Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 NSR1YGR159C 1245 nt17.96■□□□□ 0.47
NOP56Q12460 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.82■□□□□ 0.44
NOP56Q12460 NOP1YDL014W 984 nt17.33■□□□□ 0.36
NOP56Q12460 MDJ1YFL016C 1536 nt16.04■□□□□ 0.16
NOP56Q12460 SSA3YBL075C 1950 nt15.73■□□□□ 0.11
NOP56Q12460 YKL036CYKL036C 393 nt15.73■□□□□ 0.11
NOP56Q12460 SRX1YKL086W 384 nt15.08■□□□□ 0
NOP56Q12460 Q0297Q0297 156 nt15.05■□□□□ -0
NOP56Q12460 YJL027CYJL027C 417 nt14.87□□□□□ -0.03
NOP56Q12460 YCR051WYCR051W 669 nt14.27□□□□□ -0.13
NOP56Q12460 SCS3YGL126W 1143 nt14.14□□□□□ -0.15
NOP56Q12460 DBP2YNL112W 1641 nt14.09□□□□□ -0.15
NOP56Q12460 YBR190WYBR190W 312 nt13.83□□□□□ -0.2
NOP56Q12460 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP56Q12460 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP56Q12460 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP56Q12460 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP56Q12460 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP56Q12460 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP56Q12460 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP56Q12460 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP56Q12460 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP56Q12460 YOL085CYOL085C 342 nt13.59□□□□□ -0.23
NOP56Q12460 CCC1YLR220W 969 nt13.57□□□□□ -0.24
NOP56Q12460 PAC11YDR488C 1602 nt13.5□□□□□ -0.25
NOP56Q12460 RPP1BYDL130W 321 nt13.49□□□□□ -0.25
NOP56Q12460 RTC3YHR087W 336 nt13.49□□□□□ -0.25
NOP56Q12460 NVJ2YPR091C 2313 nt13.47□□□□□ -0.25 RIP-Chip
NOP56Q12460 PKP1YIL042C 1185 nt13.35□□□□□ -0.27
NOP56Q12460 RVS167YDR388W 1449 nt13.35□□□□□ -0.27
NOP56Q12460 FPS1YLL043W 2010 nt13.34□□□□□ -0.27
NOP56Q12460 Q0182Q0182 405 nt13.26□□□□□ -0.29
NOP56Q12460 SSA1YAL005C 1929 nt13.13□□□□□ -0.31
NOP56Q12460 SSA4YER103W 1929 nt13.11□□□□□ -0.31
NOP56Q12460 SCJ1YMR214W 1134 nt13.08□□□□□ -0.32
NOP56Q12460 PUT4YOR348C 1884 nt13.04□□□□□ -0.32
NOP56Q12460 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.93□□□□□ -0.34
NOP56Q12460 PET122YER153C 765 nt12.87□□□□□ -0.35
NOP56Q12460 BDF1YLR399C 2061 nt12.81□□□□□ -0.36
NOP56Q12460 MOT3YMR070W 1473 nt12.81□□□□□ -0.36
NOP56Q12460 SHR5YOL110W 714 nt12.79□□□□□ -0.36
NOP56Q12460 SCR1SCR1 522 nt12.77□□□□□ -0.37
NOP56Q12460 SPT5YML010W 3192 nt12.76□□□□□ -0.37 RIP-Chip
NOP56Q12460 TAT1YBR069C 1860 nt12.61□□□□□ -0.39
NOP56Q12460 ATS1YAL020C 1002 nt12.6□□□□□ -0.39
NOP56Q12460 YDJ1YNL064C 1230 nt12.56□□□□□ -0.4
NOP56Q12460 POA1YBR022W 534 nt12.54□□□□□ -0.4
NOP56Q12460 URN1YPR152C 1398 nt12.53□□□□□ -0.4
NOP56Q12460 BSC6YOL137W 1494 nt12.49□□□□□ -0.41
NOP56Q12460 ARE1YCR048W 1833 nt12.48□□□□□ -0.41
NOP56Q12460 RRN5YLR141W 1092 nt12.48□□□□□ -0.41
NOP56Q12460 YJL225CYJL225C 5277 nt12.45□□□□□ -0.42 RIP-Chip
NOP56Q12460 OPI9YLR338W 858 nt12.41□□□□□ -0.42
NOP56Q12460 RPN10YHR200W 807 nt12.4□□□□□ -0.42
NOP56Q12460 DEP1YAL013W 1218 nt12.4□□□□□ -0.42
NOP56Q12460 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.37□□□□□ -0.43
NOP56Q12460 UME6YDR207C 2511 nt12.36□□□□□ -0.43
NOP56Q12460 SAH1YER043C 1350 nt12.32□□□□□ -0.44
NOP56Q12460 YNL208WYNL208W 600 nt12.29□□□□□ -0.44
NOP56Q12460 GAR1YHR089C 618 nt12.25□□□□□ -0.45
NOP56Q12460 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.24□□□□□ -0.45
NOP56Q12460 RSB1YOR049C 1065 nt12.18□□□□□ -0.46
NOP56Q12460 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.11□□□□□ -0.47
NOP56Q12460 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.11□□□□□ -0.47
NOP56Q12460 PUN1YLR414C 792 nt12.1□□□□□ -0.47
NOP56Q12460 BUD23YCR047C 828 nt12.01□□□□□ -0.49 RIP-Chip
NOP56Q12460 YJR018WYJR018W 363 nt11.95□□□□□ -0.5
NOP56Q12460 PTC2YER089C 1395 nt11.92□□□□□ -0.5 RIP-Chip
NOP56Q12460 TIR1YER011W 765 nt11.87□□□□□ -0.51
NOP56Q12460 MEP2YNL142W 1500 nt11.86□□□□□ -0.51
NOP56Q12460 NAB2YGL122C 1578 nt11.83□□□□□ -0.52
NOP56Q12460 RPP2BYDR382W 333 nt11.72□□□□□ -0.53
NOP56Q12460 BOR1YNL275W 1731 nt11.71□□□□□ -0.54
NOP56Q12460 PST2YDR032C 597 nt11.7□□□□□ -0.54
NOP56Q12460 MCH5YOR306C 1566 nt11.66□□□□□ -0.54
NOP56Q12460 YMR090WYMR090W 684 nt11.64□□□□□ -0.55
NOP56Q12460 YJR120WYJR120W 351 nt11.63□□□□□ -0.55
NOP56Q12460 DAL1YIR027C 1383 nt11.63□□□□□ -0.55
NOP56Q12460 GUT2YIL155C 1950 nt11.62□□□□□ -0.55
NOP56Q12460 RPM1RPM1 483 nt11.61□□□□□ -0.55
NOP56Q12460 INM2YDR287W 879 nt11.6□□□□□ -0.55
NOP56Q12460 FIS1YIL065C 468 nt11.59□□□□□ -0.55
NOP56Q12460 YBR220CYBR220C 1683 nt11.56□□□□□ -0.56 RIP-Chip
NOP56Q12460 FPR4YLR449W 1179 nt11.56□□□□□ -0.56
NOP56Q12460 DCW1YKL046C 1350 nt11.54□□□□□ -0.56
NOP56Q12460 PCH2YBR186W 1695 nt11.53□□□□□ -0.56
NOP56Q12460 PHO4YFR034C 939 nt11.49□□□□□ -0.57 RIP-Chip
NOP56Q12460 SEC11YIR022W 504 nt11.47□□□□□ -0.57
NOP56Q12460 EMI2YDR516C 1503 nt11.45□□□□□ -0.58
NOP56Q12460 YBL100CYBL100C 315 nt11.42□□□□□ -0.58
NOP56Q12460 BDH2YAL061W 1254 nt11.4□□□□□ -0.58
NOP56Q12460 YPS1YLR120C 1710 nt11.39□□□□□ -0.59
NOP56Q12460 SRB2YHR041C 633 nt11.38□□□□□ -0.59
NOP56Q12460 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.36□□□□□ -0.59
NOP56Q12460 SDH1YKL148C 1923 nt11.35□□□□□ -0.59
NOP56Q12460 YDL221WYDL221W 552 nt11.3□□□□□ -0.6
NOP56Q12460 ALG12YNR030W 1656 nt11.27□□□□□ -0.6
NOP56Q12460 FUN26YAL022C 1554 nt11.26□□□□□ -0.61 RIP-Chip
NOP56Q12460 WWM1YFL010C 636 nt11.26□□□□□ -0.61
NOP56Q12460 YDR095CYDR095C 411 nt11.25□□□□□ -0.61
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