□□□ 0.21
SSP1P38871 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.35■□□□□ 0.21
SSP1P38871 ARO7YPR060C 771 nt16.33■□□□□ 0.2
SSP1P38871 YBR190WYBR190W 312 nt16.22■□□□□ 0.19
SSP1P38871 CCC1YLR220W 969 nt16.2■□□□□ 0.18
SSP1P38871 REG2YBR050C 1017 nt15.87■□□□□ 0.13
SSP1P38871 PAM17YKR065C 594 nt15.86■□□□□ 0.13
SSP1P38871 SCJ1YMR214W 1134 nt15.86■□□□□ 0.13
SSP1P38871 ATS1YAL020C 1002 nt15.83■□□□□ 0.12
SSP1P38871 RTC3YHR087W 336 nt15.79■□□□□ 0.12
SSP1P38871 PET122YER153C 765 nt15.63■□□□□ 0.09
SSP1P38871 RVS167YDR388W 1449 nt15.61■□□□□ 0.09
SSP1P38871 SCR1SCR1 522 nt15.57■□□□□ 0.08
SSP1P38871 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.51■□□□□ 0.07
SSP1P38871 BUR6YER159C 429 nt15.4■□□□□ 0.06
SSP1P38871 MET8YBR213W 825 nt15.35■□□□□ 0.05
SSP1P38871 Q0010Q0010 387 nt15.34■□□□□ 0.05
SSP1P38871 BMT5YIL096C 1011 nt15.26■□□□□ 0.03
SSP1P38871 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt15.25■□□□□ 0.03
SSP1P38871 ARA2YMR041C 1008 nt15.24■□□□□ 0.03
SSP1P38871 CLB6YGR109C 1143 nt15.22■□□□□ 0.03
SSP1P38871 RRN5YLR141W 1092 nt15.19■□□□□ 0.02
SSP1P38871 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt15.08■□□□□ 0
SSP1P38871 YLR122CYLR122C 378 nt15.08■□□□□ 0
SSP1P38871 SHR5YOL110W 714 nt15.06■□□□□ 0
SSP1P38871 YDR509WYDR509W 348 nt15.05■□□□□ -0
SSP1P38871 SRN2YLR119W 642 nt15.04■□□□□ -0
SSP1P38871 YDJ1YNL064C 1230 nt15.03■□□□□ -0
SSP1P38871 PUT4YOR348C 1884 nt15□□□□□ -0.01
SSP1P38871 RSB1YOR049C 1065 nt14.95□□□□□ -0.02
SSP1P38871 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.89□□□□□ -0.03
SSP1P38871 ABZ2YMR289W 1125 nt14.87□□□□□ -0.03
SSP1P38871 SSA3YBL075C 1950 nt14.8□□□□□ -0.04
SSP1P38871 TOM20YGR082W 552 nt14.75□□□□□ -0.05
SSP1P38871 SEM1YDR363W-A 270 nt14.73□□□□□ -0.05
SSP1P38871 LCP5YER127W 1074 nt14.72□□□□□ -0.05
SSP1P38871 Q0144Q0144 330 nt14.72□□□□□ -0.05
SSP1P38871 URN1YPR152C 1398 nt14.69□□□□□ -0.06
SSP1P38871 GAR1YHR089C 618 nt14.66□□□□□ -0.06
SSP1P38871 URH1YDR400W 1023 nt14.64□□□□□ -0.07
SSP1P38871 PST2YDR032C 597 nt14.63□□□□□ -0.07
SSP1P38871 ARE1YCR048W 1833 nt14.62□□□□□ -0.07
SSP1P38871 ARP10YDR106W 855 nt14.59□□□□□ -0.07
SSP1P38871 OPI9YLR338W 858 nt14.57□□□□□ -0.08
SSP1P38871 DEP1YAL013W 1218 nt14.56□□□□□ -0.08
SSP1P38871 SAH1YER043C 1350 nt14.55□□□□□ -0.08
SSP1P38871 AI5_BETAQ0075 1065 nt14.51□□□□□ -0.09
SSP1P38871 POA1YBR022W 534 nt14.48□□□□□ -0.09
SSP1P38871 RPN10YHR200W 807 nt14.43□□□□□ -0.1
SSP1P38871 VAR1Q0140 1197 nt14.42□□□□□ -0.1
SSP1P38871 UTP6YDR449C 1323 nt14.41□□□□□ -0.1
SSP1P38871 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.41□□□□□ -0.1
SSP1P38871 YNL208WYNL208W 600 nt14.39□□□□□ -0.11
SSP1P38871 HMT1YBR034C 1047 nt14.35□□□□□ -0.11
SSP1P38871 YJL118WYJL118W 660 nt14.33□□□□□ -0.12
SSP1P38871 YPL071CYPL071C 471 nt14.25□□□□□ -0.13
SSP1P38871 BSC6YOL137W 1494 nt14.24□□□□□ -0.13
SSP1P38871 YCR099CYCR099C 468 nt14.21□□□□□ -0.13
SSP1P38871 PET20YPL159C 762 nt14.21□□□□□ -0.13
SSP1P38871 YMR057CYMR057C 372 nt14.2□□□□□ -0.14
SSP1P38871 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt14.19□□□□□ -0.14
SSP1P38871 SKG1YKR100C 1068 nt14.18□□□□□ -0.14
SSP1P38871 TIR1YER011W 765 nt14.17□□□□□ -0.14
SSP1P38871 YKL097CYKL097C 411 nt14.17□□□□□ -0.14
SSP1P38871 YJR154WYJR154W 1041 nt14.16□□□□□ -0.14
SSP1P38871 YHM2YMR241W 945 nt14.16□□□□□ -0.14
SSP1P38871 SSA1YAL005C 1929 nt14.13□□□□□ -0.15
SSP1P38871 PUN1YLR414C 792 nt14.13□□□□□ -0.15
SSP1P38871 snR78snR78 87 nt14.12□□□□□ -0.15
SSP1P38871 AI3Q0060 1248 nt14.04□□□□□ -0.16
SSP1P38871 BUD23YCR047C 828 nt14.02□□□□□ -0.17
SSP1P38871 PTC2YER089C 1395 nt14□□□□□ -0.17
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