Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

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Length 1,030 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.72■□□□□ 0.75
HAL9Q12180 NSR1YGR159C 1245 nt19.59■□□□□ 0.73
HAL9Q12180 NOP1YDL014W 984 nt19.16■□□□□ 0.66
HAL9Q12180 YKL036CYKL036C 393 nt17.71■□□□□ 0.43
HAL9Q12180 MDJ1YFL016C 1536 nt17.4■□□□□ 0.38
HAL9Q12180 Q0297Q0297 156 nt16.81■□□□□ 0.28
HAL9Q12180 SRX1YKL086W 384 nt16.77■□□□□ 0.28
HAL9Q12180 YJL027CYJL027C 417 nt16.53■□□□□ 0.24
HAL9Q12180 SCS3YGL126W 1143 nt16.15■□□□□ 0.18
HAL9Q12180 YCR051WYCR051W 669 nt15.89■□□□□ 0.13
HAL9Q12180 DBP2YNL112W 1641 nt15.43■□□□□ 0.06
HAL9Q12180 YOL085CYOL085C 342 nt15.35■□□□□ 0.05
HAL9Q12180 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.16■□□□□ 0.02
HAL9Q12180 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.16■□□□□ 0.02
HAL9Q12180 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.16■□□□□ 0.02
HAL9Q12180 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.16■□□□□ 0.02
HAL9Q12180 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.16■□□□□ 0.02
HAL9Q12180 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.16■□□□□ 0.02
HAL9Q12180 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.16■□□□□ 0.02
HAL9Q12180 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.16■□□□□ 0.02
HAL9Q12180 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.16■□□□□ 0.02
HAL9Q12180 PKP1YIL042C 1185 nt15.11■□□□□ 0.01
HAL9Q12180 RPP1BYDL130W 321 nt15.08■□□□□ 0
HAL9Q12180 CCC1YLR220W 969 nt14.99□□□□□ -0.01
HAL9Q12180 YBR190WYBR190W 312 nt14.82□□□□□ -0.04
HAL9Q12180 ATS1YAL020C 1002 nt14.49□□□□□ -0.09
HAL9Q12180 SCJ1YMR214W 1134 nt14.48□□□□□ -0.09
HAL9Q12180 RTC3YHR087W 336 nt14.46□□□□□ -0.09
HAL9Q12180 RVS167YDR388W 1449 nt14.44□□□□□ -0.1
HAL9Q12180 PET122YER153C 765 nt14.41□□□□□ -0.1
HAL9Q12180 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.34□□□□□ -0.11
HAL9Q12180 SCR1SCR1 522 nt14.22□□□□□ -0.13
HAL9Q12180 RRN5YLR141W 1092 nt13.99□□□□□ -0.17
HAL9Q12180 SSA3YBL075C 1950 nt13.97□□□□□ -0.17
HAL9Q12180 SHR5YOL110W 714 nt13.97□□□□□ -0.17
HAL9Q12180 YDJ1YNL064C 1230 nt13.87□□□□□ -0.19
HAL9Q12180 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.73□□□□□ -0.21
HAL9Q12180 RSB1YOR049C 1065 nt13.68□□□□□ -0.22
HAL9Q12180 URN1YPR152C 1398 nt13.58□□□□□ -0.24
HAL9Q12180 DEP1YAL013W 1218 nt13.57□□□□□ -0.24
HAL9Q12180 GAR1YHR089C 618 nt13.55□□□□□ -0.24
HAL9Q12180 PUT4YOR348C 1884 nt13.48□□□□□ -0.25
HAL9Q12180 PST2YDR032C 597 nt13.4□□□□□ -0.26
HAL9Q12180 OPI9YLR338W 858 nt13.38□□□□□ -0.27
HAL9Q12180 YNL208WYNL208W 600 nt13.35□□□□□ -0.27
HAL9Q12180 RPN10YHR200W 807 nt13.34□□□□□ -0.27
HAL9Q12180 SAH1YER043C 1350 nt13.3□□□□□ -0.28
HAL9Q12180 ARE1YCR048W 1833 nt13.25□□□□□ -0.29
HAL9Q12180 TIR1YER011W 765 nt13.1□□□□□ -0.31
HAL9Q12180 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.04□□□□□ -0.32
HAL9Q12180 POA1YBR022W 534 nt13.04□□□□□ -0.32
HAL9Q12180 SSA1YAL005C 1929 nt12.97□□□□□ -0.33
HAL9Q12180 PUN1YLR414C 792 nt12.96□□□□□ -0.33
HAL9Q12180 YJR018WYJR018W 363 nt12.94□□□□□ -0.34
HAL9Q12180 YKL097CYKL097C 411 nt12.94□□□□□ -0.34
HAL9Q12180 Q0182Q0182 405 nt12.88□□□□□ -0.35
HAL9Q12180 SHU1YHL006C 453 nt12.83□□□□□ -0.36
HAL9Q12180 PTC2YER089C 1395 nt12.82□□□□□ -0.36
HAL9Q12180 YJR120WYJR120W 351 nt12.81□□□□□ -0.36
HAL9Q12180 SRB2YHR041C 633 nt12.79□□□□□ -0.36
HAL9Q12180 BSC6YOL137W 1494 nt12.76□□□□□ -0.37
HAL9Q12180 BUD23YCR047C 828 nt12.72□□□□□ -0.37
HAL9Q12180 RPP2BYDR382W 333 nt12.66□□□□□ -0.38
HAL9Q12180 NAB2YGL122C 1578 nt12.65□□□□□ -0.38
HAL9Q12180 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.63□□□□□ -0.39
HAL9Q12180 SPT5YML010W 3192 nt12.62□□□□□ -0.39
HAL9Q12180 WWM1YFL010C 636 nt12.54□□□□□ -0.4
HAL9Q12180 FIS1YIL065C 468 nt12.51□□□□□ -0.41
HAL9Q12180 MOT3YMR070W 1473 nt12.5□□□□□ -0.41
HAL9Q12180 DAL1YIR027C 1383 nt12.49□□□□□ -0.41
HAL9Q12180 INM2YDR287W 879 nt12.47□□□□□ -0.41
HAL9Q12180 YGR021WYGR021W 873 nt12.45□□□□□ -0.42
HAL9Q12180 HOM6YJR139C 1080 nt12.44□□□□□ -0.42
HAL9Q12180 BDH2YAL061W 1254 nt12.44□□□□□ -0.42
HAL9Q12180 FPR4YLR449W 1179 nt12.44□□□□□ -0.42
HAL9Q12180 YOR139CYOR139C 393 nt12.4□□□□□ -0.42
HAL9Q12180 SSA4YER103W 1929 nt12.4□□□□□ -0.42
HAL9Q12180 PHO4YFR034C 939 nt12.38□□□□□ -0.43
HAL9Q12180 MNP1YGL068W 585 nt12.38□□□□□ -0.43
HAL9Q12180 YBL100CYBL100C 315 nt12.36□□□□□ -0.43
HAL9Q12180 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.32□□□□□ -0.44
HAL9Q12180 LSM3YLR438C-A 270 nt12.28□□□□□ -0.44
HAL9Q12180 NPL3YDR432W 1245 nt12.27□□□□□ -0.45
HAL9Q12180 RKM5YLR137W 1104 nt12.25□□□□□ -0.45
HAL9Q12180 FUN26YAL022C 1554 nt12.22□□□□□ -0.45
HAL9Q12180 TRM9YML014W 840 nt12.18□□□□□ -0.46
HAL9Q12180 YOL037CYOL037C 354 nt12.16□□□□□ -0.46
HAL9Q12180 YPS1YLR120C 1710 nt12.14□□□□□ -0.47
HAL9Q12180 CCT6YDR188W 1641 nt12.09□□□□□ -0.47
HAL9Q12180 YDR095CYDR095C 411 nt12.07□□□□□ -0.48
HAL9Q12180 MEP2YNL142W 1500 nt12.01□□□□□ -0.49
HAL9Q12180 BDF1YLR399C 2061 nt12.01□□□□□ -0.49
HAL9Q12180 ALF1YNL148C 765 nt12.01□□□□□ -0.49
HAL9Q12180 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.98□□□□□ -0.49
HAL9Q12180 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.95□□□□□ -0.5
HAL9Q12180 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.95□□□□□ -0.5
HAL9Q12180 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.91□□□□□ -0.5
HAL9Q12180 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.91□□□□□ -0.5
HAL9Q12180 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.91□□□□□ -0.5
HAL9Q12180 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.91□□□□□ -0.5
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