Protein–RNA interactions for Protein: P25045

LCB1, Serine palmitoyltransferase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB1P25045 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.63■■□□□ 1.53
LCB1P25045 NSR1YGR159C 1245 nt24.1■■□□□ 1.45
LCB1P25045 NOP1YDL014W 984 nt24■■□□□ 1.43
LCB1P25045 YKL036CYKL036C 393 nt22.54■■□□□ 1.2
LCB1P25045 Q0297Q0297 156 nt21.17■□□□□ 0.98
LCB1P25045 MDJ1YFL016C 1536 nt21.14■□□□□ 0.98
LCB1P25045 YJL027CYJL027C 417 nt21.13■□□□□ 0.97
LCB1P25045 SRX1YKL086W 384 nt21.01■□□□□ 0.95
LCB1P25045 SCS3YGL126W 1143 nt20.74■□□□□ 0.91
LCB1P25045 YCR051WYCR051W 669 nt20.02■□□□□ 0.8
LCB1P25045 YOL085CYOL085C 342 nt19.56■□□□□ 0.72
LCB1P25045 PKP1YIL042C 1185 nt19.29■□□□□ 0.68
LCB1P25045 RPP1BYDL130W 321 nt19.01■□□□□ 0.63
LCB1P25045 DBP2YNL112W 1641 nt18.86■□□□□ 0.61
LCB1P25045 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.79■□□□□ 0.6
LCB1P25045 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.79■□□□□ 0.6
LCB1P25045 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.79■□□□□ 0.6
LCB1P25045 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.79■□□□□ 0.6
LCB1P25045 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.79■□□□□ 0.6
LCB1P25045 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.79■□□□□ 0.6
LCB1P25045 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.79■□□□□ 0.6
LCB1P25045 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.79■□□□□ 0.6
LCB1P25045 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.79■□□□□ 0.6
LCB1P25045 SCJ1YMR214W 1134 nt18.73■□□□□ 0.59
LCB1P25045 CCC1YLR220W 969 nt18.69■□□□□ 0.58
LCB1P25045 ATS1YAL020C 1002 nt18.65■□□□□ 0.58
LCB1P25045 PET122YER153C 765 nt18.17■□□□□ 0.5
LCB1P25045 SCR1SCR1 522 nt17.99■□□□□ 0.47
LCB1P25045 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.93■□□□□ 0.46
LCB1P25045 YBR190WYBR190W 312 nt17.84■□□□□ 0.45
LCB1P25045 RRN5YLR141W 1092 nt17.7■□□□□ 0.42
LCB1P25045 RVS167YDR388W 1449 nt17.69■□□□□ 0.42
LCB1P25045 RTC3YHR087W 336 nt17.52■□□□□ 0.4
LCB1P25045 RSB1YOR049C 1065 nt17.41■□□□□ 0.38
LCB1P25045 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.34■□□□□ 0.37
LCB1P25045 YDJ1YNL064C 1230 nt17.28■□□□□ 0.36
LCB1P25045 PST2YDR032C 597 nt17.22■□□□□ 0.35
LCB1P25045 SHR5YOL110W 714 nt17.2■□□□□ 0.34
LCB1P25045 GAR1YHR089C 618 nt16.92■□□□□ 0.3
LCB1P25045 DEP1YAL013W 1218 nt16.7■□□□□ 0.26
LCB1P25045 YKL097CYKL097C 411 nt16.7■□□□□ 0.26
LCB1P25045 URN1YPR152C 1398 nt16.54■□□□□ 0.24
LCB1P25045 SHU1YHL006C 453 nt16.46■□□□□ 0.23
LCB1P25045 YNL208WYNL208W 600 nt16.38■□□□□ 0.21
LCB1P25045 TIR1YER011W 765 nt16.32■□□□□ 0.2
LCB1P25045 RPN10YHR200W 807 nt16.28■□□□□ 0.2
LCB1P25045 OPI9YLR338W 858 nt16.19■□□□□ 0.18
LCB1P25045 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.17■□□□□ 0.18
LCB1P25045 SSA1YAL005C 1929 nt16.08■□□□□ 0.16
LCB1P25045 SAH1YER043C 1350 nt16.06■□□□□ 0.16
LCB1P25045 YOR139CYOR139C 393 nt16.03■□□□□ 0.16
LCB1P25045 PUT4YOR348C 1884 nt15.97■□□□□ 0.15
LCB1P25045 SRB2YHR041C 633 nt15.96■□□□□ 0.15
LCB1P25045 ARE1YCR048W 1833 nt15.81■□□□□ 0.12
LCB1P25045 YJR018WYJR018W 363 nt15.79■□□□□ 0.12
LCB1P25045 NPL3YDR432W 1245 nt15.74■□□□□ 0.11
LCB1P25045 WWM1YFL010C 636 nt15.71■□□□□ 0.11
LCB1P25045 YJR120WYJR120W 351 nt15.69■□□□□ 0.1
LCB1P25045 MNP1YGL068W 585 nt15.68■□□□□ 0.1
LCB1P25045 PUN1YLR414C 792 nt15.68■□□□□ 0.1
LCB1P25045 HOM6YJR139C 1080 nt15.64■□□□□ 0.09
LCB1P25045 YGR021WYGR021W 873 nt15.59■□□□□ 0.09
LCB1P25045 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.59■□□□□ 0.09
LCB1P25045 POA1YBR022W 534 nt15.55■□□□□ 0.08
LCB1P25045 RPP2BYDR382W 333 nt15.51■□□□□ 0.07
LCB1P25045 PTC2YER089C 1395 nt15.5■□□□□ 0.07
LCB1P25045 YOL037CYOL037C 354 nt15.43■□□□□ 0.06
LCB1P25045 RKM5YLR137W 1104 nt15.41■□□□□ 0.06
LCB1P25045 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.38■□□□□ 0.05
LCB1P25045 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.38■□□□□ 0.05
LCB1P25045 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.38■□□□□ 0.05
LCB1P25045 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.38■□□□□ 0.05
LCB1P25045 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.38■□□□□ 0.05
LCB1P25045 SSA3YBL075C 1950 nt15.37■□□□□ 0.05
LCB1P25045 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.35■□□□□ 0.05
LCB1P25045 BDH2YAL061W 1254 nt15.3■□□□□ 0.04
LCB1P25045 BUD23YCR047C 828 nt15.29■□□□□ 0.04
LCB1P25045 NAB2YGL122C 1578 nt15.2■□□□□ 0.02
LCB1P25045 PUS2YGL063W 1113 nt15.14■□□□□ 0.01
LCB1P25045 LSM3YLR438C-A 270 nt15.14■□□□□ 0.01
LCB1P25045 INM2YDR287W 879 nt15.13■□□□□ 0.01
LCB1P25045 YLR281CYLR281C 468 nt15.12■□□□□ 0.01
LCB1P25045 FPR4YLR449W 1179 nt15.12■□□□□ 0.01
LCB1P25045 BSC6YOL137W 1494 nt15.1■□□□□ 0.01
LCB1P25045 YBL100CYBL100C 315 nt15.09■□□□□ 0.01
LCB1P25045 DAL1YIR027C 1383 nt15.09■□□□□ 0.01
LCB1P25045 FIS1YIL065C 468 nt15.05■□□□□ -0
LCB1P25045 WHI5YOR083W 888 nt15.04■□□□□ -0
LCB1P25045 TRM9YML014W 840 nt14.96□□□□□ -0.01
LCB1P25045 PHO4YFR034C 939 nt14.95□□□□□ -0.02
LCB1P25045 FUN26YAL022C 1554 nt14.94□□□□□ -0.02
LCB1P25045 MOT3YMR070W 1473 nt14.89□□□□□ -0.03
LCB1P25045 YPR011CYPR011C 981 nt14.85□□□□□ -0.03
LCB1P25045 CCT6YDR188W 1641 nt14.77□□□□□ -0.05
LCB1P25045 FMP45YDL222C 930 nt14.75□□□□□ -0.05
LCB1P25045 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.74□□□□□ -0.05
LCB1P25045 YLR236CYLR236C 324 nt14.74□□□□□ -0.05
LCB1P25045 DSK2YMR276W 1122 nt14.73□□□□□ -0.05
LCB1P25045 ALF1YNL148C 765 nt14.61□□□□□ -0.07
LCB1P25045 YCH1YGR203W 447 nt14.58□□□□□ -0.08
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