Protein–RNA interactions for Protein: Q12163

NBP2, NAP1-binding protein 2, yeastyeast

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NBP2Q12163 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.53■■□□□ 1.04
NBP2Q12163 NSR1YGR159C 1245 nt21.24■□□□□ 0.99
NBP2Q12163 NOP1YDL014W 984 nt20.98■□□□□ 0.95
NBP2Q12163 YKL036CYKL036C 393 nt19.49■□□□□ 0.71
NBP2Q12163 MDJ1YFL016C 1536 nt18.74■□□□□ 0.59
NBP2Q12163 Q0297Q0297 156 nt18.39■□□□□ 0.53
NBP2Q12163 SRX1YKL086W 384 nt18.33■□□□□ 0.52
NBP2Q12163 YJL027CYJL027C 417 nt18.22■□□□□ 0.51
NBP2Q12163 SCS3YGL126W 1143 nt17.81■□□□□ 0.44
NBP2Q12163 YCR051WYCR051W 669 nt17.4■□□□□ 0.38
NBP2Q12163 YOL085CYOL085C 342 nt16.86■□□□□ 0.29
NBP2Q12163 DBP2YNL112W 1641 nt16.63■□□□□ 0.25
NBP2Q12163 PKP1YIL042C 1185 nt16.6■□□□□ 0.25
NBP2Q12163 RPP1BYDL130W 321 nt16.51■□□□□ 0.23
NBP2Q12163 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.49■□□□□ 0.23
NBP2Q12163 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.49■□□□□ 0.23
NBP2Q12163 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.49■□□□□ 0.23
NBP2Q12163 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.49■□□□□ 0.23
NBP2Q12163 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.49■□□□□ 0.23
NBP2Q12163 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.49■□□□□ 0.23
NBP2Q12163 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.49■□□□□ 0.23
NBP2Q12163 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.49■□□□□ 0.23
NBP2Q12163 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.49■□□□□ 0.23
NBP2Q12163 CCC1YLR220W 969 nt16.32■□□□□ 0.2
NBP2Q12163 ATS1YAL020C 1002 nt15.95■□□□□ 0.14
NBP2Q12163 SCJ1YMR214W 1134 nt15.95■□□□□ 0.14
NBP2Q12163 YBR190WYBR190W 312 nt15.93■□□□□ 0.14
NBP2Q12163 PET122YER153C 765 nt15.76■□□□□ 0.11
NBP2Q12163 RVS167YDR388W 1449 nt15.7■□□□□ 0.1
NBP2Q12163 SCR1SCR1 522 nt15.65■□□□□ 0.1
NBP2Q12163 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.64■□□□□ 0.09
NBP2Q12163 RTC3YHR087W 336 nt15.6■□□□□ 0.09
NBP2Q12163 RRN5YLR141W 1092 nt15.3■□□□□ 0.04
NBP2Q12163 SHR5YOL110W 714 nt15.17■□□□□ 0.02
NBP2Q12163 YDJ1YNL064C 1230 nt15.12■□□□□ 0.01
NBP2Q12163 RSB1YOR049C 1065 nt15.05■□□□□ -0
NBP2Q12163 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.01□□□□□ -0.01
NBP2Q12163 GAR1YHR089C 618 nt14.77□□□□□ -0.05
NBP2Q12163 PST2YDR032C 597 nt14.74□□□□□ -0.05
NBP2Q12163 DEP1YAL013W 1218 nt14.68□□□□□ -0.06
NBP2Q12163 URN1YPR152C 1398 nt14.66□□□□□ -0.06
NBP2Q12163 RPN10YHR200W 807 nt14.49□□□□□ -0.09
NBP2Q12163 YNL208WYNL208W 600 nt14.48□□□□□ -0.09
NBP2Q12163 OPI9YLR338W 858 nt14.4□□□□□ -0.1
NBP2Q12163 PUT4YOR348C 1884 nt14.35□□□□□ -0.11
NBP2Q12163 SAH1YER043C 1350 nt14.28□□□□□ -0.12
NBP2Q12163 TIR1YER011W 765 nt14.27□□□□□ -0.13
NBP2Q12163 YKL097CYKL097C 411 nt14.26□□□□□ -0.13
NBP2Q12163 ARE1YCR048W 1833 nt14.15□□□□□ -0.14
NBP2Q12163 SHU1YHL006C 453 nt14.12□□□□□ -0.15
NBP2Q12163 SSA1YAL005C 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
NBP2Q12163 PUN1YLR414C 792 nt14□□□□□ -0.17
NBP2Q12163 YJR018WYJR018W 363 nt13.99□□□□□ -0.17
NBP2Q12163 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.98□□□□□ -0.17
NBP2Q12163 POA1YBR022W 534 nt13.91□□□□□ -0.18
NBP2Q12163 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.85□□□□□ -0.19
NBP2Q12163 SRB2YHR041C 633 nt13.84□□□□□ -0.19
NBP2Q12163 YJR120WYJR120W 351 nt13.8□□□□□ -0.2
NBP2Q12163 PTC2YER089C 1395 nt13.79□□□□□ -0.2
NBP2Q12163 RPP2BYDR382W 333 nt13.76□□□□□ -0.21
NBP2Q12163 BUD23YCR047C 828 nt13.67□□□□□ -0.22
NBP2Q12163 WWM1YFL010C 636 nt13.66□□□□□ -0.22
NBP2Q12163 YGR021WYGR021W 873 nt13.65□□□□□ -0.22
NBP2Q12163 YOR139CYOR139C 393 nt13.64□□□□□ -0.23
NBP2Q12163 NAB2YGL122C 1578 nt13.6□□□□□ -0.23
NBP2Q12163 HOM6YJR139C 1080 nt13.59□□□□□ -0.23
NBP2Q12163 SSA3YBL075C 1950 nt13.59□□□□□ -0.23
NBP2Q12163 BSC6YOL137W 1494 nt13.59□□□□□ -0.23
NBP2Q12163 MNP1YGL068W 585 nt13.57□□□□□ -0.24
NBP2Q12163 NPL3YDR432W 1245 nt13.53□□□□□ -0.24
NBP2Q12163 BDH2YAL061W 1254 nt13.51□□□□□ -0.25
NBP2Q12163 INM2YDR287W 879 nt13.46□□□□□ -0.25
NBP2Q12163 DAL1YIR027C 1383 nt13.45□□□□□ -0.26
NBP2Q12163 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.45□□□□□ -0.26
NBP2Q12163 FIS1YIL065C 468 nt13.44□□□□□ -0.26
NBP2Q12163 FPR4YLR449W 1179 nt13.43□□□□□ -0.26
NBP2Q12163 YOL037CYOL037C 354 nt13.41□□□□□ -0.26
NBP2Q12163 RKM5YLR137W 1104 nt13.4□□□□□ -0.26
NBP2Q12163 YBL100CYBL100C 315 nt13.38□□□□□ -0.27
NBP2Q12163 LSM3YLR438C-A 270 nt13.34□□□□□ -0.27
NBP2Q12163 PHO4YFR034C 939 nt13.33□□□□□ -0.28
NBP2Q12163 FUN26YAL022C 1554 nt13.21□□□□□ -0.29
NBP2Q12163 TRM9YML014W 840 nt13.21□□□□□ -0.29
NBP2Q12163 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.1□□□□□ -0.31
NBP2Q12163 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.1□□□□□ -0.31
NBP2Q12163 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.1□□□□□ -0.31
NBP2Q12163 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.1□□□□□ -0.31
NBP2Q12163 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.1□□□□□ -0.31
NBP2Q12163 CCT6YDR188W 1641 nt13.09□□□□□ -0.31
NBP2Q12163 YLR281CYLR281C 468 nt13.05□□□□□ -0.32
NBP2Q12163 ALF1YNL148C 765 nt13.01□□□□□ -0.33
NBP2Q12163 YPS1YLR120C 1710 nt13.01□□□□□ -0.33
NBP2Q12163 WHI5YOR083W 888 nt12.99□□□□□ -0.33
NBP2Q12163 PUS2YGL063W 1113 nt12.98□□□□□ -0.33
NBP2Q12163 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.97□□□□□ -0.33
NBP2Q12163 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.97□□□□□ -0.33
NBP2Q12163 YDR095CYDR095C 411 nt12.96□□□□□ -0.33
NBP2Q12163 SPT5YML010W 3192 nt12.9□□□□□ -0.34
NBP2Q12163 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.88□□□□□ -0.35
NBP2Q12163 Q0182Q0182 405 nt12.87□□□□□ -0.35
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