Protein–RNA interactions for Protein: Q12132

USV1, Nutrient and stress factor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USV1Q12132 NSR1YGR159C 1245 nt16.47■□□□□ 0.23
USV1Q12132 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.23■□□□□ 0.19
USV1Q12132 NOP1YDL014W 984 nt15.58■□□□□ 0.08
USV1Q12132 MDJ1YFL016C 1536 nt15.02■□□□□ -0
USV1Q12132 YKL036CYKL036C 393 nt14.08□□□□□ -0.16
USV1Q12132 YJL027CYJL027C 417 nt13.76□□□□□ -0.21
USV1Q12132 SRX1YKL086W 384 nt13.67□□□□□ -0.22
USV1Q12132 Q0297Q0297 156 nt13.6□□□□□ -0.23
USV1Q12132 DBP2YNL112W 1641 nt13.2□□□□□ -0.3
USV1Q12132 YCR051WYCR051W 669 nt12.91□□□□□ -0.34
USV1Q12132 YBR190WYBR190W 312 nt12.86□□□□□ -0.35
USV1Q12132 SCS3YGL126W 1143 nt12.67□□□□□ -0.38
USV1Q12132 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.61□□□□□ -0.39
USV1Q12132 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.61□□□□□ -0.39
USV1Q12132 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.61□□□□□ -0.39
USV1Q12132 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.61□□□□□ -0.39
USV1Q12132 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.61□□□□□ -0.39
USV1Q12132 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.61□□□□□ -0.39
USV1Q12132 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.61□□□□□ -0.39
USV1Q12132 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.61□□□□□ -0.39
USV1Q12132 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.61□□□□□ -0.39
USV1Q12132 RTC3YHR087W 336 nt12.51□□□□□ -0.41
USV1Q12132 CCC1YLR220W 969 nt12.44□□□□□ -0.42
USV1Q12132 YOL085CYOL085C 342 nt12.26□□□□□ -0.45
USV1Q12132 RPP1BYDL130W 321 nt12.18□□□□□ -0.46
USV1Q12132 SCJ1YMR214W 1134 nt12.17□□□□□ -0.46
USV1Q12132 SSA3YBL075C 1950 nt12.16□□□□□ -0.46
USV1Q12132 RVS167YDR388W 1449 nt12.15□□□□□ -0.46
USV1Q12132 PKP1YIL042C 1185 nt12.11□□□□□ -0.47
USV1Q12132 PUT4YOR348C 1884 nt12.04□□□□□ -0.48
USV1Q12132 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.8□□□□□ -0.52
USV1Q12132 PET122YER153C 765 nt11.72□□□□□ -0.53
USV1Q12132 SHR5YOL110W 714 nt11.71□□□□□ -0.53
USV1Q12132 ARE1YCR048W 1833 nt11.71□□□□□ -0.54
USV1Q12132 URN1YPR152C 1398 nt11.62□□□□□ -0.55
USV1Q12132 POA1YBR022W 534 nt11.6□□□□□ -0.55
USV1Q12132 SAH1YER043C 1350 nt11.58□□□□□ -0.56
USV1Q12132 Q0182Q0182 405 nt11.57□□□□□ -0.56
USV1Q12132 OPI9YLR338W 858 nt11.55□□□□□ -0.56
USV1Q12132 DEP1YAL013W 1218 nt11.52□□□□□ -0.57
USV1Q12132 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.5□□□□□ -0.57
USV1Q12132 BSC6YOL137W 1494 nt11.42□□□□□ -0.58
USV1Q12132 YDJ1YNL064C 1230 nt11.41□□□□□ -0.58
USV1Q12132 SCR1SCR1 522 nt11.38□□□□□ -0.59
USV1Q12132 RRN5YLR141W 1092 nt11.33□□□□□ -0.6
USV1Q12132 SPT5YML010W 3192 nt11.29□□□□□ -0.6
USV1Q12132 MOT3YMR070W 1473 nt11.29□□□□□ -0.6
USV1Q12132 RPN10YHR200W 807 nt11.27□□□□□ -0.61
USV1Q12132 YNL208WYNL208W 600 nt11.26□□□□□ -0.61
USV1Q12132 ATS1YAL020C 1002 nt11.22□□□□□ -0.61
USV1Q12132 GAR1YHR089C 618 nt11.2□□□□□ -0.62
USV1Q12132 BUD23YCR047C 828 nt11.17□□□□□ -0.62
USV1Q12132 PUN1YLR414C 792 nt11.16□□□□□ -0.62
USV1Q12132 PTC2YER089C 1395 nt11.13□□□□□ -0.63
USV1Q12132 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.11□□□□□ -0.63
USV1Q12132 YJR018WYJR018W 363 nt11.06□□□□□ -0.64
USV1Q12132 NAB2YGL122C 1578 nt11.01□□□□□ -0.65
USV1Q12132 SSA4YER103W 1929 nt10.98□□□□□ -0.65
USV1Q12132 YJR120WYJR120W 351 nt10.94□□□□□ -0.66
USV1Q12132 RSB1YOR049C 1065 nt10.94□□□□□ -0.66
USV1Q12132 FIS1YIL065C 468 nt10.89□□□□□ -0.67
USV1Q12132 SSA1YAL005C 1929 nt10.86□□□□□ -0.67
USV1Q12132 TIR1YER011W 765 nt10.85□□□□□ -0.67
USV1Q12132 DAL1YIR027C 1383 nt10.8□□□□□ -0.68
USV1Q12132 MEP2YNL142W 1500 nt10.76□□□□□ -0.69
USV1Q12132 FPR4YLR449W 1179 nt10.73□□□□□ -0.69
USV1Q12132 PHO4YFR034C 939 nt10.72□□□□□ -0.69
USV1Q12132 SRB2YHR041C 633 nt10.7□□□□□ -0.7
USV1Q12132 INM2YDR287W 879 nt10.68□□□□□ -0.7
USV1Q12132 RPP2BYDR382W 333 nt10.66□□□□□ -0.7
USV1Q12132 YPS1YLR120C 1710 nt10.66□□□□□ -0.7
USV1Q12132 BDF1YLR399C 2061 nt10.64□□□□□ -0.71
USV1Q12132 DCW1YKL046C 1350 nt10.63□□□□□ -0.71
USV1Q12132 YDR095CYDR095C 411 nt10.53□□□□□ -0.72
USV1Q12132 YBL100CYBL100C 315 nt10.53□□□□□ -0.72
USV1Q12132 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.51□□□□□ -0.73
USV1Q12132 PST2YDR032C 597 nt10.48□□□□□ -0.73
USV1Q12132 TAT1YBR069C 1860 nt10.47□□□□□ -0.73
USV1Q12132 BDH2YAL061W 1254 nt10.45□□□□□ -0.74
USV1Q12132 EMI2YDR516C 1503 nt10.43□□□□□ -0.74
USV1Q12132 FUN26YAL022C 1554 nt10.42□□□□□ -0.74
USV1Q12132 PTP1YDL230W 1008 nt10.4□□□□□ -0.74
USV1Q12132 YBR220CYBR220C 1683 nt10.4□□□□□ -0.74
USV1Q12132 CAC2YML102W 1407 nt10.38□□□□□ -0.75
USV1Q12132 WWM1YFL010C 636 nt10.34□□□□□ -0.75
USV1Q12132 YDL221WYDL221W 552 nt10.33□□□□□ -0.76
USV1Q12132 RPP2AYOL039W 321 nt10.31□□□□□ -0.76
USV1Q12132 TRM9YML014W 840 nt10.29□□□□□ -0.76
USV1Q12132 YMR090WYMR090W 684 nt10.28□□□□□ -0.76
USV1Q12132 ALF1YNL148C 765 nt10.28□□□□□ -0.76
USV1Q12132 SDH1YKL148C 1923 nt10.27□□□□□ -0.76
USV1Q12132 CCT6YDR188W 1641 nt10.25□□□□□ -0.77
USV1Q12132 LSM3YLR438C-A 270 nt10.24□□□□□ -0.77
USV1Q12132 SIS1YNL007C 1059 nt10.23□□□□□ -0.77
USV1Q12132 IRC15YPL017C 1500 nt10.23□□□□□ -0.77
USV1Q12132 SCC4YER147C 1875 nt10.15□□□□□ -0.78
USV1Q12132 SHU1YHL006C 453 nt10.15□□□□□ -0.78
USV1Q12132 GIS3YLR094C 1509 nt10.13□□□□□ -0.79
USV1Q12132 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.13□□□□□ -0.79
USV1Q12132 HOM6YJR139C 1080 nt10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms