Protein–RNA interactions for Protein: Q12471

PFK27, 6-phosphofructo-2-kinase 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFK27Q12471 NSR1YGR159C 1245 nt19.22■□□□□ 0.67
PFK27Q12471 YML009W-BYML009W-B 477 nt19■□□□□ 0.63
PFK27Q12471 NOP1YDL014W 984 nt18.29■□□□□ 0.52
PFK27Q12471 MDJ1YFL016C 1536 nt17.46■□□□□ 0.39
PFK27Q12471 YKL036CYKL036C 393 nt16.5■□□□□ 0.23
PFK27Q12471 YJL027CYJL027C 417 nt16.07■□□□□ 0.16
PFK27Q12471 SRX1YKL086W 384 nt15.98■□□□□ 0.15
PFK27Q12471 Q0297Q0297 156 nt15.87■□□□□ 0.13
PFK27Q12471 DBP2YNL112W 1641 nt15.28■□□□□ 0.04
PFK27Q12471 YCR051WYCR051W 669 nt15.14■□□□□ 0.01
PFK27Q12471 YBR190WYBR190W 312 nt14.99□□□□□ -0.01
PFK27Q12471 SCS3YGL126W 1143 nt14.81□□□□□ -0.04
PFK27Q12471 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.7□□□□□ -0.06
PFK27Q12471 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.7□□□□□ -0.06
PFK27Q12471 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.7□□□□□ -0.06
PFK27Q12471 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.7□□□□□ -0.06
PFK27Q12471 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.7□□□□□ -0.06
PFK27Q12471 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.7□□□□□ -0.06
PFK27Q12471 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.7□□□□□ -0.06
PFK27Q12471 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.7□□□□□ -0.06
PFK27Q12471 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.7□□□□□ -0.06
PFK27Q12471 RTC3YHR087W 336 nt14.63□□□□□ -0.07
PFK27Q12471 CCC1YLR220W 969 nt14.54□□□□□ -0.08
PFK27Q12471 YOL085CYOL085C 342 nt14.3□□□□□ -0.12
PFK27Q12471 RVS167YDR388W 1449 nt14.28□□□□□ -0.12
PFK27Q12471 RPP1BYDL130W 321 nt14.24□□□□□ -0.13
PFK27Q12471 PKP1YIL042C 1185 nt14.14□□□□□ -0.15
PFK27Q12471 SCJ1YMR214W 1134 nt14.12□□□□□ -0.15
PFK27Q12471 SSA3YBL075C 1950 nt13.99□□□□□ -0.17
PFK27Q12471 PUT4YOR348C 1884 nt13.93□□□□□ -0.18
PFK27Q12471 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.76□□□□□ -0.21
PFK27Q12471 SHR5YOL110W 714 nt13.68□□□□□ -0.22
PFK27Q12471 PET122YER153C 765 nt13.67□□□□□ -0.22
PFK27Q12471 ARE1YCR048W 1833 nt13.56□□□□□ -0.24
PFK27Q12471 URN1YPR152C 1398 nt13.56□□□□□ -0.24
PFK27Q12471 SAH1YER043C 1350 nt13.46□□□□□ -0.25
PFK27Q12471 POA1YBR022W 534 nt13.46□□□□□ -0.25
PFK27Q12471 OPI9YLR338W 858 nt13.44□□□□□ -0.26
PFK27Q12471 DEP1YAL013W 1218 nt13.43□□□□□ -0.26
PFK27Q12471 SCR1SCR1 522 nt13.41□□□□□ -0.26
PFK27Q12471 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.38□□□□□ -0.27
PFK27Q12471 ATS1YAL020C 1002 nt13.32□□□□□ -0.28
PFK27Q12471 YDJ1YNL064C 1230 nt13.31□□□□□ -0.28
PFK27Q12471 RPN10YHR200W 807 nt13.25□□□□□ -0.29
PFK27Q12471 BSC6YOL137W 1494 nt13.24□□□□□ -0.29
PFK27Q12471 RRN5YLR141W 1092 nt13.22□□□□□ -0.29
PFK27Q12471 YNL208WYNL208W 600 nt13.17□□□□□ -0.3
PFK27Q12471 GAR1YHR089C 618 nt13.09□□□□□ -0.31
PFK27Q12471 BUD23YCR047C 828 nt13.04□□□□□ -0.32
PFK27Q12471 PUN1YLR414C 792 nt13.04□□□□□ -0.32
PFK27Q12471 PTC2YER089C 1395 nt12.96□□□□□ -0.33
PFK27Q12471 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.95□□□□□ -0.34
PFK27Q12471 SPT5YML010W 3192 nt12.93□□□□□ -0.34
PFK27Q12471 YJR018WYJR018W 363 nt12.9□□□□□ -0.34
PFK27Q12471 NAB2YGL122C 1578 nt12.85□□□□□ -0.35
PFK27Q12471 RSB1YOR049C 1065 nt12.83□□□□□ -0.36
PFK27Q12471 TIR1YER011W 765 nt12.67□□□□□ -0.38
PFK27Q12471 SSA4YER103W 1929 nt12.66□□□□□ -0.38
PFK27Q12471 FIS1YIL065C 468 nt12.63□□□□□ -0.39
PFK27Q12471 YJR120WYJR120W 351 nt12.62□□□□□ -0.39
PFK27Q12471 SSA1YAL005C 1929 nt12.61□□□□□ -0.39
PFK27Q12471 DAL1YIR027C 1383 nt12.6□□□□□ -0.39
PFK27Q12471 FPR4YLR449W 1179 nt12.56□□□□□ -0.4
PFK27Q12471 RPP2BYDR382W 333 nt12.53□□□□□ -0.4
PFK27Q12471 INM2YDR287W 879 nt12.49□□□□□ -0.41
PFK27Q12471 PHO4YFR034C 939 nt12.48□□□□□ -0.41
PFK27Q12471 MEP2YNL142W 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
PFK27Q12471 YPS1YLR120C 1710 nt12.39□□□□□ -0.43
PFK27Q12471 SRB2YHR041C 633 nt12.32□□□□□ -0.44
PFK27Q12471 YBL100CYBL100C 315 nt12.31□□□□□ -0.44
PFK27Q12471 PST2YDR032C 597 nt12.29□□□□□ -0.44
PFK27Q12471 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.28□□□□□ -0.44
PFK27Q12471 DCW1YKL046C 1350 nt12.28□□□□□ -0.44
PFK27Q12471 YDR095CYDR095C 411 nt12.24□□□□□ -0.45
PFK27Q12471 BDH2YAL061W 1254 nt12.22□□□□□ -0.45
PFK27Q12471 BDF1YLR399C 2061 nt12.22□□□□□ -0.45
PFK27Q12471 Q0182Q0182 405 nt12.16□□□□□ -0.46
PFK27Q12471 FUN26YAL022C 1554 nt12.15□□□□□ -0.46
PFK27Q12471 EMI2YDR516C 1503 nt12.11□□□□□ -0.47
PFK27Q12471 ALF1YNL148C 765 nt12.07□□□□□ -0.48
PFK27Q12471 WWM1YFL010C 636 nt12.05□□□□□ -0.48
PFK27Q12471 TRM9YML014W 840 nt12.05□□□□□ -0.48
PFK27Q12471 YMR090WYMR090W 684 nt12.05□□□□□ -0.48
PFK27Q12471 TAT1YBR069C 1860 nt12.05□□□□□ -0.48
PFK27Q12471 YBR220CYBR220C 1683 nt12.01□□□□□ -0.49
PFK27Q12471 RPP2AYOL039W 321 nt12.01□□□□□ -0.49
PFK27Q12471 PTP1YDL230W 1008 nt12□□□□□ -0.49
PFK27Q12471 CAC2YML102W 1407 nt11.98□□□□□ -0.49
PFK27Q12471 YDL221WYDL221W 552 nt11.98□□□□□ -0.49
PFK27Q12471 YKL097CYKL097C 411 nt11.97□□□□□ -0.49
PFK27Q12471 LSM3YLR438C-A 270 nt11.97□□□□□ -0.49
PFK27Q12471 CCT6YDR188W 1641 nt11.96□□□□□ -0.5
PFK27Q12471 SDH1YKL148C 1923 nt11.92□□□□□ -0.5
PFK27Q12471 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.89□□□□□ -0.51
PFK27Q12471 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.89□□□□□ -0.51
PFK27Q12471 SIS1YNL007C 1059 nt11.89□□□□□ -0.51
PFK27Q12471 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.85□□□□□ -0.51
PFK27Q12471 YGR021WYGR021W 873 nt11.85□□□□□ -0.51
PFK27Q12471 SHU1YHL006C 453 nt11.83□□□□□ -0.52
PFK27Q12471 IRC15YPL017C 1500 nt11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms