RNA–Protein interactions for RNA: YLR073C

RFU1, Transcript of Protein that inhibits Doa4p deubiquitinating activity, yeast

Gene RFU1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFU1	YLR073C	RIM20	Q12033	661 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	HFI1	Q12060	488 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	SKM1	Q12469	655 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	MSP1	P28737	362 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	HEL1	P36113	551 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	MED6	P38782	295 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	SFB3	P38810	929 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	OSW5	P40219	148 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
RFU1	YLR073C	RAD17	P48581	401 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	HNT2	P49775	206 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	NIT3	P49954	291 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	HFM1	P51979	1187 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	TEL2	P53038	688 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	YNR068C	P53754	272 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	BSC5	P53755	489 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	STP1	Q00947	519 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	INP2	Q03824	705 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	NHX1	Q04121	633 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	EST2	Q06163	884 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
RFU1	YLR073C	SKS1	Q12505	502 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFU1	YLR073C	PHO5	P00635	467 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	COX4	P04037	155 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HSF1	P10961	833 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CLN3	P13365	580 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	GLN3	P18494	730 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	OCA4	P25366	362 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YRO2	P38079	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	GIP1	P38229	639 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ATG14	P38270	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	COS111	P38308	924 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PIH1	P38768	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YJL070C	P40361	888 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SGF73	P53165	657 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SSL2	Q00578	843 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	OMS1	Q06668	471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	TPK1	P06244	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HAP2	P06774	265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PCK1	P10963	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SPO11	P23179	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CLB3	P24870	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
RFU1	YLR073C	MRPL40	P36534	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SIF2	P38262	535 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	AKR1	P39010	764 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	GAA1	P39012	614 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	FIS1	P40515	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	THI6	P41835	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CTF18	P49956	741 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	STB4	P50104	949 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SHE4	P51534	789 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	TAD1	P53065	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	RPN14	P53196	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YGR266W	P53326	701 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	TOF1	P53840	1238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ATP25	Q03153	612 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	MCH5	Q08777	521 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	NBP2	Q12163	236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HER1	Q12276	1246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	APM4	Q99186	491 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.3 ms