Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.49■■□□□ 1.19
HFI1Q12060 NSR1YGR159C 1245 nt22.12■■□□□ 1.13
HFI1Q12060 NOP1YDL014W 984 nt22.01■■□□□ 1.11
HFI1Q12060 YKL036CYKL036C 393 nt20.5■□□□□ 0.87
HFI1Q12060 MDJ1YFL016C 1536 nt19.37■□□□□ 0.69
HFI1Q12060 Q0297Q0297 156 nt19.27■□□□□ 0.68
HFI1Q12060 YJL027CYJL027C 417 nt19.18■□□□□ 0.66
HFI1Q12060 SRX1YKL086W 384 nt19.18■□□□□ 0.66
HFI1Q12060 SCS3YGL126W 1143 nt18.72■□□□□ 0.59
HFI1Q12060 YCR051WYCR051W 669 nt18.24■□□□□ 0.51
HFI1Q12060 YOL085CYOL085C 342 nt17.7■□□□□ 0.42
HFI1Q12060 PKP1YIL042C 1185 nt17.41■□□□□ 0.38
HFI1Q12060 RPP1BYDL130W 321 nt17.31■□□□□ 0.36
HFI1Q12060 DBP2YNL112W 1641 nt17.18■□□□□ 0.34
HFI1Q12060 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.17■□□□□ 0.34
HFI1Q12060 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.17■□□□□ 0.34
HFI1Q12060 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.17■□□□□ 0.34
HFI1Q12060 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.17■□□□□ 0.34
HFI1Q12060 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.17■□□□□ 0.34
HFI1Q12060 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.17■□□□□ 0.34
HFI1Q12060 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.17■□□□□ 0.34
HFI1Q12060 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.17■□□□□ 0.34
HFI1Q12060 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.17■□□□□ 0.34
HFI1Q12060 CCC1YLR220W 969 nt17.03■□□□□ 0.32
HFI1Q12060 SCJ1YMR214W 1134 nt16.94■□□□□ 0.3
HFI1Q12060 ATS1YAL020C 1002 nt16.82■□□□□ 0.28
HFI1Q12060 YBR190WYBR190W 312 nt16.49■□□□□ 0.23
HFI1Q12060 PET122YER153C 765 nt16.48■□□□□ 0.23
HFI1Q12060 SCR1SCR1 522 nt16.47■□□□□ 0.23
HFI1Q12060 RVS167YDR388W 1449 nt16.36■□□□□ 0.21
HFI1Q12060 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.34■□□□□ 0.21
HFI1Q12060 RTC3YHR087W 336 nt16.18■□□□□ 0.18
HFI1Q12060 RRN5YLR141W 1092 nt16.04■□□□□ 0.16
HFI1Q12060 RSB1YOR049C 1065 nt15.82■□□□□ 0.12
HFI1Q12060 YDJ1YNL064C 1230 nt15.81■□□□□ 0.12
HFI1Q12060 SHR5YOL110W 714 nt15.8■□□□□ 0.12
HFI1Q12060 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.71■□□□□ 0.11
HFI1Q12060 PST2YDR032C 597 nt15.51■□□□□ 0.07
HFI1Q12060 GAR1YHR089C 618 nt15.42■□□□□ 0.06
HFI1Q12060 DEP1YAL013W 1218 nt15.25■□□□□ 0.03
HFI1Q12060 URN1YPR152C 1398 nt15.2■□□□□ 0.02
HFI1Q12060 RPN10YHR200W 807 nt15.11■□□□□ 0.01
HFI1Q12060 YKL097CYKL097C 411 nt15.1■□□□□ 0.01
HFI1Q12060 YNL208WYNL208W 600 nt15.08■□□□□ 0
HFI1Q12060 OPI9YLR338W 858 nt14.92□□□□□ -0.02
HFI1Q12060 TIR1YER011W 765 nt14.89□□□□□ -0.03
HFI1Q12060 SHU1YHL006C 453 nt14.82□□□□□ -0.04
HFI1Q12060 SAH1YER043C 1350 nt14.73□□□□□ -0.05
HFI1Q12060 PUT4YOR348C 1884 nt14.7□□□□□ -0.06
HFI1Q12060 SSA1YAL005C 1929 nt14.6□□□□□ -0.07
HFI1Q12060 YJR018WYJR018W 363 nt14.53□□□□□ -0.08
HFI1Q12060 PUN1YLR414C 792 nt14.53□□□□□ -0.08
HFI1Q12060 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.52□□□□□ -0.09
HFI1Q12060 ARE1YCR048W 1833 nt14.52□□□□□ -0.09
HFI1Q12060 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.39□□□□□ -0.11
HFI1Q12060 RPP2BYDR382W 333 nt14.37□□□□□ -0.11
HFI1Q12060 YOR139CYOR139C 393 nt14.36□□□□□ -0.11
HFI1Q12060 SRB2YHR041C 633 nt14.33□□□□□ -0.12
HFI1Q12060 YGR021WYGR021W 873 nt14.32□□□□□ -0.12
HFI1Q12060 POA1YBR022W 534 nt14.32□□□□□ -0.12
HFI1Q12060 NPL3YDR432W 1245 nt14.29□□□□□ -0.12
HFI1Q12060 PTC2YER089C 1395 nt14.27□□□□□ -0.12
HFI1Q12060 WWM1YFL010C 636 nt14.25□□□□□ -0.13
HFI1Q12060 YJR120WYJR120W 351 nt14.25□□□□□ -0.13
HFI1Q12060 HOM6YJR139C 1080 nt14.21□□□□□ -0.13
HFI1Q12060 MNP1YGL068W 585 nt14.17□□□□□ -0.14
HFI1Q12060 BUD23YCR047C 828 nt14.11□□□□□ -0.15
HFI1Q12060 YOL037CYOL037C 354 nt14.1□□□□□ -0.15
HFI1Q12060 NAB2YGL122C 1578 nt14.07□□□□□ -0.16
HFI1Q12060 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.06□□□□□ -0.16
HFI1Q12060 BDH2YAL061W 1254 nt14.06□□□□□ -0.16
HFI1Q12060 RKM5YLR137W 1104 nt14.01□□□□□ -0.17
HFI1Q12060 INM2YDR287W 879 nt14□□□□□ -0.17
HFI1Q12060 SSA3YBL075C 1950 nt13.94□□□□□ -0.18
HFI1Q12060 BSC6YOL137W 1494 nt13.94□□□□□ -0.18
HFI1Q12060 FPR4YLR449W 1179 nt13.94□□□□□ -0.18
HFI1Q12060 LSM3YLR438C-A 270 nt13.93□□□□□ -0.18
HFI1Q12060 DAL1YIR027C 1383 nt13.93□□□□□ -0.18
HFI1Q12060 YBL100CYBL100C 315 nt13.9□□□□□ -0.18
HFI1Q12060 FIS1YIL065C 468 nt13.83□□□□□ -0.2
HFI1Q12060 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.8□□□□□ -0.2
HFI1Q12060 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.8□□□□□ -0.2
HFI1Q12060 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.8□□□□□ -0.2
HFI1Q12060 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.8□□□□□ -0.2
HFI1Q12060 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.8□□□□□ -0.2
HFI1Q12060 TRM9YML014W 840 nt13.79□□□□□ -0.2
HFI1Q12060 PHO4YFR034C 939 nt13.78□□□□□ -0.2
HFI1Q12060 FUN26YAL022C 1554 nt13.71□□□□□ -0.21
HFI1Q12060 YLR281CYLR281C 468 nt13.7□□□□□ -0.22
HFI1Q12060 PUS2YGL063W 1113 nt13.67□□□□□ -0.22
HFI1Q12060 WHI5YOR083W 888 nt13.63□□□□□ -0.23
HFI1Q12060 CCT6YDR188W 1641 nt13.57□□□□□ -0.24
HFI1Q12060 ALF1YNL148C 765 nt13.54□□□□□ -0.24
HFI1Q12060 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.52□□□□□ -0.25
HFI1Q12060 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.52□□□□□ -0.25
HFI1Q12060 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.45□□□□□ -0.26
HFI1Q12060 IMP2'YIL154C 1041 nt13.4□□□□□ -0.26
HFI1Q12060 YPS1YLR120C 1710 nt13.39□□□□□ -0.27
HFI1Q12060 DSK2YMR276W 1122 nt13.39□□□□□ -0.27
HFI1Q12060 MOT3YMR070W 1473 nt13.38□□□□□ -0.27
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