Protein–RNA interactions for Protein: Q12083

MLH3, DNA mismatch repair protein MLH3, yeastyeast

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MLH3Q12083 NSR1YGR159C 1245 nt19.36■□□□□ 0.69
MLH3Q12083 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.32■□□□□ 0.68
MLH3Q12083 NOP1YDL014W 984 nt18.59■□□□□ 0.57
MLH3Q12083 MDJ1YFL016C 1536 nt17.56■□□□□ 0.4
MLH3Q12083 YKL036CYKL036C 393 nt17.07■□□□□ 0.32
MLH3Q12083 SRX1YKL086W 384 nt16.27■□□□□ 0.2
MLH3Q12083 Q0297Q0297 156 nt16.2■□□□□ 0.18
MLH3Q12083 YJL027CYJL027C 417 nt16.11■□□□□ 0.17
MLH3Q12083 SCS3YGL126W 1143 nt15.51■□□□□ 0.07
MLH3Q12083 YCR051WYCR051W 669 nt15.45■□□□□ 0.06
MLH3Q12083 DBP2YNL112W 1641 nt15.41■□□□□ 0.06
MLH3Q12083 YBR190WYBR190W 312 nt14.95□□□□□ -0.02
MLH3Q12083 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.9□□□□□ -0.02
MLH3Q12083 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.9□□□□□ -0.02
MLH3Q12083 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.9□□□□□ -0.02
MLH3Q12083 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.9□□□□□ -0.02
MLH3Q12083 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.9□□□□□ -0.02
MLH3Q12083 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.9□□□□□ -0.02
MLH3Q12083 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.9□□□□□ -0.02
MLH3Q12083 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.9□□□□□ -0.02
MLH3Q12083 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.9□□□□□ -0.02
MLH3Q12083 CCC1YLR220W 969 nt14.77□□□□□ -0.05
MLH3Q12083 YOL085CYOL085C 342 nt14.73□□□□□ -0.05
MLH3Q12083 RTC3YHR087W 336 nt14.64□□□□□ -0.07
MLH3Q12083 PKP1YIL042C 1185 nt14.56□□□□□ -0.08
MLH3Q12083 RPP1BYDL130W 321 nt14.55□□□□□ -0.08
MLH3Q12083 RVS167YDR388W 1449 nt14.35□□□□□ -0.11
MLH3Q12083 SCJ1YMR214W 1134 nt14.33□□□□□ -0.12
MLH3Q12083 SSA3YBL075C 1950 nt14□□□□□ -0.17
MLH3Q12083 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14□□□□□ -0.17
MLH3Q12083 PET122YER153C 765 nt13.98□□□□□ -0.17
MLH3Q12083 ATS1YAL020C 1002 nt13.92□□□□□ -0.18
MLH3Q12083 PUT4YOR348C 1884 nt13.84□□□□□ -0.19
MLH3Q12083 SHR5YOL110W 714 nt13.8□□□□□ -0.2
MLH3Q12083 SCR1SCR1 522 nt13.78□□□□□ -0.2
MLH3Q12083 URN1YPR152C 1398 nt13.61□□□□□ -0.23
MLH3Q12083 DEP1YAL013W 1218 nt13.57□□□□□ -0.24
MLH3Q12083 RRN5YLR141W 1092 nt13.53□□□□□ -0.24
MLH3Q12083 ARE1YCR048W 1833 nt13.52□□□□□ -0.25
MLH3Q12083 YDJ1YNL064C 1230 nt13.51□□□□□ -0.25
MLH3Q12083 SAH1YER043C 1350 nt13.47□□□□□ -0.25
MLH3Q12083 OPI9YLR338W 858 nt13.45□□□□□ -0.26
MLH3Q12083 POA1YBR022W 534 nt13.38□□□□□ -0.27
MLH3Q12083 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.35□□□□□ -0.27
MLH3Q12083 GAR1YHR089C 618 nt13.31□□□□□ -0.28
MLH3Q12083 RPN10YHR200W 807 nt13.29□□□□□ -0.28
MLH3Q12083 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.26□□□□□ -0.29
MLH3Q12083 YNL208WYNL208W 600 nt13.26□□□□□ -0.29
MLH3Q12083 RSB1YOR049C 1065 nt13.18□□□□□ -0.3
MLH3Q12083 BSC6YOL137W 1494 nt13.15□□□□□ -0.3
MLH3Q12083 PUN1YLR414C 792 nt13.04□□□□□ -0.32
MLH3Q12083 BUD23YCR047C 828 nt13.01□□□□□ -0.33
MLH3Q12083 PTC2YER089C 1395 nt12.97□□□□□ -0.33
MLH3Q12083 YJR018WYJR018W 363 nt12.95□□□□□ -0.34
MLH3Q12083 PST2YDR032C 597 nt12.86□□□□□ -0.35
MLH3Q12083 TIR1YER011W 765 nt12.86□□□□□ -0.35
MLH3Q12083 NAB2YGL122C 1578 nt12.8□□□□□ -0.36
MLH3Q12083 SSA1YAL005C 1929 nt12.8□□□□□ -0.36
MLH3Q12083 YJR120WYJR120W 351 nt12.77□□□□□ -0.37
MLH3Q12083 SPT5YML010W 3192 nt12.76□□□□□ -0.37
MLH3Q12083 FIS1YIL065C 468 nt12.66□□□□□ -0.38
MLH3Q12083 DAL1YIR027C 1383 nt12.6□□□□□ -0.39
MLH3Q12083 RPP2BYDR382W 333 nt12.59□□□□□ -0.39
MLH3Q12083 SRB2YHR041C 633 nt12.59□□□□□ -0.39
MLH3Q12083 FPR4YLR449W 1179 nt12.59□□□□□ -0.39
MLH3Q12083 PHO4YFR034C 939 nt12.5□□□□□ -0.41
MLH3Q12083 INM2YDR287W 879 nt12.48□□□□□ -0.41
MLH3Q12083 YKL097CYKL097C 411 nt12.45□□□□□ -0.42
MLH3Q12083 SSA4YER103W 1929 nt12.4□□□□□ -0.42
MLH3Q12083 YBL100CYBL100C 315 nt12.37□□□□□ -0.43
MLH3Q12083 YPS1YLR120C 1710 nt12.35□□□□□ -0.43
MLH3Q12083 MEP2YNL142W 1500 nt12.35□□□□□ -0.43
MLH3Q12083 BDH2YAL061W 1254 nt12.31□□□□□ -0.44
MLH3Q12083 SHU1YHL006C 453 nt12.29□□□□□ -0.44
MLH3Q12083 WWM1YFL010C 636 nt12.28□□□□□ -0.44
MLH3Q12083 YDR095CYDR095C 411 nt12.23□□□□□ -0.45
MLH3Q12083 FUN26YAL022C 1554 nt12.22□□□□□ -0.45
MLH3Q12083 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.22□□□□□ -0.45
MLH3Q12083 DCW1YKL046C 1350 nt12.2□□□□□ -0.46
MLH3Q12083 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.14□□□□□ -0.47
MLH3Q12083 TRM9YML014W 840 nt12.11□□□□□ -0.47
MLH3Q12083 ALF1YNL148C 765 nt12.08□□□□□ -0.48
MLH3Q12083 LSM3YLR438C-A 270 nt12.06□□□□□ -0.48
MLH3Q12083 YGR021WYGR021W 873 nt12.05□□□□□ -0.48
MLH3Q12083 HOM6YJR139C 1080 nt12.04□□□□□ -0.48
MLH3Q12083 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.03□□□□□ -0.48
MLH3Q12083 CCT6YDR188W 1641 nt12.02□□□□□ -0.49
MLH3Q12083 MNP1YGL068W 585 nt12.01□□□□□ -0.49
MLH3Q12083 EMI2YDR516C 1503 nt12.01□□□□□ -0.49
MLH3Q12083 PTP1YDL230W 1008 nt12□□□□□ -0.49
MLH3Q12083 RPP2AYOL039W 321 nt11.98□□□□□ -0.49
MLH3Q12083 CAC2YML102W 1407 nt11.97□□□□□ -0.49
MLH3Q12083 BDF1YLR399C 2061 nt11.96□□□□□ -0.5
MLH3Q12083 SIS1YNL007C 1059 nt11.91□□□□□ -0.5
MLH3Q12083 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.9□□□□□ -0.5
MLH3Q12083 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.9□□□□□ -0.5
MLH3Q12083 YDL221WYDL221W 552 nt11.88□□□□□ -0.51
MLH3Q12083 RKM5YLR137W 1104 nt11.87□□□□□ -0.51
MLH3Q12083 YMR090WYMR090W 684 nt11.87□□□□□ -0.51
MLH3Q12083 YBR220CYBR220C 1683 nt11.86□□□□□ -0.51
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