Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

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Length 1,114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.87■■□□□ 1.25
SMC6Q12749 NSR1YGR159C 1245 nt22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q12749 NOP1YDL014W 984 nt22.27■■□□□ 1.16
SMC6Q12749 YKL036CYKL036C 393 nt20.56■□□□□ 0.88
SMC6Q12749 MDJ1YFL016C 1536 nt20.12■□□□□ 0.81
SMC6Q12749 Q0297Q0297 156 nt19.48■□□□□ 0.71
SMC6Q12749 SRX1YKL086W 384 nt19.44■□□□□ 0.7
SMC6Q12749 YJL027CYJL027C 417 nt19.2■□□□□ 0.66
SMC6Q12749 SCS3YGL126W 1143 nt18.71■□□□□ 0.59
SMC6Q12749 YCR051WYCR051W 669 nt18.46■□□□□ 0.55
SMC6Q12749 DBP2YNL112W 1641 nt17.81■□□□□ 0.44
SMC6Q12749 YOL085CYOL085C 342 nt17.81■□□□□ 0.44
SMC6Q12749 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.55■□□□□ 0.4
SMC6Q12749 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.55■□□□□ 0.4
SMC6Q12749 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.55■□□□□ 0.4
SMC6Q12749 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.55■□□□□ 0.4
SMC6Q12749 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.55■□□□□ 0.4
SMC6Q12749 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.55■□□□□ 0.4
SMC6Q12749 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.55■□□□□ 0.4
SMC6Q12749 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.55■□□□□ 0.4
SMC6Q12749 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.55■□□□□ 0.4
SMC6Q12749 PKP1YIL042C 1185 nt17.53■□□□□ 0.4
SMC6Q12749 RPP1BYDL130W 321 nt17.49■□□□□ 0.39
SMC6Q12749 CCC1YLR220W 969 nt17.39■□□□□ 0.37
SMC6Q12749 YBR190WYBR190W 312 nt17.16■□□□□ 0.34
SMC6Q12749 RTC3YHR087W 336 nt16.79■□□□□ 0.28
SMC6Q12749 RVS167YDR388W 1449 nt16.79■□□□□ 0.28
SMC6Q12749 ATS1YAL020C 1002 nt16.76■□□□□ 0.27
SMC6Q12749 PET122YER153C 765 nt16.69■□□□□ 0.26
SMC6Q12749 SCJ1YMR214W 1134 nt16.67■□□□□ 0.26
SMC6Q12749 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.62■□□□□ 0.25
SMC6Q12749 SCR1SCR1 522 nt16.55■□□□□ 0.24
SMC6Q12749 RRN5YLR141W 1092 nt16.23■□□□□ 0.19
SMC6Q12749 SHR5YOL110W 714 nt16.19■□□□□ 0.18
SMC6Q12749 YDJ1YNL064C 1230 nt16.07■□□□□ 0.16
SMC6Q12749 SSA3YBL075C 1950 nt15.97■□□□□ 0.15
SMC6Q12749 RSB1YOR049C 1065 nt15.91■□□□□ 0.14
SMC6Q12749 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.9■□□□□ 0.14
SMC6Q12749 GAR1YHR089C 618 nt15.72■□□□□ 0.11
SMC6Q12749 DEP1YAL013W 1218 nt15.72■□□□□ 0.11
SMC6Q12749 URN1YPR152C 1398 nt15.72■□□□□ 0.11
SMC6Q12749 PUT4YOR348C 1884 nt15.54■□□□□ 0.08
SMC6Q12749 PST2YDR032C 597 nt15.51■□□□□ 0.07
SMC6Q12749 RPN10YHR200W 807 nt15.5■□□□□ 0.07
SMC6Q12749 YNL208WYNL208W 600 nt15.49■□□□□ 0.07
SMC6Q12749 OPI9YLR338W 858 nt15.48■□□□□ 0.07
SMC6Q12749 SAH1YER043C 1350 nt15.38■□□□□ 0.05
SMC6Q12749 ARE1YCR048W 1833 nt15.28■□□□□ 0.04
SMC6Q12749 TIR1YER011W 765 nt15.19■□□□□ 0.02
SMC6Q12749 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.08■□□□□ 0
SMC6Q12749 POA1YBR022W 534 nt15.08■□□□□ 0
SMC6Q12749 PUN1YLR414C 792 nt15.04■□□□□ -0
SMC6Q12749 YJR018WYJR018W 363 nt15□□□□□ -0.01
SMC6Q12749 SSA1YAL005C 1929 nt15□□□□□ -0.01
SMC6Q12749 YKL097CYKL097C 411 nt14.92□□□□□ -0.02
SMC6Q12749 SHU1YHL006C 453 nt14.87□□□□□ -0.03
SMC6Q12749 PTC2YER089C 1395 nt14.85□□□□□ -0.03
SMC6Q12749 BUD23YCR047C 828 nt14.75□□□□□ -0.05
SMC6Q12749 YJR120WYJR120W 351 nt14.75□□□□□ -0.05
SMC6Q12749 SRB2YHR041C 633 nt14.74□□□□□ -0.05
SMC6Q12749 BSC6YOL137W 1494 nt14.73□□□□□ -0.05
SMC6Q12749 RPP2BYDR382W 333 nt14.72□□□□□ -0.05
SMC6Q12749 NAB2YGL122C 1578 nt14.65□□□□□ -0.06
SMC6Q12749 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.63□□□□□ -0.07
SMC6Q12749 WWM1YFL010C 636 nt14.52□□□□□ -0.09
SMC6Q12749 INM2YDR287W 879 nt14.47□□□□□ -0.09
SMC6Q12749 DAL1YIR027C 1383 nt14.47□□□□□ -0.09
SMC6Q12749 YGR021WYGR021W 873 nt14.45□□□□□ -0.1
SMC6Q12749 FPR4YLR449W 1179 nt14.44□□□□□ -0.1
SMC6Q12749 FIS1YIL065C 468 nt14.43□□□□□ -0.1
SMC6Q12749 BDH2YAL061W 1254 nt14.42□□□□□ -0.1
SMC6Q12749 HOM6YJR139C 1080 nt14.4□□□□□ -0.1
SMC6Q12749 MNP1YGL068W 585 nt14.33□□□□□ -0.12
SMC6Q12749 YBL100CYBL100C 315 nt14.33□□□□□ -0.12
SMC6Q12749 PHO4YFR034C 939 nt14.32□□□□□ -0.12
SMC6Q12749 YOR139CYOR139C 393 nt14.3□□□□□ -0.12
SMC6Q12749 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.29□□□□□ -0.12
SMC6Q12749 LSM3YLR438C-A 270 nt14.25□□□□□ -0.13
SMC6Q12749 NPL3YDR432W 1245 nt14.19□□□□□ -0.14
SMC6Q12749 RKM5YLR137W 1104 nt14.19□□□□□ -0.14
SMC6Q12749 FUN26YAL022C 1554 nt14.17□□□□□ -0.14
SMC6Q12749 SPT5YML010W 3192 nt14.16□□□□□ -0.14
SMC6Q12749 TRM9YML014W 840 nt14.15□□□□□ -0.14
SMC6Q12749 YOL037CYOL037C 354 nt14.11□□□□□ -0.15
SMC6Q12749 SSA4YER103W 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
SMC6Q12749 YPS1YLR120C 1710 nt14.03□□□□□ -0.16
SMC6Q12749 CCT6YDR188W 1641 nt14□□□□□ -0.17
SMC6Q12749 ALF1YNL148C 765 nt13.96□□□□□ -0.17
SMC6Q12749 YDR095CYDR095C 411 nt13.94□□□□□ -0.18
SMC6Q12749 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SMC6Q12749 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SMC6Q12749 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.88□□□□□ -0.19
SMC6Q12749 MEP2YNL142W 1500 nt13.82□□□□□ -0.2
SMC6Q12749 YLR281CYLR281C 468 nt13.79□□□□□ -0.2
SMC6Q12749 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SMC6Q12749 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SMC6Q12749 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SMC6Q12749 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SMC6Q12749 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.75□□□□□ -0.21
SMC6Q12749 SIS1YNL007C 1059 nt13.74□□□□□ -0.21
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