Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 NSR1YGR159C 1245 nt21.16■□□□□ 0.98
RIO1Q12196 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.99■□□□□ 0.95
RIO1Q12196 NOP1YDL014W 984 nt20.23■□□□□ 0.83
RIO1Q12196 MDJ1YFL016C 1536 nt19.2■□□□□ 0.66
RIO1Q12196 YKL036CYKL036C 393 nt18.26■□□□□ 0.51
RIO1Q12196 YJL027CYJL027C 417 nt17.71■□□□□ 0.43
RIO1Q12196 SRX1YKL086W 384 nt17.63■□□□□ 0.41
RIO1Q12196 Q0297Q0297 156 nt17.51■□□□□ 0.39
RIO1Q12196 DBP2YNL112W 1641 nt16.76■□□□□ 0.27
RIO1Q12196 YCR051WYCR051W 669 nt16.75■□□□□ 0.27
RIO1Q12196 YBR190WYBR190W 312 nt16.47■□□□□ 0.23
RIO1Q12196 SCS3YGL126W 1143 nt16.38■□□□□ 0.21
RIO1Q12196 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.18■□□□□ 0.18
RIO1Q12196 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.18■□□□□ 0.18
RIO1Q12196 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.18■□□□□ 0.18
RIO1Q12196 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.18■□□□□ 0.18
RIO1Q12196 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.18■□□□□ 0.18
RIO1Q12196 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.18■□□□□ 0.18
RIO1Q12196 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.18■□□□□ 0.18
RIO1Q12196 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.18■□□□□ 0.18
RIO1Q12196 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.18■□□□□ 0.18
RIO1Q12196 RTC3YHR087W 336 nt16.15■□□□□ 0.18
RIO1Q12196 CCC1YLR220W 969 nt16.07■□□□□ 0.16
RIO1Q12196 YOL085CYOL085C 342 nt15.8■□□□□ 0.12
RIO1Q12196 RVS167YDR388W 1449 nt15.77■□□□□ 0.12
RIO1Q12196 RPP1BYDL130W 321 nt15.74■□□□□ 0.11
RIO1Q12196 PKP1YIL042C 1185 nt15.64■□□□□ 0.09
RIO1Q12196 SCJ1YMR214W 1134 nt15.54■□□□□ 0.08
RIO1Q12196 PUT4YOR348C 1884 nt15.23■□□□□ 0.03
RIO1Q12196 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.18■□□□□ 0.02
RIO1Q12196 SSA3YBL075C 1950 nt15.18■□□□□ 0.02
RIO1Q12196 PET122YER153C 765 nt15.09■□□□□ 0.01
RIO1Q12196 SHR5YOL110W 714 nt15.08■□□□□ 0
RIO1Q12196 URN1YPR152C 1398 nt14.93□□□□□ -0.02
RIO1Q12196 SCR1SCR1 522 nt14.85□□□□□ -0.03
RIO1Q12196 ARE1YCR048W 1833 nt14.84□□□□□ -0.03
RIO1Q12196 DEP1YAL013W 1218 nt14.82□□□□□ -0.04
RIO1Q12196 SAH1YER043C 1350 nt14.79□□□□□ -0.04
RIO1Q12196 OPI9YLR338W 858 nt14.77□□□□□ -0.05
RIO1Q12196 POA1YBR022W 534 nt14.76□□□□□ -0.05
RIO1Q12196 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.71□□□□□ -0.05
RIO1Q12196 YDJ1YNL064C 1230 nt14.68□□□□□ -0.06
RIO1Q12196 RPN10YHR200W 807 nt14.65□□□□□ -0.06
RIO1Q12196 RRN5YLR141W 1092 nt14.6□□□□□ -0.07
RIO1Q12196 YNL208WYNL208W 600 nt14.53□□□□□ -0.08
RIO1Q12196 BSC6YOL137W 1494 nt14.52□□□□□ -0.08
RIO1Q12196 ATS1YAL020C 1002 nt14.52□□□□□ -0.09
RIO1Q12196 GAR1YHR089C 618 nt14.45□□□□□ -0.1
RIO1Q12196 BUD23YCR047C 828 nt14.37□□□□□ -0.11
RIO1Q12196 PUN1YLR414C 792 nt14.36□□□□□ -0.11
RIO1Q12196 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.3□□□□□ -0.12
RIO1Q12196 PTC2YER089C 1395 nt14.25□□□□□ -0.13
RIO1Q12196 RSB1YOR049C 1065 nt14.22□□□□□ -0.13
RIO1Q12196 YJR018WYJR018W 363 nt14.21□□□□□ -0.13
RIO1Q12196 NAB2YGL122C 1578 nt14.12□□□□□ -0.15
RIO1Q12196 SPT5YML010W 3192 nt14□□□□□ -0.17
RIO1Q12196 TIR1YER011W 765 nt13.97□□□□□ -0.17
RIO1Q12196 FPR4YLR449W 1179 nt13.87□□□□□ -0.19
RIO1Q12196 SSA1YAL005C 1929 nt13.86□□□□□ -0.19
RIO1Q12196 FIS1YIL065C 468 nt13.86□□□□□ -0.19
RIO1Q12196 DAL1YIR027C 1383 nt13.85□□□□□ -0.19
RIO1Q12196 RPP2BYDR382W 333 nt13.85□□□□□ -0.19
RIO1Q12196 YJR120WYJR120W 351 nt13.83□□□□□ -0.2
RIO1Q12196 SSA4YER103W 1929 nt13.8□□□□□ -0.2
RIO1Q12196 INM2YDR287W 879 nt13.75□□□□□ -0.21
RIO1Q12196 PHO4YFR034C 939 nt13.73□□□□□ -0.21
RIO1Q12196 MEP2YNL142W 1500 nt13.66□□□□□ -0.22
RIO1Q12196 YBL100CYBL100C 315 nt13.58□□□□□ -0.24
RIO1Q12196 YPS1YLR120C 1710 nt13.58□□□□□ -0.24
RIO1Q12196 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.52□□□□□ -0.25
RIO1Q12196 SRB2YHR041C 633 nt13.51□□□□□ -0.25
RIO1Q12196 PST2YDR032C 597 nt13.49□□□□□ -0.25
RIO1Q12196 BDH2YAL061W 1254 nt13.46□□□□□ -0.25
RIO1Q12196 DCW1YKL046C 1350 nt13.44□□□□□ -0.26
RIO1Q12196 YDR095CYDR095C 411 nt13.43□□□□□ -0.26
RIO1Q12196 FUN26YAL022C 1554 nt13.38□□□□□ -0.27
RIO1Q12196 ALF1YNL148C 765 nt13.32□□□□□ -0.28
RIO1Q12196 TRM9YML014W 840 nt13.3□□□□□ -0.28
RIO1Q12196 WWM1YFL010C 636 nt13.29□□□□□ -0.28
RIO1Q12196 EMI2YDR516C 1503 nt13.27□□□□□ -0.29
RIO1Q12196 YMR090WYMR090W 684 nt13.26□□□□□ -0.29
RIO1Q12196 BDF1YLR399C 2061 nt13.24□□□□□ -0.29
RIO1Q12196 RPP2AYOL039W 321 nt13.2□□□□□ -0.3
RIO1Q12196 LSM3YLR438C-A 270 nt13.19□□□□□ -0.3
RIO1Q12196 CCT6YDR188W 1641 nt13.14□□□□□ -0.31
RIO1Q12196 YDL221WYDL221W 552 nt13.13□□□□□ -0.31
RIO1Q12196 PTP1YDL230W 1008 nt13.13□□□□□ -0.31
RIO1Q12196 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.12□□□□□ -0.31
RIO1Q12196 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.12□□□□□ -0.31
RIO1Q12196 CAC2YML102W 1407 nt13.12□□□□□ -0.31
RIO1Q12196 YBR220CYBR220C 1683 nt13.12□□□□□ -0.31
RIO1Q12196 YGR021WYGR021W 873 nt13.11□□□□□ -0.31
RIO1Q12196 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.08□□□□□ -0.32
RIO1Q12196 TAT1YBR069C 1860 nt13.08□□□□□ -0.32
RIO1Q12196 SHU1YHL006C 453 nt13.06□□□□□ -0.32
RIO1Q12196 SIS1YNL007C 1059 nt13.05□□□□□ -0.32
RIO1Q12196 SDH1YKL148C 1923 nt13.03□□□□□ -0.32
RIO1Q12196 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.02□□□□□ -0.33
RIO1Q12196 HOM6YJR139C 1080 nt12.99□□□□□ -0.33
RIO1Q12196 IRC15YPL017C 1500 nt12.92□□□□□ -0.34
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