Protein–RNA interactions for Protein: Q12094

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TSR3Q12094 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.52■■□□□ 1.36
TSR3Q12094 NSR1YGR159C 1245 nt23.49■■□□□ 1.35
TSR3Q12094 NOP1YDL014W 984 nt22.7■■□□□ 1.22
TSR3Q12094 VAR1Q0140 1197 nt21.2■□□□□ 0.98
TSR3Q12094 MDJ1YFL016C 1536 nt21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q12094 YGR139WYGR139W 339 nt21.02■□□□□ 0.96
TSR3Q12094 YKL036CYKL036C 393 nt20.85■□□□□ 0.93
TSR3Q12094 Q0297Q0297 156 nt19.91■□□□□ 0.78
TSR3Q12094 SRX1YKL086W 384 nt19.91■□□□□ 0.78
TSR3Q12094 YDR509WYDR509W 348 nt19.6■□□□□ 0.73
TSR3Q12094 Q0017Q0017 162 nt19.51■□□□□ 0.71
TSR3Q12094 YJL027CYJL027C 417 nt19.41■□□□□ 0.7
TSR3Q12094 Q0142Q0142 177 nt19.2■□□□□ 0.66
TSR3Q12094 SCS3YGL126W 1143 nt18.97■□□□□ 0.63
TSR3Q12094 YCR051WYCR051W 669 nt18.84■□□□□ 0.61
TSR3Q12094 DBP2YNL112W 1641 nt18.68■□□□□ 0.58
TSR3Q12094 Q0144Q0144 330 nt18.63■□□□□ 0.57
TSR3Q12094 PAM17YKR065C 594 nt18.58■□□□□ 0.56
TSR3Q12094 CSM2YIL132C 642 nt18.56■□□□□ 0.56
TSR3Q12094 PAU21YOR394W 495 nt18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q12094 PAU22YPL282C 495 nt18.53■□□□□ 0.56
TSR3Q12094 NME1NME1 340 nt18.4■□□□□ 0.54
TSR3Q12094 ARO7YPR060C 771 nt18.3■□□□□ 0.52
TSR3Q12094 Q0255Q0255 1419 nt18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q12094 SEM1YDR363W-A 270 nt18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q12094 BMT5YIL096C 1011 nt18.27■□□□□ 0.52
TSR3Q12094 YOR169CYOR169C 465 nt18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q12094 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.17■□□□□ 0.5
TSR3Q12094 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.17■□□□□ 0.5
TSR3Q12094 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.17■□□□□ 0.5
TSR3Q12094 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.17■□□□□ 0.5
TSR3Q12094 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.17■□□□□ 0.5
TSR3Q12094 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.17■□□□□ 0.5
TSR3Q12094 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.17■□□□□ 0.5
TSR3Q12094 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.17■□□□□ 0.5
TSR3Q12094 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.17■□□□□ 0.5
TSR3Q12094 YOL085CYOL085C 342 nt18.12■□□□□ 0.49
TSR3Q12094 BUR6YER159C 429 nt18.1■□□□□ 0.49
TSR3Q12094 REG2YBR050C 1017 nt18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q12094 YGL188CYGL188C 174 nt18.06■□□□□ 0.48
TSR3Q12094 YBR190WYBR190W 312 nt17.98■□□□□ 0.47
TSR3Q12094 CCC1YLR220W 969 nt17.89■□□□□ 0.45
TSR3Q12094 PKP1YIL042C 1185 nt17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q12094 RPP1BYDL130W 321 nt17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q12094 AI3Q0060 1248 nt17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q12094 AI5_BETAQ0075 1065 nt17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q12094 MOT3YMR070W 1473 nt17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q12094 Q0010Q0010 387 nt17.7■□□□□ 0.42
TSR3Q12094 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt17.67■□□□□ 0.42
TSR3Q12094 YCR099CYCR099C 468 nt17.6■□□□□ 0.41
TSR3Q12094 ATP6Q0085 780 nt17.58■□□□□ 0.4
TSR3Q12094 SRN2YLR119W 642 nt17.53■□□□□ 0.4
TSR3Q12094 RTC3YHR087W 336 nt17.51■□□□□ 0.39
TSR3Q12094 SCJ1YMR214W 1134 nt17.43■□□□□ 0.38
TSR3Q12094 AIR1YIL079C 1083 nt17.33■□□□□ 0.36
TSR3Q12094 RVS167YDR388W 1449 nt17.32■□□□□ 0.36
TSR3Q12094 Q0182Q0182 405 nt17.3■□□□□ 0.36
TSR3Q12094 ARP10YDR106W 855 nt17.19■□□□□ 0.34
TSR3Q12094 PET122YER153C 765 nt17.14■□□□□ 0.33
TSR3Q12094 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.09■□□□□ 0.33
TSR3Q12094 PET20YPL159C 762 nt17.06■□□□□ 0.32
TSR3Q12094 KTR3YBR205W 1215 nt16.89■□□□□ 0.29
TSR3Q12094 ATS1YAL020C 1002 nt16.87■□□□□ 0.29
TSR3Q12094 YPL168WYPL168W 1293 nt16.85■□□□□ 0.29
TSR3Q12094 YNR068CYNR068C 819 nt16.84■□□□□ 0.29
TSR3Q12094 ARA2YMR041C 1008 nt16.83■□□□□ 0.28
TSR3Q12094 PHO92YDR374C 921 nt16.8■□□□□ 0.28
TSR3Q12094 snR78snR78 87 nt16.78■□□□□ 0.28
TSR3Q12094 SHR5YOL110W 714 nt16.76■□□□□ 0.27
TSR3Q12094 SCR1SCR1 522 nt16.75■□□□□ 0.27
TSR3Q12094 NEM1YHR004C 1341 nt16.68■□□□□ 0.26
TSR3Q12094 RPM1RPM1 483 nt16.67■□□□□ 0.26
TSR3Q12094 YHL044WYHL044W 708 nt16.65■□□□□ 0.26
TSR3Q12094 URE2YNL229C 1065 nt16.65■□□□□ 0.26
TSR3Q12094 FAR3YMR052W 615 nt16.61■□□□□ 0.25
TSR3Q12094 SKG1YKR100C 1068 nt16.59■□□□□ 0.25
TSR3Q12094 UTP6YDR449C 1323 nt16.59■□□□□ 0.25
TSR3Q12094 YDR008CYDR008C 351 nt16.58■□□□□ 0.24
TSR3Q12094 RRN5YLR141W 1092 nt16.57■□□□□ 0.24
TSR3Q12094 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt16.57■□□□□ 0.24
TSR3Q12094 PUT4YOR348C 1884 nt16.56■□□□□ 0.24
TSR3Q12094 YDJ1YNL064C 1230 nt16.52■□□□□ 0.24
TSR3Q12094 AST1YBL069W 1290 nt16.49■□□□□ 0.23
TSR3Q12094 YLR122CYLR122C 378 nt16.47■□□□□ 0.23
TSR3Q12094 ABZ2YMR289W 1125 nt16.41■□□□□ 0.22
TSR3Q12094 URN1YPR152C 1398 nt16.39■□□□□ 0.21
TSR3Q12094 DEP1YAL013W 1218 nt16.35■□□□□ 0.21
TSR3Q12094 STD1YOR047C 1335 nt16.3■□□□□ 0.2
TSR3Q12094 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt16.28■□□□□ 0.2
TSR3Q12094 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.28■□□□□ 0.2
TSR3Q12094 PEX27YOR193W 1131 nt16.27■□□□□ 0.2
TSR3Q12094 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt16.25■□□□□ 0.19
TSR3Q12094 OPI9YLR338W 858 nt16.21■□□□□ 0.19
TSR3Q12094 ARE1YCR048W 1833 nt16.21■□□□□ 0.19
TSR3Q12094 SAH1YER043C 1350 nt16.17■□□□□ 0.18
TSR3Q12094 GAR1YHR089C 618 nt16.17■□□□□ 0.18
TSR3Q12094 PUS9YDL036C 1389 nt16.16■□□□□ 0.18
TSR3Q12094 RSB1YOR049C 1065 nt16.15■□□□□ 0.18
TSR3Q12094 GTT3YEL017W 1014 nt16.14■□□□□ 0.17
TSR3Q12094 HAS1YMR290C 1518 nt16.14■□□□□ 0.17
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