Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.2■□□□□ 0.82
TRM8Q12009 NSR1YGR159C 1245 nt19.98■□□□□ 0.79
TRM8Q12009 NOP1YDL014W 984 nt19.72■□□□□ 0.75
TRM8Q12009 YKL036CYKL036C 393 nt18.34■□□□□ 0.53
TRM8Q12009 MDJ1YFL016C 1536 nt17.56■□□□□ 0.4
TRM8Q12009 Q0297Q0297 156 nt17.34■□□□□ 0.37
TRM8Q12009 SRX1YKL086W 384 nt17.24■□□□□ 0.35
TRM8Q12009 YJL027CYJL027C 417 nt17.14■□□□□ 0.33
TRM8Q12009 SCS3YGL126W 1143 nt16.78■□□□□ 0.28
TRM8Q12009 YCR051WYCR051W 669 nt16.33■□□□□ 0.2
TRM8Q12009 YOL085CYOL085C 342 nt15.88■□□□□ 0.13
TRM8Q12009 DBP2YNL112W 1641 nt15.64■□□□□ 0.09
TRM8Q12009 PKP1YIL042C 1185 nt15.59■□□□□ 0.09
TRM8Q12009 RPP1BYDL130W 321 nt15.54■□□□□ 0.08
TRM8Q12009 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM8Q12009 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM8Q12009 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM8Q12009 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM8Q12009 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM8Q12009 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM8Q12009 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM8Q12009 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM8Q12009 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM8Q12009 CCC1YLR220W 969 nt15.3■□□□□ 0.04
TRM8Q12009 SCJ1YMR214W 1134 nt15.08■□□□□ 0
TRM8Q12009 ATS1YAL020C 1002 nt15.04■□□□□ -0
TRM8Q12009 YBR190WYBR190W 312 nt14.96□□□□□ -0.01
TRM8Q12009 PET122YER153C 765 nt14.82□□□□□ -0.04
TRM8Q12009 RVS167YDR388W 1449 nt14.72□□□□□ -0.05
TRM8Q12009 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.7□□□□□ -0.06
TRM8Q12009 SCR1SCR1 522 nt14.7□□□□□ -0.06
TRM8Q12009 RTC3YHR087W 336 nt14.6□□□□□ -0.07
TRM8Q12009 RRN5YLR141W 1092 nt14.4□□□□□ -0.1
TRM8Q12009 SHR5YOL110W 714 nt14.25□□□□□ -0.13
TRM8Q12009 YDJ1YNL064C 1230 nt14.24□□□□□ -0.13
TRM8Q12009 SSA3YBL075C 1950 nt14.17□□□□□ -0.14
TRM8Q12009 RSB1YOR049C 1065 nt14.14□□□□□ -0.15
TRM8Q12009 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.13□□□□□ -0.15
TRM8Q12009 PST2YDR032C 597 nt13.93□□□□□ -0.18
TRM8Q12009 GAR1YHR089C 618 nt13.86□□□□□ -0.19
TRM8Q12009 DEP1YAL013W 1218 nt13.76□□□□□ -0.21
TRM8Q12009 URN1YPR152C 1398 nt13.74□□□□□ -0.21
TRM8Q12009 YNL208WYNL208W 600 nt13.58□□□□□ -0.24
TRM8Q12009 RPN10YHR200W 807 nt13.57□□□□□ -0.24
TRM8Q12009 PUT4YOR348C 1884 nt13.57□□□□□ -0.24
TRM8Q12009 OPI9YLR338W 858 nt13.53□□□□□ -0.24
TRM8Q12009 YKL097CYKL097C 411 nt13.43□□□□□ -0.26
TRM8Q12009 TIR1YER011W 765 nt13.41□□□□□ -0.26
TRM8Q12009 SAH1YER043C 1350 nt13.38□□□□□ -0.27
TRM8Q12009 SHU1YHL006C 453 nt13.31□□□□□ -0.28
TRM8Q12009 ARE1YCR048W 1833 nt13.27□□□□□ -0.28
TRM8Q12009 SSA1YAL005C 1929 nt13.23□□□□□ -0.29
TRM8Q12009 POA1YBR022W 534 nt13.18□□□□□ -0.3
TRM8Q12009 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.15□□□□□ -0.3
TRM8Q12009 YJR018WYJR018W 363 nt13.13□□□□□ -0.31
TRM8Q12009 PUN1YLR414C 792 nt13.13□□□□□ -0.31
TRM8Q12009 Q0182Q0182 405 nt13.04□□□□□ -0.32
TRM8Q12009 SRB2YHR041C 633 nt13.03□□□□□ -0.32
TRM8Q12009 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.03□□□□□ -0.32
TRM8Q12009 YJR120WYJR120W 351 nt12.97□□□□□ -0.33
TRM8Q12009 PTC2YER089C 1395 nt12.93□□□□□ -0.34
TRM8Q12009 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
TRM8Q12009 RPP2BYDR382W 333 nt12.89□□□□□ -0.35
TRM8Q12009 YOR139CYOR139C 393 nt12.88□□□□□ -0.35
TRM8Q12009 BUD23YCR047C 828 nt12.87□□□□□ -0.35
TRM8Q12009 WWM1YFL010C 636 nt12.84□□□□□ -0.35
TRM8Q12009 YGR021WYGR021W 873 nt12.83□□□□□ -0.36
TRM8Q12009 HOM6YJR139C 1080 nt12.79□□□□□ -0.36
TRM8Q12009 NAB2YGL122C 1578 nt12.76□□□□□ -0.37
TRM8Q12009 MNP1YGL068W 585 nt12.73□□□□□ -0.37
TRM8Q12009 NPL3YDR432W 1245 nt12.71□□□□□ -0.37
TRM8Q12009 BDH2YAL061W 1254 nt12.68□□□□□ -0.38
TRM8Q12009 INM2YDR287W 879 nt12.64□□□□□ -0.39
TRM8Q12009 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.64□□□□□ -0.39
TRM8Q12009 DAL1YIR027C 1383 nt12.61□□□□□ -0.39
TRM8Q12009 YOL037CYOL037C 354 nt12.61□□□□□ -0.39
TRM8Q12009 FIS1YIL065C 468 nt12.6□□□□□ -0.39
TRM8Q12009 RKM5YLR137W 1104 nt12.6□□□□□ -0.39
TRM8Q12009 LSM3YLR438C-A 270 nt12.56□□□□□ -0.4
TRM8Q12009 MOT3YMR070W 1473 nt12.54□□□□□ -0.4
TRM8Q12009 FPR4YLR449W 1179 nt12.54□□□□□ -0.4
TRM8Q12009 YBL100CYBL100C 315 nt12.54□□□□□ -0.4
TRM8Q12009 PHO4YFR034C 939 nt12.49□□□□□ -0.41
TRM8Q12009 FUN26YAL022C 1554 nt12.4□□□□□ -0.42
TRM8Q12009 TRM9YML014W 840 nt12.4□□□□□ -0.42
TRM8Q12009 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.37□□□□□ -0.43
TRM8Q12009 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.37□□□□□ -0.43
TRM8Q12009 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.37□□□□□ -0.43
TRM8Q12009 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.37□□□□□ -0.43
TRM8Q12009 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.37□□□□□ -0.43
TRM8Q12009 SPT5YML010W 3192 nt12.33□□□□□ -0.44
TRM8Q12009 YLR281CYLR281C 468 nt12.31□□□□□ -0.44
TRM8Q12009 CCT6YDR188W 1641 nt12.29□□□□□ -0.44
TRM8Q12009 WHI5YOR083W 888 nt12.22□□□□□ -0.45
TRM8Q12009 YPS1YLR120C 1710 nt12.21□□□□□ -0.45
TRM8Q12009 PUS2YGL063W 1113 nt12.21□□□□□ -0.45
TRM8Q12009 PAC11YDR488C 1602 nt12.19□□□□□ -0.46
TRM8Q12009 ALF1YNL148C 765 nt12.17□□□□□ -0.46
TRM8Q12009 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.16□□□□□ -0.46
TRM8Q12009 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.4 ms