Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 NSR1YGR159C 1245 nt18.4■□□□□ 0.54
HER1Q12276 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.39■□□□□ 0.53
HER1Q12276 NOP1YDL014W 984 nt17.89■□□□□ 0.45
HER1Q12276 MDJ1YFL016C 1536 nt17■□□□□ 0.31
HER1Q12276 YKL036CYKL036C 393 nt16.45■□□□□ 0.22
HER1Q12276 Q0297Q0297 156 nt15.64■□□□□ 0.09
HER1Q12276 YJL027CYJL027C 417 nt15.63■□□□□ 0.09
HER1Q12276 SRX1YKL086W 384 nt15.62■□□□□ 0.09
HER1Q12276 SCS3YGL126W 1143 nt15.07■□□□□ 0
HER1Q12276 YCR051WYCR051W 669 nt14.81□□□□□ -0.04
HER1Q12276 DBP2YNL112W 1641 nt14.73□□□□□ -0.05
HER1Q12276 YBR190WYBR190W 312 nt14.66□□□□□ -0.06
HER1Q12276 SSA3YBL075C 1950 nt14.56□□□□□ -0.08
HER1Q12276 RTC3YHR087W 336 nt14.32□□□□□ -0.12
HER1Q12276 YOL085CYOL085C 342 nt14.25□□□□□ -0.13
HER1Q12276 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.15□□□□□ -0.14
HER1Q12276 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.15□□□□□ -0.14
HER1Q12276 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.15□□□□□ -0.14
HER1Q12276 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.15□□□□□ -0.14
HER1Q12276 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.15□□□□□ -0.14
HER1Q12276 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
HER1Q12276 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
HER1Q12276 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
HER1Q12276 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
HER1Q12276 RPP1BYDL130W 321 nt14.03□□□□□ -0.16
HER1Q12276 PKP1YIL042C 1185 nt14.01□□□□□ -0.17
HER1Q12276 CCC1YLR220W 969 nt14□□□□□ -0.17
HER1Q12276 SCJ1YMR214W 1134 nt13.88□□□□□ -0.19
HER1Q12276 PUT4YOR348C 1884 nt13.82□□□□□ -0.2
HER1Q12276 RVS167YDR388W 1449 nt13.74□□□□□ -0.21
HER1Q12276 ATS1YAL020C 1002 nt13.6□□□□□ -0.23
HER1Q12276 PET122YER153C 765 nt13.4□□□□□ -0.26
HER1Q12276 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.38□□□□□ -0.27
HER1Q12276 ARE1YCR048W 1833 nt13.36□□□□□ -0.27
HER1Q12276 POA1YBR022W 534 nt13.35□□□□□ -0.27
HER1Q12276 SCR1SCR1 522 nt13.25□□□□□ -0.29
HER1Q12276 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.23□□□□□ -0.29
HER1Q12276 BSC6YOL137W 1494 nt13.2□□□□□ -0.3
HER1Q12276 SAH1YER043C 1350 nt13.18□□□□□ -0.3
HER1Q12276 URN1YPR152C 1398 nt13.15□□□□□ -0.3
HER1Q12276 SHR5YOL110W 714 nt13.1□□□□□ -0.31
HER1Q12276 OPI9YLR338W 858 nt13.08□□□□□ -0.32
HER1Q12276 RRN5YLR141W 1092 nt13.02□□□□□ -0.33
HER1Q12276 SPT5YML010W 3192 nt13.02□□□□□ -0.33
HER1Q12276 DEP1YAL013W 1218 nt12.95□□□□□ -0.34
HER1Q12276 YDJ1YNL064C 1230 nt12.95□□□□□ -0.34
HER1Q12276 SSA4YER103W 1929 nt12.94□□□□□ -0.34
HER1Q12276 BUD23YCR047C 828 nt12.87□□□□□ -0.35
HER1Q12276 RPN10YHR200W 807 nt12.82□□□□□ -0.36
HER1Q12276 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.76□□□□□ -0.37
HER1Q12276 RSB1YOR049C 1065 nt12.72□□□□□ -0.37
HER1Q12276 PUN1YLR414C 792 nt12.71□□□□□ -0.37
HER1Q12276 YNL208WYNL208W 600 nt12.67□□□□□ -0.38
HER1Q12276 PTC2YER089C 1395 nt12.67□□□□□ -0.38
HER1Q12276 GAR1YHR089C 618 nt12.65□□□□□ -0.38
HER1Q12276 NAB2YGL122C 1578 nt12.59□□□□□ -0.39
HER1Q12276 PST2YDR032C 597 nt12.52□□□□□ -0.41
HER1Q12276 YJR018WYJR018W 363 nt12.49□□□□□ -0.41
HER1Q12276 BDF1YLR399C 2061 nt12.48□□□□□ -0.41
HER1Q12276 MEP2YNL142W 1500 nt12.45□□□□□ -0.42
HER1Q12276 FIS1YIL065C 468 nt12.36□□□□□ -0.43
HER1Q12276 Q0182Q0182 405 nt12.33□□□□□ -0.44
HER1Q12276 TAT1YBR069C 1860 nt12.32□□□□□ -0.44
HER1Q12276 DAL1YIR027C 1383 nt12.3□□□□□ -0.44
HER1Q12276 FPR4YLR449W 1179 nt12.28□□□□□ -0.44
HER1Q12276 TIR1YER011W 765 nt12.24□□□□□ -0.45
HER1Q12276 YKL097CYKL097C 411 nt12.24□□□□□ -0.45
HER1Q12276 DCW1YKL046C 1350 nt12.23□□□□□ -0.45
HER1Q12276 PHO4YFR034C 939 nt12.2□□□□□ -0.46
HER1Q12276 YPS1YLR120C 1710 nt12.18□□□□□ -0.46
HER1Q12276 INM2YDR287W 879 nt12.13□□□□□ -0.47
HER1Q12276 YJR120WYJR120W 351 nt12.13□□□□□ -0.47
HER1Q12276 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.12□□□□□ -0.47
HER1Q12276 SSA1YAL005C 1929 nt12.09□□□□□ -0.47
HER1Q12276 RPP2BYDR382W 333 nt12.08□□□□□ -0.48
HER1Q12276 PAC11YDR488C 1602 nt12.07□□□□□ -0.48
HER1Q12276 EMI2YDR516C 1503 nt12.06□□□□□ -0.48
HER1Q12276 YMR090WYMR090W 684 nt12.06□□□□□ -0.48
HER1Q12276 YBR220CYBR220C 1683 nt12.06□□□□□ -0.48
HER1Q12276 YDR095CYDR095C 411 nt12□□□□□ -0.49
HER1Q12276 YDL221WYDL221W 552 nt11.92□□□□□ -0.5
HER1Q12276 YBL100CYBL100C 315 nt11.92□□□□□ -0.5
HER1Q12276 SHU1YHL006C 453 nt11.91□□□□□ -0.5
HER1Q12276 SDH1YKL148C 1923 nt11.9□□□□□ -0.51
HER1Q12276 SRB2YHR041C 633 nt11.87□□□□□ -0.51
HER1Q12276 CAC2YML102W 1407 nt11.81□□□□□ -0.52
HER1Q12276 PTP1YDL230W 1008 nt11.78□□□□□ -0.52
HER1Q12276 RPP2AYOL039W 321 nt11.78□□□□□ -0.52
HER1Q12276 PCH2YBR186W 1695 nt11.78□□□□□ -0.52
HER1Q12276 ALF1YNL148C 765 nt11.75□□□□□ -0.53
HER1Q12276 FUN26YAL022C 1554 nt11.75□□□□□ -0.53
HER1Q12276 SEC11YIR022W 504 nt11.74□□□□□ -0.53
HER1Q12276 GUT2YIL155C 1950 nt11.73□□□□□ -0.53
HER1Q12276 SCC4YER147C 1875 nt11.72□□□□□ -0.53
HER1Q12276 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.7□□□□□ -0.54
HER1Q12276 BDH2YAL061W 1254 nt11.7□□□□□ -0.54
HER1Q12276 WWM1YFL010C 636 nt11.68□□□□□ -0.54
HER1Q12276 YOR139CYOR139C 393 nt11.68□□□□□ -0.54
HER1Q12276 IRC15YPL017C 1500 nt11.65□□□□□ -0.55
HER1Q12276 NVJ2YPR091C 2313 nt11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.9 ms