Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.59■■□□□ 1.21
NCR1Q12200 NSR1YGR159C 1245 nt22.32■■□□□ 1.16
NCR1Q12200 NOP1YDL014W 984 nt21.97■■□□□ 1.11
NCR1Q12200 YKL036CYKL036C 393 nt20.51■□□□□ 0.87
NCR1Q12200 MDJ1YFL016C 1536 nt19.71■□□□□ 0.75
NCR1Q12200 Q0297Q0297 156 nt19.41■□□□□ 0.7
NCR1Q12200 SRX1YKL086W 384 nt19.29■□□□□ 0.68
NCR1Q12200 YJL027CYJL027C 417 nt19.16■□□□□ 0.66
NCR1Q12200 SCS3YGL126W 1143 nt18.83■□□□□ 0.6
NCR1Q12200 YCR051WYCR051W 669 nt18.27■□□□□ 0.52
NCR1Q12200 YOL085CYOL085C 342 nt17.83■□□□□ 0.44
NCR1Q12200 DBP2YNL112W 1641 nt17.61■□□□□ 0.41
NCR1Q12200 PKP1YIL042C 1185 nt17.54■□□□□ 0.4
NCR1Q12200 RPP1BYDL130W 321 nt17.39■□□□□ 0.37
NCR1Q12200 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.37■□□□□ 0.37
NCR1Q12200 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.37■□□□□ 0.37
NCR1Q12200 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.37■□□□□ 0.37
NCR1Q12200 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.37■□□□□ 0.37
NCR1Q12200 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.37■□□□□ 0.37
NCR1Q12200 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.37■□□□□ 0.37
NCR1Q12200 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.37■□□□□ 0.37
NCR1Q12200 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.37■□□□□ 0.37
NCR1Q12200 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.37■□□□□ 0.37
NCR1Q12200 CCC1YLR220W 969 nt17.15■□□□□ 0.34
NCR1Q12200 ATS1YAL020C 1002 nt16.89■□□□□ 0.29
NCR1Q12200 SCJ1YMR214W 1134 nt16.84■□□□□ 0.29
NCR1Q12200 YBR190WYBR190W 312 nt16.7■□□□□ 0.26
NCR1Q12200 PET122YER153C 765 nt16.64■□□□□ 0.25
NCR1Q12200 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.48■□□□□ 0.23
NCR1Q12200 SCR1SCR1 522 nt16.36■□□□□ 0.21
NCR1Q12200 RVS167YDR388W 1449 nt16.34■□□□□ 0.21
NCR1Q12200 RTC3YHR087W 336 nt16.28■□□□□ 0.2
NCR1Q12200 RRN5YLR141W 1092 nt16.18■□□□□ 0.18
NCR1Q12200 YGR139WYGR139W 339 nt15.95■□□□□ 0.14
NCR1Q12200 YDJ1YNL064C 1230 nt15.92■□□□□ 0.14
NCR1Q12200 SHR5YOL110W 714 nt15.91■□□□□ 0.14
NCR1Q12200 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.87■□□□□ 0.13
NCR1Q12200 RSB1YOR049C 1065 nt15.82■□□□□ 0.12
NCR1Q12200 PST2YDR032C 597 nt15.66■□□□□ 0.1
NCR1Q12200 GAR1YHR089C 618 nt15.54■□□□□ 0.08
NCR1Q12200 VAR1Q0140 1197 nt15.44■□□□□ 0.06
NCR1Q12200 DEP1YAL013W 1218 nt15.44■□□□□ 0.06
NCR1Q12200 URN1YPR152C 1398 nt15.36■□□□□ 0.05
NCR1Q12200 YNL208WYNL208W 600 nt15.15■□□□□ 0.02
NCR1Q12200 PUT4YOR348C 1884 nt15.12■□□□□ 0.01
NCR1Q12200 OPI9YLR338W 858 nt15.12■□□□□ 0.01
NCR1Q12200 RPN10YHR200W 807 nt15.05■□□□□ -0
NCR1Q12200 YKL097CYKL097C 411 nt15.02■□□□□ -0
NCR1Q12200 SAH1YER043C 1350 nt15.01□□□□□ -0.01
NCR1Q12200 TIR1YER011W 765 nt15.01□□□□□ -0.01
NCR1Q12200 SHU1YHL006C 453 nt14.98□□□□□ -0.01
NCR1Q12200 ARE1YCR048W 1833 nt14.92□□□□□ -0.02
NCR1Q12200 SSA1YAL005C 1929 nt14.88□□□□□ -0.03
NCR1Q12200 SRB2YHR041C 633 nt14.79□□□□□ -0.04
NCR1Q12200 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.7□□□□□ -0.06
NCR1Q12200 SSA3YBL075C 1950 nt14.69□□□□□ -0.06
NCR1Q12200 YJR018WYJR018W 363 nt14.66□□□□□ -0.06
NCR1Q12200 YJR120WYJR120W 351 nt14.66□□□□□ -0.06
NCR1Q12200 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.63□□□□□ -0.07
NCR1Q12200 PUN1YLR414C 792 nt14.62□□□□□ -0.07
NCR1Q12200 POA1YBR022W 534 nt14.62□□□□□ -0.07
NCR1Q12200 YOR139CYOR139C 393 nt14.54□□□□□ -0.08
NCR1Q12200 YDR509WYDR509W 348 nt14.48□□□□□ -0.09
NCR1Q12200 PTC2YER089C 1395 nt14.47□□□□□ -0.09
NCR1Q12200 WWM1YFL010C 636 nt14.43□□□□□ -0.1
NCR1Q12200 HOM6YJR139C 1080 nt14.36□□□□□ -0.11
NCR1Q12200 MNP1YGL068W 585 nt14.32□□□□□ -0.12
NCR1Q12200 RPP2BYDR382W 333 nt14.31□□□□□ -0.12
NCR1Q12200 YGR021WYGR021W 873 nt14.28□□□□□ -0.12
NCR1Q12200 BSC6YOL137W 1494 nt14.26□□□□□ -0.13
NCR1Q12200 BUD23YCR047C 828 nt14.26□□□□□ -0.13
NCR1Q12200 NAB2YGL122C 1578 nt14.22□□□□□ -0.13
NCR1Q12200 NPL3YDR432W 1245 nt14.19□□□□□ -0.14
NCR1Q12200 BDH2YAL061W 1254 nt14.16□□□□□ -0.14
NCR1Q12200 Q0017Q0017 162 nt14.16□□□□□ -0.14
NCR1Q12200 NME1NME1 340 nt14.15□□□□□ -0.14
NCR1Q12200 FIS1YIL065C 468 nt14.13□□□□□ -0.15
NCR1Q12200 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.12□□□□□ -0.15
NCR1Q12200 CSM2YIL132C 642 nt14.12□□□□□ -0.15
NCR1Q12200 RKM5YLR137W 1104 nt14.12□□□□□ -0.15
NCR1Q12200 INM2YDR287W 879 nt14.08□□□□□ -0.16
NCR1Q12200 DAL1YIR027C 1383 nt14.08□□□□□ -0.16
NCR1Q12200 PAM17YKR065C 594 nt14.05□□□□□ -0.16
NCR1Q12200 YOL037CYOL037C 354 nt14.05□□□□□ -0.16
NCR1Q12200 Q0142Q0142 177 nt14.03□□□□□ -0.16
NCR1Q12200 PAU21YOR394W 495 nt14.01□□□□□ -0.17
NCR1Q12200 PAU22YPL282C 495 nt14.01□□□□□ -0.17
NCR1Q12200 LSM3YLR438C-A 270 nt14□□□□□ -0.17
NCR1Q12200 FPR4YLR449W 1179 nt14□□□□□ -0.17
NCR1Q12200 YBL100CYBL100C 315 nt13.99□□□□□ -0.17
NCR1Q12200 PHO4YFR034C 939 nt13.97□□□□□ -0.17
NCR1Q12200 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.94□□□□□ -0.18
NCR1Q12200 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.94□□□□□ -0.18
NCR1Q12200 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.94□□□□□ -0.18
NCR1Q12200 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.94□□□□□ -0.18
NCR1Q12200 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.94□□□□□ -0.18
NCR1Q12200 Q0144Q0144 330 nt13.91□□□□□ -0.18
NCR1Q12200 ARO7YPR060C 771 nt13.88□□□□□ -0.19
NCR1Q12200 FUN26YAL022C 1554 nt13.88□□□□□ -0.19
NCR1Q12200 YLR281CYLR281C 468 nt13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms