Protein–RNA interactions for Protein: Q12030

TAF10, Transcription initiation factor TFIID subunit 10, yeastyeast

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF10Q12030 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.67■■□□□ 1.06
TAF10Q12030 NSR1YGR159C 1245 nt21.4■■□□□ 1.02
TAF10Q12030 NOP1YDL014W 984 nt21.24■□□□□ 0.99
TAF10Q12030 YKL036CYKL036C 393 nt19.74■□□□□ 0.75
TAF10Q12030 MDJ1YFL016C 1536 nt18.69■□□□□ 0.58
TAF10Q12030 Q0297Q0297 156 nt18.61■□□□□ 0.57
TAF10Q12030 SRX1YKL086W 384 nt18.51■□□□□ 0.55
TAF10Q12030 YJL027CYJL027C 417 nt18.46■□□□□ 0.55
TAF10Q12030 SCS3YGL126W 1143 nt18.02■□□□□ 0.48
TAF10Q12030 YCR051WYCR051W 669 nt17.56■□□□□ 0.4
TAF10Q12030 YOL085CYOL085C 342 nt17.05■□□□□ 0.32
TAF10Q12030 PKP1YIL042C 1185 nt16.72■□□□□ 0.27
TAF10Q12030 RPP1BYDL130W 321 nt16.7■□□□□ 0.26
TAF10Q12030 DBP2YNL112W 1641 nt16.61■□□□□ 0.25
TAF10Q12030 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.58■□□□□ 0.24
TAF10Q12030 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.58■□□□□ 0.24
TAF10Q12030 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.58■□□□□ 0.24
TAF10Q12030 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.58■□□□□ 0.24
TAF10Q12030 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.58■□□□□ 0.24
TAF10Q12030 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.58■□□□□ 0.24
TAF10Q12030 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.58■□□□□ 0.24
TAF10Q12030 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.58■□□□□ 0.24
TAF10Q12030 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.58■□□□□ 0.24
TAF10Q12030 CCC1YLR220W 969 nt16.4■□□□□ 0.22
TAF10Q12030 SCJ1YMR214W 1134 nt16.33■□□□□ 0.2
TAF10Q12030 ATS1YAL020C 1002 nt16.19■□□□□ 0.18
TAF10Q12030 YBR190WYBR190W 312 nt16.05■□□□□ 0.16
TAF10Q12030 PET122YER153C 765 nt15.87■□□□□ 0.13
TAF10Q12030 SCR1SCR1 522 nt15.87■□□□□ 0.13
TAF10Q12030 RVS167YDR388W 1449 nt15.83■□□□□ 0.12
TAF10Q12030 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.76■□□□□ 0.11
TAF10Q12030 RTC3YHR087W 336 nt15.72■□□□□ 0.11
TAF10Q12030 RRN5YLR141W 1092 nt15.45■□□□□ 0.06
TAF10Q12030 SSA3YBL075C 1950 nt15.41■□□□□ 0.06
TAF10Q12030 YDJ1YNL064C 1230 nt15.28■□□□□ 0.04
TAF10Q12030 SHR5YOL110W 714 nt15.27■□□□□ 0.04
TAF10Q12030 RSB1YOR049C 1065 nt15.23■□□□□ 0.03
TAF10Q12030 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.15■□□□□ 0.02
TAF10Q12030 PUT4YOR348C 1884 nt15.01□□□□□ -0.01
TAF10Q12030 PST2YDR032C 597 nt14.95□□□□□ -0.02
TAF10Q12030 GAR1YHR089C 618 nt14.86□□□□□ -0.03
TAF10Q12030 DEP1YAL013W 1218 nt14.69□□□□□ -0.06
TAF10Q12030 URN1YPR152C 1398 nt14.68□□□□□ -0.06
TAF10Q12030 RPN10YHR200W 807 nt14.62□□□□□ -0.07
TAF10Q12030 YNL208WYNL208W 600 nt14.57□□□□□ -0.08
TAF10Q12030 ARE1YCR048W 1833 nt14.56□□□□□ -0.08
TAF10Q12030 POA1YBR022W 534 nt14.53□□□□□ -0.08
TAF10Q12030 YKL097CYKL097C 411 nt14.51□□□□□ -0.09
TAF10Q12030 OPI9YLR338W 858 nt14.45□□□□□ -0.1
TAF10Q12030 SAH1YER043C 1350 nt14.44□□□□□ -0.1
TAF10Q12030 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.4□□□□□ -0.1
TAF10Q12030 TIR1YER011W 765 nt14.37□□□□□ -0.11
TAF10Q12030 BSC6YOL137W 1494 nt14.31□□□□□ -0.12
TAF10Q12030 SHU1YHL006C 453 nt14.26□□□□□ -0.13
TAF10Q12030 SSA1YAL005C 1929 nt14.09□□□□□ -0.15
TAF10Q12030 PUN1YLR414C 792 nt14.07□□□□□ -0.16
TAF10Q12030 BUD23YCR047C 828 nt14.06□□□□□ -0.16
TAF10Q12030 YJR018WYJR018W 363 nt14.04□□□□□ -0.16
TAF10Q12030 SPT5YML010W 3192 nt13.99□□□□□ -0.17
TAF10Q12030 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.94□□□□□ -0.18
TAF10Q12030 PTC2YER089C 1395 nt13.89□□□□□ -0.19
TAF10Q12030 RPP2BYDR382W 333 nt13.89□□□□□ -0.19
TAF10Q12030 YGR021WYGR021W 873 nt13.83□□□□□ -0.2
TAF10Q12030 SSA4YER103W 1929 nt13.83□□□□□ -0.2
TAF10Q12030 YOR139CYOR139C 393 nt13.81□□□□□ -0.2
TAF10Q12030 SRB2YHR041C 633 nt13.8□□□□□ -0.2
TAF10Q12030 NAB2YGL122C 1578 nt13.78□□□□□ -0.2
TAF10Q12030 YJR120WYJR120W 351 nt13.76□□□□□ -0.21
TAF10Q12030 NPL3YDR432W 1245 nt13.75□□□□□ -0.21
TAF10Q12030 WWM1YFL010C 636 nt13.73□□□□□ -0.21
TAF10Q12030 HOM6YJR139C 1080 nt13.7□□□□□ -0.22
TAF10Q12030 MNP1YGL068W 585 nt13.62□□□□□ -0.23
TAF10Q12030 YOL037CYOL037C 354 nt13.6□□□□□ -0.23
TAF10Q12030 BDH2YAL061W 1254 nt13.59□□□□□ -0.23
TAF10Q12030 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.58□□□□□ -0.24
TAF10Q12030 INM2YDR287W 879 nt13.56□□□□□ -0.24
TAF10Q12030 FIS1YIL065C 468 nt13.51□□□□□ -0.25
TAF10Q12030 RKM5YLR137W 1104 nt13.51□□□□□ -0.25
TAF10Q12030 FPR4YLR449W 1179 nt13.5□□□□□ -0.25
TAF10Q12030 DAL1YIR027C 1383 nt13.49□□□□□ -0.25
TAF10Q12030 LSM3YLR438C-A 270 nt13.49□□□□□ -0.25
TAF10Q12030 MEP2YNL142W 1500 nt13.48□□□□□ -0.25
TAF10Q12030 YBL100CYBL100C 315 nt13.42□□□□□ -0.26
TAF10Q12030 PHO4YFR034C 939 nt13.36□□□□□ -0.27
TAF10Q12030 BDF1YLR399C 2061 nt13.32□□□□□ -0.28
TAF10Q12030 TRM9YML014W 840 nt13.32□□□□□ -0.28
TAF10Q12030 YPS1YLR120C 1710 nt13.29□□□□□ -0.28
TAF10Q12030 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.28□□□□□ -0.28
TAF10Q12030 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.28□□□□□ -0.28
TAF10Q12030 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.28□□□□□ -0.28
TAF10Q12030 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.28□□□□□ -0.28
TAF10Q12030 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.28□□□□□ -0.28
TAF10Q12030 DCW1YKL046C 1350 nt13.26□□□□□ -0.29
TAF10Q12030 FUN26YAL022C 1554 nt13.25□□□□□ -0.29
TAF10Q12030 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.23□□□□□ -0.29
TAF10Q12030 YLR281CYLR281C 468 nt13.21□□□□□ -0.29
TAF10Q12030 CCT6YDR188W 1641 nt13.15□□□□□ -0.3
TAF10Q12030 PUS2YGL063W 1113 nt13.14□□□□□ -0.31
TAF10Q12030 TAT1YBR069C 1860 nt13.14□□□□□ -0.31
TAF10Q12030 WHI5YOR083W 888 nt13.13□□□□□ -0.31
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