RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS1	YDR247W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	SET3	P36124	751 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	CTP1	P38152	299 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	STB5	P38699	743 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	DOT5	P40553	215 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	BTN2	P53286	410 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	ADA2	Q02336	434 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	UBX2	Q04228	584 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	IZH3	Q07959	543 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	SMC6	Q12749	1114 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	MYO1	P08964	1928 aa		5.69	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RPC53	P25441	422 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	AXL2	P38928	823 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	KHA1	P40309	873 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	YNL320W	P42840	284 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	BST1	P43571	1029 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	TEL2	P53038	688 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	FHN1	P53279	174 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	YAP1802	P53309	568 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	HOF1	Q05080	669 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	ECI1	Q05871	280 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	TRM8	Q12009	286 aa		5.68	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	ALG7	P07286	448 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	ERG11	P10614	530 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	ABF1	P14164	731 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	FUB1	P25659	250 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	JNM1	P36224	373 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	IDS2	P46958	469 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	ILM1	P47155	203 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	PHO23	P50947	330 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RET3	P53600	189 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	MDM1	Q01846	1127 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	PIG1	Q06216	648 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	MLH2	Q07980	695 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	ICL2	Q12031	575 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	MLH3	Q12083	715 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RAD61	Q99359	647 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	FIG2	P25653	1609 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RAD3	P06839	778 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	VPS34	P22543	875 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	HCM1	P25364	564 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	YER010C	P40011	234 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	TOS3	P43637	560 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RPC17	P47076	161 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	SGM1	P47166	707 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	COS12	P53053	380 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	KAP114	P53067	1004 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	TOF1	P53840	1238 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	CBK1	P53894	756 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	IRC4	Q03036	179 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	YPR078C	Q06813	372 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	YDL086W	Q07505	273 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	AIM6	Q07716	390 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RTP1	Q12751	981 aa		5.67	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	INH1	P01097	85 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	TPK1	P06244	397 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	YCR051W	P25631	222 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	NIP100	P33420	868 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	MRPL7	P36519	292 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	ASE1	P50275	885 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	SEC5	P89102	971 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	USA1	Q03714	838 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	TAF9	Q05027	157 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	YLR177W	Q06251	628 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	DSE3	Q08729	430 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	TAF10	Q12030	206 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	USV1	Q12132	391 aa		5.66	□□□□□ -1.5
VHS1	YDR247W	TUS1	Q06412	1307 aa		5.65	□□□□□ -1.51
VHS1	YDR247W	PET122	P10355	254 aa		5.65	□□□□□ -1.51
VHS1	YDR247W	CKA2	P19454	339 aa		5.65	□□□□□ -1.51
VHS1	YDR247W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
VHS1	YDR247W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
VHS1	YDR247W	YME2	P32843	850 aa		5.65	□□□□□ -1.51
VHS1	YDR247W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51

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