Protein–RNA interactions for Protein: P20449

DBP5, ATP-dependent RNA helicase DBP5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DBP5P20449 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.54■■□□□ 1.2
DBP5P20449 NSR1YGR159C 1245 nt22.34■■□□□ 1.17
DBP5P20449 NOP1YDL014W 984 nt21.98■■□□□ 1.11
DBP5P20449 YKL036CYKL036C 393 nt20.37■□□□□ 0.85
DBP5P20449 MDJ1YFL016C 1536 nt19.7■□□□□ 0.74
DBP5P20449 Q0297Q0297 156 nt19.28■□□□□ 0.68
DBP5P20449 SRX1YKL086W 384 nt19.2■□□□□ 0.66
DBP5P20449 YJL027CYJL027C 417 nt19.02■□□□□ 0.64
DBP5P20449 SCS3YGL126W 1143 nt18.57■□□□□ 0.56
DBP5P20449 YCR051WYCR051W 669 nt18.21■□□□□ 0.51
DBP5P20449 YOL085CYOL085C 342 nt17.64■□□□□ 0.41
DBP5P20449 DBP2YNL112W 1641 nt17.48■□□□□ 0.39
DBP5P20449 PKP1YIL042C 1185 nt17.34■□□□□ 0.37
DBP5P20449 RPP1BYDL130W 321 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP5P20449 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP5P20449 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP5P20449 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP5P20449 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP5P20449 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP5P20449 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP5P20449 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP5P20449 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP5P20449 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP5P20449 CCC1YLR220W 969 nt17.11■□□□□ 0.33
DBP5P20449 YBR190WYBR190W 312 nt16.8■□□□□ 0.28
DBP5P20449 ATS1YAL020C 1002 nt16.65■□□□□ 0.26
DBP5P20449 SCJ1YMR214W 1134 nt16.61■□□□□ 0.25
DBP5P20449 PET122YER153C 765 nt16.49■□□□□ 0.23
DBP5P20449 RVS167YDR388W 1449 nt16.47■□□□□ 0.23
DBP5P20449 RTC3YHR087W 336 nt16.42■□□□□ 0.22
DBP5P20449 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.39■□□□□ 0.21
DBP5P20449 SCR1SCR1 522 nt16.36■□□□□ 0.21
DBP5P20449 RRN5YLR141W 1092 nt16.04■□□□□ 0.16
DBP5P20449 SHR5YOL110W 714 nt15.93■□□□□ 0.14
DBP5P20449 YDJ1YNL064C 1230 nt15.87■□□□□ 0.13
DBP5P20449 RSB1YOR049C 1065 nt15.73■□□□□ 0.11
DBP5P20449 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.72■□□□□ 0.11
DBP5P20449 GAR1YHR089C 618 nt15.48■□□□□ 0.07
DBP5P20449 DEP1YAL013W 1218 nt15.42■□□□□ 0.06
DBP5P20449 URN1YPR152C 1398 nt15.41■□□□□ 0.06
DBP5P20449 PST2YDR032C 597 nt15.41■□□□□ 0.06
DBP5P20449 RPN10YHR200W 807 nt15.22■□□□□ 0.03
DBP5P20449 YNL208WYNL208W 600 nt15.21■□□□□ 0.03
DBP5P20449 OPI9YLR338W 858 nt15.18■□□□□ 0.02
DBP5P20449 PUT4YOR348C 1884 nt15.15■□□□□ 0.02
DBP5P20449 SAH1YER043C 1350 nt15.04■□□□□ -0
DBP5P20449 TIR1YER011W 765 nt14.97□□□□□ -0.01
DBP5P20449 ARE1YCR048W 1833 nt14.92□□□□□ -0.02
DBP5P20449 YKL097CYKL097C 411 nt14.84□□□□□ -0.03
DBP5P20449 SSA1YAL005C 1929 nt14.76□□□□□ -0.05
DBP5P20449 SSA3YBL075C 1950 nt14.75□□□□□ -0.05
DBP5P20449 SHU1YHL006C 453 nt14.75□□□□□ -0.05
DBP5P20449 PUN1YLR414C 792 nt14.75□□□□□ -0.05
DBP5P20449 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.72□□□□□ -0.05
DBP5P20449 YJR018WYJR018W 363 nt14.72□□□□□ -0.05
DBP5P20449 POA1YBR022W 534 nt14.7□□□□□ -0.06
DBP5P20449 PTC2YER089C 1395 nt14.53□□□□□ -0.08
DBP5P20449 SRB2YHR041C 633 nt14.52□□□□□ -0.09
DBP5P20449 YJR120WYJR120W 351 nt14.51□□□□□ -0.09
DBP5P20449 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.48□□□□□ -0.09
DBP5P20449 RPP2BYDR382W 333 nt14.45□□□□□ -0.1
DBP5P20449 BUD23YCR047C 828 nt14.39□□□□□ -0.11
DBP5P20449 BSC6YOL137W 1494 nt14.36□□□□□ -0.11
DBP5P20449 NAB2YGL122C 1578 nt14.33□□□□□ -0.12
DBP5P20449 WWM1YFL010C 636 nt14.32□□□□□ -0.12
DBP5P20449 YGR021WYGR021W 873 nt14.28□□□□□ -0.12
DBP5P20449 HOM6YJR139C 1080 nt14.23□□□□□ -0.13
DBP5P20449 YOR139CYOR139C 393 nt14.23□□□□□ -0.13
DBP5P20449 INM2YDR287W 879 nt14.2□□□□□ -0.14
DBP5P20449 BDH2YAL061W 1254 nt14.18□□□□□ -0.14
DBP5P20449 DAL1YIR027C 1383 nt14.16□□□□□ -0.14
DBP5P20449 MNP1YGL068W 585 nt14.15□□□□□ -0.14
DBP5P20449 FIS1YIL065C 468 nt14.13□□□□□ -0.15
DBP5P20449 FPR4YLR449W 1179 nt14.12□□□□□ -0.15
DBP5P20449 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.1□□□□□ -0.15
DBP5P20449 NPL3YDR432W 1245 nt14.09□□□□□ -0.15
DBP5P20449 YBL100CYBL100C 315 nt14.06□□□□□ -0.16
DBP5P20449 LSM3YLR438C-A 270 nt14.03□□□□□ -0.16
DBP5P20449 PHO4YFR034C 939 nt14.02□□□□□ -0.17
DBP5P20449 RKM5YLR137W 1104 nt14.02□□□□□ -0.17
DBP5P20449 YOL037CYOL037C 354 nt13.98□□□□□ -0.17
DBP5P20449 TRM9YML014W 840 nt13.9□□□□□ -0.18
DBP5P20449 FUN26YAL022C 1554 nt13.9□□□□□ -0.18
DBP5P20449 Q0182Q0182 405 nt13.76□□□□□ -0.21
DBP5P20449 CCT6YDR188W 1641 nt13.75□□□□□ -0.21
DBP5P20449 YPS1YLR120C 1710 nt13.71□□□□□ -0.21
DBP5P20449 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.68□□□□□ -0.22
DBP5P20449 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.68□□□□□ -0.22
DBP5P20449 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.68□□□□□ -0.22
DBP5P20449 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.68□□□□□ -0.22
DBP5P20449 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.68□□□□□ -0.22
DBP5P20449 ALF1YNL148C 765 nt13.68□□□□□ -0.22
DBP5P20449 YLR281CYLR281C 468 nt13.66□□□□□ -0.22
DBP5P20449 YDR095CYDR095C 411 nt13.65□□□□□ -0.22
DBP5P20449 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.63□□□□□ -0.23
DBP5P20449 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.63□□□□□ -0.23
DBP5P20449 WHI5YOR083W 888 nt13.6□□□□□ -0.23
DBP5P20449 SPT5YML010W 3192 nt13.57□□□□□ -0.24
DBP5P20449 PUS2YGL063W 1113 nt13.55□□□□□ -0.24
DBP5P20449 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.55□□□□□ -0.24
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