RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W DRS1P32892 752 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VHS1YDR247W MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
VHS1YDR247W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
VHS1YDR247W FAP1P53971 965 aa12.51□□□□□ -0.41
VHS1YDR247W TFA1P36100 482 aa12.36□□□□□ -0.43
VHS1YDR247W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
VHS1YDR247W AVT3P36062 692 aa12.09□□□□□ -0.47
VHS1YDR247W PRY3P47033 881 aa11.73□□□□□ -0.53
VHS1YDR247W PRI1P10363 409 aa11.52□□□□□ -0.57
VHS1YDR247W AAD16Q02895 342 aa11.44□□□□□ -0.58
VHS1YDR247W ISW2Q08773 1120 aa11.4□□□□□ -0.59
VHS1YDR247W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
VHS1YDR247W RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
VHS1YDR247W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
VHS1YDR247W YCK3P39962 524 aa11.03□□□□□ -0.64
VHS1YDR247W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
VHS1YDR247W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
VHS1YDR247W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
VHS1YDR247W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
VHS1YDR247W REB1P21538 810 aa10.68□□□□□ -0.7
VHS1YDR247W MRPL32P25348 183 aa10.5□□□□□ -0.73
VHS1YDR247W SPT21P35209 758 aa10.46□□□□□ -0.74
VHS1YDR247W RIM101P33400 625 aa10.44□□□□□ -0.74
VHS1YDR247W PTP3P40048 928 aa10.44□□□□□ -0.74
VHS1YDR247W DMA1P38823 416 aa10.39□□□□□ -0.75
VHS1YDR247W SSP1P38871 571 aa10.25□□□□□ -0.77
VHS1YDR247W OXP1P28273 1286 aa10.14□□□□□ -0.79
VHS1YDR247W YGL015CP33199 130 aa10.08□□□□□ -0.8
VHS1YDR247W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
VHS1YDR247W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data10.05□□□□□ -0.8not detected
VHS1YDR247W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
VHS1YDR247W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
VHS1YDR247W YLR271WQ06152 274 aa9.95□□□□□ -0.82
VHS1YDR247W CDC27P38042 758 aa9.93□□□□□ -0.82
VHS1YDR247W RSM7P47150 247 aa9.86□□□□□ -0.83
VHS1YDR247W MGA2P40578 1113 aa9.83□□□□□ -0.84
VHS1YDR247W TFC8Q12308 588 aa9.81□□□□□ -0.84
VHS1YDR247W HOP09932 586 aa9.8□□□□□ -0.84
VHS1YDR247W TAF7Q05021 590 aa9.79□□□□□ -0.84
VHS1YDR247W LEO1P38439 464 aa9.73□□□□□ -0.85
VHS1YDR247W DCD1P06773 312 aa9.71□□□□□ -0.86
VHS1YDR247W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
VHS1YDR247W CST9Q06032 482 aa9.67□□□□□ -0.86
VHS1YDR247W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
VHS1YDR247W AI2P03876 854 aa9.63□□□□□ -0.87
VHS1YDR247W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
VHS1YDR247W MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
VHS1YDR247W BBC1P47068 1157 aa9.56□□□□□ -0.88
VHS1YDR247W LEU3P08638 886 aa9.55□□□□□ -0.88
VHS1YDR247W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
VHS1YDR247W BCH2P36122 765 aa9.54□□□□□ -0.88
VHS1YDR247W SCY1P53009 804 aa9.46□□□□□ -0.9
VHS1YDR247W EPS1P40557 701 aa9.43□□□□□ -0.9
VHS1YDR247W RAM2P29703 316 aa9.4□□□□□ -0.9
VHS1YDR247W MRM1P25270 412 aa9.37□□□□□ -0.91
VHS1YDR247W SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
VHS1YDR247W BDF1P35817 686 aa9.34□□□□□ -0.91
VHS1YDR247W SET1P38827 1080 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
VHS1YDR247W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
VHS1YDR247W RTG3P38165 486 aa9.29□□□□□ -0.92
VHS1YDR247W RCR1P38212 213 aa9.28□□□□□ -0.92
VHS1YDR247W RPN1P38764 993 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
VHS1YDR247W IFH1P39520 1085 aa9.26□□□□□ -0.93
VHS1YDR247W TGL3P40308 642 aa9.26□□□□□ -0.93
VHS1YDR247W CKB1P43639 278 aa9.26□□□□□ -0.93
VHS1YDR247W YPR148CQ06523 435 aa9.25□□□□□ -0.93
VHS1YDR247W VPS70P47161 811 aa9.24□□□□□ -0.93
VHS1YDR247W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
VHS1YDR247W MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
VHS1YDR247W VPS29P38759 282 aa9.12□□□□□ -0.95
VHS1YDR247W COQ8P27697 501 aa9.09□□□□□ -0.95
VHS1YDR247W DMA2P53924 522 aa9.06□□□□□ -0.96
VHS1YDR247W DSF2P38213 736 aa9.05□□□□□ -0.96
VHS1YDR247W PBS2P08018 668 aa9.04□□□□□ -0.96
VHS1YDR247W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
VHS1YDR247W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.03□□□□□ -0.96not detected
VHS1YDR247W UBP9P39967 754 aa9.02□□□□□ -0.97
VHS1YDR247W SIS1P25294 352 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
VHS1YDR247W MIF2P35201 549 aa9□□□□□ -0.97
VHS1YDR247W STS1P38637 319 aa8.98□□□□□ -0.97
VHS1YDR247W DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
VHS1YDR247W EDS1P38073 919 aa8.95□□□□□ -0.98
VHS1YDR247W REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
VHS1YDR247W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VHS1YDR247W YFR006WP43590 535 aa8.94□□□□□ -0.98
VHS1YDR247W MAM3Q12296 706 aa8.93□□□□□ -0.98
VHS1YDR247W YOR238WQ08634 303 aa8.92□□□□□ -0.98
VHS1YDR247W KIN1P13185 1064 aa8.89□□□□□ -0.99
VHS1YDR247W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.88□□□□□ -0.99not detected
VHS1YDR247W IES2P40154 320 aa8.88□□□□□ -0.99
VHS1YDR247W MST1P07236 462 aa8.87□□□□□ -0.99
VHS1YDR247W PTC3P34221 468 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
VHS1YDR247W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
VHS1YDR247W GLC3P32775 704 aa8.85□□□□□ -0.99
VHS1YDR247W AIM7Q12156 149 aa8.85□□□□□ -0.99
VHS1YDR247W YAP5P40574 245 aa8.83□□□□□ -1
VHS1YDR247W NUP42P49686 430 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
VHS1YDR247W RLF2Q12495 606 aa8.82□□□□□ -1
VHS1YDR247W COX6P00427 148 aa8.8□□□□□ -1
VHS1YDR247W DIT2P21595 489 aa8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.6 ms