Protein–RNA interactions for Protein: P53894

CBK1, Serine/threonine-protein kinase CBK1, yeastyeast

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CBK1P53894 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.83■■□□□ 1.25
CBK1P53894 NSR1YGR159C 1245 nt22.66■■□□□ 1.22
CBK1P53894 NOP1YDL014W 984 nt22.17■■□□□ 1.14
CBK1P53894 YKL036CYKL036C 393 nt20.47■□□□□ 0.87
CBK1P53894 MDJ1YFL016C 1536 nt20.15■□□□□ 0.82
CBK1P53894 Q0297Q0297 156 nt19.42■□□□□ 0.7
CBK1P53894 SRX1YKL086W 384 nt19.37■□□□□ 0.69
CBK1P53894 YJL027CYJL027C 417 nt19.12■□□□□ 0.65
CBK1P53894 SCS3YGL126W 1143 nt18.65■□□□□ 0.58
CBK1P53894 YCR051WYCR051W 669 nt18.4■□□□□ 0.54
CBK1P53894 DBP2YNL112W 1641 nt17.83■□□□□ 0.44
CBK1P53894 YOL085CYOL085C 342 nt17.75■□□□□ 0.43
CBK1P53894 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.53■□□□□ 0.4
CBK1P53894 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.53■□□□□ 0.4
CBK1P53894 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.53■□□□□ 0.4
CBK1P53894 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.53■□□□□ 0.4
CBK1P53894 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.53■□□□□ 0.4
CBK1P53894 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.53■□□□□ 0.4
CBK1P53894 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.53■□□□□ 0.4
CBK1P53894 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.53■□□□□ 0.4
CBK1P53894 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.53■□□□□ 0.4
CBK1P53894 PKP1YIL042C 1185 nt17.49■□□□□ 0.39
CBK1P53894 RPP1BYDL130W 321 nt17.43■□□□□ 0.38
CBK1P53894 CCC1YLR220W 969 nt17.37■□□□□ 0.37
CBK1P53894 YBR190WYBR190W 312 nt17.15■□□□□ 0.34
CBK1P53894 RTC3YHR087W 336 nt16.79■□□□□ 0.28
CBK1P53894 RVS167YDR388W 1449 nt16.74■□□□□ 0.27
CBK1P53894 SCJ1YMR214W 1134 nt16.69■□□□□ 0.26
CBK1P53894 ATS1YAL020C 1002 nt16.68■□□□□ 0.26
CBK1P53894 PET122YER153C 765 nt16.66■□□□□ 0.26
CBK1P53894 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.58■□□□□ 0.24
CBK1P53894 SCR1SCR1 522 nt16.47■□□□□ 0.23
CBK1P53894 RRN5YLR141W 1092 nt16.17■□□□□ 0.18
CBK1P53894 SHR5YOL110W 714 nt16.16■□□□□ 0.18
CBK1P53894 YDJ1YNL064C 1230 nt16.03■□□□□ 0.16
CBK1P53894 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.86■□□□□ 0.13
CBK1P53894 RSB1YOR049C 1065 nt15.85■□□□□ 0.13
CBK1P53894 DEP1YAL013W 1218 nt15.73■□□□□ 0.11
CBK1P53894 URN1YPR152C 1398 nt15.72■□□□□ 0.11
CBK1P53894 GAR1YHR089C 618 nt15.69■□□□□ 0.1
CBK1P53894 PUT4YOR348C 1884 nt15.59■□□□□ 0.09
CBK1P53894 OPI9YLR338W 858 nt15.48■□□□□ 0.07
CBK1P53894 RPN10YHR200W 807 nt15.47■□□□□ 0.07
CBK1P53894 YNL208WYNL208W 600 nt15.45■□□□□ 0.06
CBK1P53894 PST2YDR032C 597 nt15.44■□□□□ 0.06
CBK1P53894 SAH1YER043C 1350 nt15.39■□□□□ 0.05
CBK1P53894 ARE1YCR048W 1833 nt15.31■□□□□ 0.04
CBK1P53894 TIR1YER011W 765 nt15.16■□□□□ 0.02
CBK1P53894 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.11■□□□□ 0.01
CBK1P53894 POA1YBR022W 534 nt15.09■□□□□ 0.01
CBK1P53894 PUN1YLR414C 792 nt15.03■□□□□ -0
CBK1P53894 SSA1YAL005C 1929 nt14.99□□□□□ -0.01
CBK1P53894 YJR018WYJR018W 363 nt14.98□□□□□ -0.01
CBK1P53894 PTC2YER089C 1395 nt14.85□□□□□ -0.03
CBK1P53894 SHU1YHL006C 453 nt14.83□□□□□ -0.04
CBK1P53894 YKL097CYKL097C 411 nt14.83□□□□□ -0.04
CBK1P53894 BUD23YCR047C 828 nt14.77□□□□□ -0.05
CBK1P53894 YJR120WYJR120W 351 nt14.77□□□□□ -0.05
CBK1P53894 BSC6YOL137W 1494 nt14.76□□□□□ -0.05
CBK1P53894 SRB2YHR041C 633 nt14.76□□□□□ -0.05
CBK1P53894 RPP2BYDR382W 333 nt14.68□□□□□ -0.06
CBK1P53894 NAB2YGL122C 1578 nt14.65□□□□□ -0.06
CBK1P53894 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.61□□□□□ -0.07
CBK1P53894 WWM1YFL010C 636 nt14.5□□□□□ -0.09
CBK1P53894 DAL1YIR027C 1383 nt14.47□□□□□ -0.09
CBK1P53894 FIS1YIL065C 468 nt14.46□□□□□ -0.09
CBK1P53894 SSA3YBL075C 1950 nt14.45□□□□□ -0.1
CBK1P53894 INM2YDR287W 879 nt14.44□□□□□ -0.1
CBK1P53894 FPR4YLR449W 1179 nt14.44□□□□□ -0.1
CBK1P53894 YGR021WYGR021W 873 nt14.4□□□□□ -0.1
CBK1P53894 BDH2YAL061W 1254 nt14.4□□□□□ -0.1
CBK1P53894 HOM6YJR139C 1080 nt14.36□□□□□ -0.11
CBK1P53894 PHO4YFR034C 939 nt14.33□□□□□ -0.12
CBK1P53894 YBL100CYBL100C 315 nt14.32□□□□□ -0.12
CBK1P53894 MNP1YGL068W 585 nt14.31□□□□□ -0.12
CBK1P53894 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.25□□□□□ -0.13
CBK1P53894 YOR139CYOR139C 393 nt14.25□□□□□ -0.13
CBK1P53894 LSM3YLR438C-A 270 nt14.2□□□□□ -0.14
CBK1P53894 RKM5YLR137W 1104 nt14.16□□□□□ -0.14
CBK1P53894 FUN26YAL022C 1554 nt14.16□□□□□ -0.14
CBK1P53894 NPL3YDR432W 1245 nt14.12□□□□□ -0.15
CBK1P53894 TRM9YML014W 840 nt14.12□□□□□ -0.15
CBK1P53894 SPT5YML010W 3192 nt14.06□□□□□ -0.16
CBK1P53894 YPS1YLR120C 1710 nt14.05□□□□□ -0.16
CBK1P53894 YOL037CYOL037C 354 nt14.05□□□□□ -0.16
CBK1P53894 CCT6YDR188W 1641 nt13.98□□□□□ -0.17
CBK1P53894 YDR095CYDR095C 411 nt13.96□□□□□ -0.17
CBK1P53894 ALF1YNL148C 765 nt13.94□□□□□ -0.18
CBK1P53894 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.89□□□□□ -0.19
CBK1P53894 MEP2YNL142W 1500 nt13.85□□□□□ -0.19
CBK1P53894 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.85□□□□□ -0.19
CBK1P53894 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.85□□□□□ -0.19
CBK1P53894 YLR281CYLR281C 468 nt13.74□□□□□ -0.21
CBK1P53894 SIS1YNL007C 1059 nt13.73□□□□□ -0.21
CBK1P53894 RPP2AYOL039W 321 nt13.7□□□□□ -0.22
CBK1P53894 WHI5YOR083W 888 nt13.7□□□□□ -0.22
CBK1P53894 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.69□□□□□ -0.22
CBK1P53894 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.69□□□□□ -0.22
CBK1P53894 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.69□□□□□ -0.22
CBK1P53894 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.69□□□□□ -0.22
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