Protein–RNA interactions for Protein: Q05027

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, yeastyeast

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF9Q05027 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.47■■□□□ 1.03
TAF9Q05027 NSR1YGR159C 1245 nt21.3■■□□□ 1
TAF9Q05027 NOP1YDL014W 984 nt20.93■□□□□ 0.94
TAF9Q05027 YKL036CYKL036C 393 nt19.34■□□□□ 0.69
TAF9Q05027 MDJ1YFL016C 1536 nt18.83■□□□□ 0.6
TAF9Q05027 Q0297Q0297 156 nt18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q05027 SRX1YKL086W 384 nt18.26■□□□□ 0.51
TAF9Q05027 YJL027CYJL027C 417 nt18.08■□□□□ 0.48
TAF9Q05027 SCS3YGL126W 1143 nt17.61■□□□□ 0.41
TAF9Q05027 YCR051WYCR051W 669 nt17.35■□□□□ 0.37
TAF9Q05027 YOL085CYOL085C 342 nt16.75■□□□□ 0.27
TAF9Q05027 DBP2YNL112W 1641 nt16.68■□□□□ 0.26
TAF9Q05027 PKP1YIL042C 1185 nt16.49■□□□□ 0.23
TAF9Q05027 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.45■□□□□ 0.22
TAF9Q05027 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.45■□□□□ 0.22
TAF9Q05027 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.45■□□□□ 0.22
TAF9Q05027 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.45■□□□□ 0.22
TAF9Q05027 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.45■□□□□ 0.22
TAF9Q05027 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.45■□□□□ 0.22
TAF9Q05027 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.45■□□□□ 0.22
TAF9Q05027 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.45■□□□□ 0.22
TAF9Q05027 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.45■□□□□ 0.22
TAF9Q05027 RPP1BYDL130W 321 nt16.44■□□□□ 0.22
TAF9Q05027 CCC1YLR220W 969 nt16.34■□□□□ 0.21
TAF9Q05027 YBR190WYBR190W 312 nt16.06■□□□□ 0.16
TAF9Q05027 ATS1YAL020C 1002 nt15.79■□□□□ 0.12
TAF9Q05027 RVS167YDR388W 1449 nt15.74■□□□□ 0.11
TAF9Q05027 RTC3YHR087W 336 nt15.73■□□□□ 0.11
TAF9Q05027 SCJ1YMR214W 1134 nt15.69■□□□□ 0.1
TAF9Q05027 PET122YER153C 765 nt15.68■□□□□ 0.1
TAF9Q05027 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.62■□□□□ 0.09
TAF9Q05027 SCR1SCR1 522 nt15.57■□□□□ 0.08
TAF9Q05027 SSA3YBL075C 1950 nt15.37■□□□□ 0.05
TAF9Q05027 RRN5YLR141W 1092 nt15.26■□□□□ 0.03
TAF9Q05027 SHR5YOL110W 714 nt15.18■□□□□ 0.02
TAF9Q05027 YDJ1YNL064C 1230 nt15.1■□□□□ 0.01
TAF9Q05027 PUT4YOR348C 1884 nt15.05■□□□□ -0
TAF9Q05027 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.96□□□□□ -0.01
TAF9Q05027 RSB1YOR049C 1065 nt14.96□□□□□ -0.01
TAF9Q05027 GAR1YHR089C 618 nt14.76□□□□□ -0.05
TAF9Q05027 DEP1YAL013W 1218 nt14.75□□□□□ -0.05
TAF9Q05027 URN1YPR152C 1398 nt14.73□□□□□ -0.05
TAF9Q05027 ARE1YCR048W 1833 nt14.62□□□□□ -0.07
TAF9Q05027 PST2YDR032C 597 nt14.61□□□□□ -0.07
TAF9Q05027 RPN10YHR200W 807 nt14.53□□□□□ -0.08
TAF9Q05027 YNL208WYNL208W 600 nt14.52□□□□□ -0.09
TAF9Q05027 POA1YBR022W 534 nt14.52□□□□□ -0.09
TAF9Q05027 OPI9YLR338W 858 nt14.49□□□□□ -0.09
TAF9Q05027 SAH1YER043C 1350 nt14.46□□□□□ -0.1
TAF9Q05027 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.4□□□□□ -0.1
TAF9Q05027 BSC6YOL137W 1494 nt14.31□□□□□ -0.12
TAF9Q05027 TIR1YER011W 765 nt14.26□□□□□ -0.13
TAF9Q05027 SPT5YML010W 3192 nt14.13□□□□□ -0.15
TAF9Q05027 PUN1YLR414C 792 nt14.08□□□□□ -0.16
TAF9Q05027 SSA1YAL005C 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
TAF9Q05027 YJR018WYJR018W 363 nt14.06□□□□□ -0.16
TAF9Q05027 YKL097CYKL097C 411 nt14.06□□□□□ -0.16
TAF9Q05027 BUD23YCR047C 828 nt14□□□□□ -0.17
TAF9Q05027 SHU1YHL006C 453 nt13.99□□□□□ -0.17
TAF9Q05027 PTC2YER089C 1395 nt13.91□□□□□ -0.18
TAF9Q05027 SSA4YER103W 1929 nt13.82□□□□□ -0.2
TAF9Q05027 RPP2BYDR382W 333 nt13.81□□□□□ -0.2
TAF9Q05027 SRB2YHR041C 633 nt13.81□□□□□ -0.2
TAF9Q05027 YJR120WYJR120W 351 nt13.8□□□□□ -0.2
TAF9Q05027 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.78□□□□□ -0.2
TAF9Q05027 NAB2YGL122C 1578 nt13.73□□□□□ -0.21
TAF9Q05027 WWM1YFL010C 636 nt13.64□□□□□ -0.23
TAF9Q05027 YGR021WYGR021W 873 nt13.58□□□□□ -0.24
TAF9Q05027 INM2YDR287W 879 nt13.57□□□□□ -0.24
TAF9Q05027 FIS1YIL065C 468 nt13.56□□□□□ -0.24
TAF9Q05027 FPR4YLR449W 1179 nt13.54□□□□□ -0.24
TAF9Q05027 DAL1YIR027C 1383 nt13.54□□□□□ -0.24
TAF9Q05027 HOM6YJR139C 1080 nt13.52□□□□□ -0.25
TAF9Q05027 BDH2YAL061W 1254 nt13.52□□□□□ -0.25
TAF9Q05027 YOR139CYOR139C 393 nt13.47□□□□□ -0.25
TAF9Q05027 MEP2YNL142W 1500 nt13.47□□□□□ -0.25
TAF9Q05027 MNP1YGL068W 585 nt13.45□□□□□ -0.26
TAF9Q05027 YBL100CYBL100C 315 nt13.43□□□□□ -0.26
TAF9Q05027 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.41□□□□□ -0.26
TAF9Q05027 PHO4YFR034C 939 nt13.39□□□□□ -0.27
TAF9Q05027 BDF1YLR399C 2061 nt13.38□□□□□ -0.27
TAF9Q05027 NPL3YDR432W 1245 nt13.37□□□□□ -0.27
TAF9Q05027 LSM3YLR438C-A 270 nt13.37□□□□□ -0.27
TAF9Q05027 RKM5YLR137W 1104 nt13.33□□□□□ -0.28
TAF9Q05027 DCW1YKL046C 1350 nt13.32□□□□□ -0.28
TAF9Q05027 YPS1YLR120C 1710 nt13.3□□□□□ -0.28
TAF9Q05027 TRM9YML014W 840 nt13.29□□□□□ -0.28
TAF9Q05027 FUN26YAL022C 1554 nt13.28□□□□□ -0.28
TAF9Q05027 YOL037CYOL037C 354 nt13.26□□□□□ -0.29
TAF9Q05027 TAT1YBR069C 1860 nt13.16□□□□□ -0.3
TAF9Q05027 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.15□□□□□ -0.3
TAF9Q05027 YDR095CYDR095C 411 nt13.12□□□□□ -0.31
TAF9Q05027 CCT6YDR188W 1641 nt13.12□□□□□ -0.31
TAF9Q05027 ALF1YNL148C 765 nt13.08□□□□□ -0.32
TAF9Q05027 EMI2YDR516C 1503 nt13.06□□□□□ -0.32
TAF9Q05027 YBR220CYBR220C 1683 nt13.02□□□□□ -0.32
TAF9Q05027 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.02□□□□□ -0.33
TAF9Q05027 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.02□□□□□ -0.33
TAF9Q05027 YLR281CYLR281C 468 nt12.98□□□□□ -0.33
TAF9Q05027 CAC2YML102W 1407 nt12.97□□□□□ -0.33
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