Protein–RNA interactions for Protein: Q12386

ARP8, Actin-like protein ARP8, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 881 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP8Q12386 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.07■■□□□ 1.28
ARP8Q12386 NSR1YGR159C 1245 nt22.95■■□□□ 1.26
ARP8Q12386 NOP1YDL014W 984 nt22.7■■□□□ 1.22
ARP8Q12386 YKL036CYKL036C 393 nt21.46■■□□□ 1.03
ARP8Q12386 MDJ1YFL016C 1536 nt20.6■□□□□ 0.89
ARP8Q12386 YJL027CYJL027C 417 nt20.15■□□□□ 0.82
ARP8Q12386 Q0297Q0297 156 nt19.99■□□□□ 0.79
ARP8Q12386 SCS3YGL126W 1143 nt19.78■□□□□ 0.76
ARP8Q12386 SRX1YKL086W 384 nt19.77■□□□□ 0.76
ARP8Q12386 YCR051WYCR051W 669 nt18.81■□□□□ 0.6
ARP8Q12386 Q0182Q0182 405 nt18.76■□□□□ 0.59
ARP8Q12386 MOT3YMR070W 1473 nt18.62■□□□□ 0.57
ARP8Q12386 YOL085CYOL085C 342 nt18.5■□□□□ 0.55
ARP8Q12386 SCJ1YMR214W 1134 nt18.39■□□□□ 0.53
ARP8Q12386 YGR139WYGR139W 339 nt18.33■□□□□ 0.52
ARP8Q12386 DBP2YNL112W 1641 nt18.2■□□□□ 0.5
ARP8Q12386 PKP1YIL042C 1185 nt18.12■□□□□ 0.49
ARP8Q12386 RPP1BYDL130W 321 nt17.95■□□□□ 0.46
ARP8Q12386 ATS1YAL020C 1002 nt17.87■□□□□ 0.45
ARP8Q12386 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.75■□□□□ 0.43
ARP8Q12386 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.75■□□□□ 0.43
ARP8Q12386 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.75■□□□□ 0.43
ARP8Q12386 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.75■□□□□ 0.43
ARP8Q12386 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.75■□□□□ 0.43
ARP8Q12386 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.75■□□□□ 0.43
ARP8Q12386 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.75■□□□□ 0.43
ARP8Q12386 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.75■□□□□ 0.43
ARP8Q12386 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.75■□□□□ 0.43
ARP8Q12386 CCC1YLR220W 969 nt17.59■□□□□ 0.41
ARP8Q12386 NME1NME1 340 nt17.5■□□□□ 0.39
ARP8Q12386 YBR190WYBR190W 312 nt17.5■□□□□ 0.39
ARP8Q12386 SCR1SCR1 522 nt17.14■□□□□ 0.33
ARP8Q12386 RTC3YHR087W 336 nt17.12■□□□□ 0.33
ARP8Q12386 PET122YER153C 765 nt17.02■□□□□ 0.32
ARP8Q12386 RVS167YDR388W 1449 nt16.95■□□□□ 0.3
ARP8Q12386 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.76■□□□□ 0.27
ARP8Q12386 CSM2YIL132C 642 nt16.63■□□□□ 0.25
ARP8Q12386 RRN5YLR141W 1092 nt16.59■□□□□ 0.25
ARP8Q12386 RSB1YOR049C 1065 nt16.5■□□□□ 0.23
ARP8Q12386 PST2YDR032C 597 nt16.41■□□□□ 0.22
ARP8Q12386 SHR5YOL110W 714 nt16.38■□□□□ 0.21
ARP8Q12386 PAU21YOR394W 495 nt16.3■□□□□ 0.2 RIP-Chip
ARP8Q12386 PAU22YPL282C 495 nt16.3■□□□□ 0.2 RIP-Chip
ARP8Q12386 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.27■□□□□ 0.2
ARP8Q12386 YDJ1YNL064C 1230 nt16.22■□□□□ 0.19
ARP8Q12386 YKL097CYKL097C 411 nt16.17■□□□□ 0.18
ARP8Q12386 ARO7YPR060C 771 nt16.13■□□□□ 0.17
ARP8Q12386 PUT4YOR348C 1884 nt16.05■□□□□ 0.16
ARP8Q12386 URN1YPR152C 1398 nt16.02■□□□□ 0.16
ARP8Q12386 DEP1YAL013W 1218 nt16.02■□□□□ 0.16
ARP8Q12386 GAR1YHR089C 618 nt15.88■□□□□ 0.13
ARP8Q12386 OPI9YLR338W 858 nt15.78■□□□□ 0.12
ARP8Q12386 SAH1YER043C 1350 nt15.76■□□□□ 0.11
ARP8Q12386 PAM17YKR065C 594 nt15.75■□□□□ 0.11
ARP8Q12386 ARE1YCR048W 1833 nt15.73■□□□□ 0.11
ARP8Q12386 REG2YBR050C 1017 nt15.73■□□□□ 0.11
ARP8Q12386 YNL208WYNL208W 600 nt15.67■□□□□ 0.1
ARP8Q12386 RPN10YHR200W 807 nt15.66■□□□□ 0.1
ARP8Q12386 SHU1YHL006C 453 nt15.59■□□□□ 0.09
ARP8Q12386 POA1YBR022W 534 nt15.53■□□□□ 0.08
ARP8Q12386 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.51■□□□□ 0.07
ARP8Q12386 TIR1YER011W 765 nt15.34■□□□□ 0.05
ARP8Q12386 YOR139CYOR139C 393 nt15.29■□□□□ 0.04
ARP8Q12386 BUR6YER159C 429 nt15.28■□□□□ 0.04
ARP8Q12386 PUN1YLR414C 792 nt15.28■□□□□ 0.04
ARP8Q12386 YJR018WYJR018W 363 nt15.25■□□□□ 0.03
ARP8Q12386 SSA1YAL005C 1929 nt15.22■□□□□ 0.03
ARP8Q12386 BSC6YOL137W 1494 nt15.2■□□□□ 0.02
ARP8Q12386 SSA3YBL075C 1950 nt15.19■□□□□ 0.02
ARP8Q12386 PTC2YER089C 1395 nt15.17■□□□□ 0.02
ARP8Q12386 NPL3YDR432W 1245 nt15.17■□□□□ 0.02
ARP8Q12386 BMT5YIL096C 1011 nt15.15■□□□□ 0.02
ARP8Q12386 BUD23YCR047C 828 nt15.14■□□□□ 0.01
ARP8Q12386 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.13■□□□□ 0.01
ARP8Q12386 Q0010Q0010 387 nt15.13■□□□□ 0.01
ARP8Q12386 MET8YBR213W 825 nt15.1■□□□□ 0.01
ARP8Q12386 YJR120WYJR120W 351 nt15.08■□□□□ 0
ARP8Q12386 SRB2YHR041C 633 nt15.03■□□□□ -0
ARP8Q12386 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt15.02■□□□□ -0
ARP8Q12386 ARA2YMR041C 1008 nt15.02■□□□□ -0
ARP8Q12386 YDR509WYDR509W 348 nt14.98□□□□□ -0.01
ARP8Q12386 NAB2YGL122C 1578 nt14.96□□□□□ -0.01
ARP8Q12386 CLB6YGR109C 1143 nt14.9□□□□□ -0.02
ARP8Q12386 SRN2YLR119W 642 nt14.9□□□□□ -0.02
ARP8Q12386 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt14.89□□□□□ -0.03
ARP8Q12386 YLR122CYLR122C 378 nt14.88□□□□□ -0.03
ARP8Q12386 RPP2BYDR382W 333 nt14.86□□□□□ -0.03
ARP8Q12386 YGR021WYGR021W 873 nt14.81□□□□□ -0.04
ARP8Q12386 FIS1YIL065C 468 nt14.8□□□□□ -0.04
ARP8Q12386 YOL037CYOL037C 354 nt14.8□□□□□ -0.04
ARP8Q12386 DAL1YIR027C 1383 nt14.75□□□□□ -0.05
ARP8Q12386 FPR4YLR449W 1179 nt14.74□□□□□ -0.05
ARP8Q12386 ABZ2YMR289W 1125 nt14.74□□□□□ -0.05
ARP8Q12386 Q0144Q0144 330 nt14.71□□□□□ -0.05
ARP8Q12386 HOM6YJR139C 1080 nt14.69□□□□□ -0.06
ARP8Q12386 WWM1YFL010C 636 nt14.68□□□□□ -0.06
ARP8Q12386 MNP1YGL068W 585 nt14.68□□□□□ -0.06
ARP8Q12386 INM2YDR287W 879 nt14.67□□□□□ -0.06
ARP8Q12386 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.67□□□□□ -0.06
ARP8Q12386 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.67□□□□□ -0.06
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