Protein–RNA interactions for Protein: Q12469

SKM1, Serine/threonine-protein kinase SKM1, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKM1Q12469 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.65■□□□□ 0.74
SKM1Q12469 NOP1YDL014W 984 nt19.29■□□□□ 0.68
SKM1Q12469 NSR1YGR159C 1245 nt19.22■□□□□ 0.67
SKM1Q12469 YKL036CYKL036C 393 nt18.1■□□□□ 0.49
SKM1Q12469 YJL027CYJL027C 417 nt16.97■□□□□ 0.31
SKM1Q12469 Q0297Q0297 156 nt16.96■□□□□ 0.31
SKM1Q12469 SRX1YKL086W 384 nt16.81■□□□□ 0.28
SKM1Q12469 MDJ1YFL016C 1536 nt16.69■□□□□ 0.26
SKM1Q12469 SCS3YGL126W 1143 nt16.63■□□□□ 0.25
SKM1Q12469 YCR051WYCR051W 669 nt16■□□□□ 0.15
SKM1Q12469 YOL085CYOL085C 342 nt15.65■□□□□ 0.1
SKM1Q12469 PKP1YIL042C 1185 nt15.36■□□□□ 0.05
SKM1Q12469 RPP1BYDL130W 321 nt15.22■□□□□ 0.03
SKM1Q12469 SCJ1YMR214W 1134 nt15.22■□□□□ 0.03
SKM1Q12469 ATS1YAL020C 1002 nt14.99□□□□□ -0.01
SKM1Q12469 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SKM1Q12469 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SKM1Q12469 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SKM1Q12469 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SKM1Q12469 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SKM1Q12469 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SKM1Q12469 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SKM1Q12469 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SKM1Q12469 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SKM1Q12469 DBP2YNL112W 1641 nt14.88□□□□□ -0.03
SKM1Q12469 CCC1YLR220W 969 nt14.85□□□□□ -0.03
SKM1Q12469 SCR1SCR1 522 nt14.49□□□□□ -0.09
SKM1Q12469 PET122YER153C 765 nt14.48□□□□□ -0.09
SKM1Q12469 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SKM1Q12469 RVS167YDR388W 1449 nt14.18□□□□□ -0.14
SKM1Q12469 YBR190WYBR190W 312 nt14.16□□□□□ -0.14
SKM1Q12469 RRN5YLR141W 1092 nt14.11□□□□□ -0.15
SKM1Q12469 SSA3YBL075C 1950 nt14.02□□□□□ -0.17
SKM1Q12469 RSB1YOR049C 1065 nt13.95□□□□□ -0.18
SKM1Q12469 RTC3YHR087W 336 nt13.9□□□□□ -0.18
SKM1Q12469 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.84□□□□□ -0.19
SKM1Q12469 YDJ1YNL064C 1230 nt13.83□□□□□ -0.2
SKM1Q12469 PST2YDR032C 597 nt13.8□□□□□ -0.2
SKM1Q12469 SHR5YOL110W 714 nt13.74□□□□□ -0.21
SKM1Q12469 YKL097CYKL097C 411 nt13.48□□□□□ -0.25
SKM1Q12469 GAR1YHR089C 618 nt13.47□□□□□ -0.25
SKM1Q12469 DEP1YAL013W 1218 nt13.2□□□□□ -0.3
SKM1Q12469 SHU1YHL006C 453 nt13.14□□□□□ -0.31
SKM1Q12469 URN1YPR152C 1398 nt13.11□□□□□ -0.31
SKM1Q12469 YNL208WYNL208W 600 nt13.07□□□□□ -0.32
SKM1Q12469 RPN10YHR200W 807 nt13.06□□□□□ -0.32
SKM1Q12469 TIR1YER011W 765 nt13□□□□□ -0.33
SKM1Q12469 Q0182Q0182 405 nt12.92□□□□□ -0.34
SKM1Q12469 OPI9YLR338W 858 nt12.84□□□□□ -0.35
SKM1Q12469 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.83□□□□□ -0.36
SKM1Q12469 YOR139CYOR139C 393 nt12.82□□□□□ -0.36
SKM1Q12469 PUT4YOR348C 1884 nt12.8□□□□□ -0.36
SKM1Q12469 SSA1YAL005C 1929 nt12.74□□□□□ -0.37
SKM1Q12469 NPL3YDR432W 1245 nt12.7□□□□□ -0.38
SKM1Q12469 SAH1YER043C 1350 nt12.66□□□□□ -0.38
SKM1Q12469 YGR021WYGR021W 873 nt12.56□□□□□ -0.4
SKM1Q12469 SRB2YHR041C 633 nt12.54□□□□□ -0.4
SKM1Q12469 YJR018WYJR018W 363 nt12.53□□□□□ -0.4
SKM1Q12469 PUN1YLR414C 792 nt12.5□□□□□ -0.41
SKM1Q12469 HOM6YJR139C 1080 nt12.49□□□□□ -0.41
SKM1Q12469 WWM1YFL010C 636 nt12.47□□□□□ -0.41
SKM1Q12469 MNP1YGL068W 585 nt12.47□□□□□ -0.41
SKM1Q12469 YOL037CYOL037C 354 nt12.46□□□□□ -0.41
SKM1Q12469 RPP2BYDR382W 333 nt12.43□□□□□ -0.42
SKM1Q12469 ARE1YCR048W 1833 nt12.43□□□□□ -0.42
SKM1Q12469 YJR120WYJR120W 351 nt12.35□□□□□ -0.43
SKM1Q12469 POA1YBR022W 534 nt12.34□□□□□ -0.43
SKM1Q12469 RKM5YLR137W 1104 nt12.32□□□□□ -0.44
SKM1Q12469 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.31□□□□□ -0.44
SKM1Q12469 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.31□□□□□ -0.44
SKM1Q12469 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.31□□□□□ -0.44
SKM1Q12469 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.31□□□□□ -0.44
SKM1Q12469 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.31□□□□□ -0.44
SKM1Q12469 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.29□□□□□ -0.44
SKM1Q12469 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.29□□□□□ -0.44
SKM1Q12469 PTC2YER089C 1395 nt12.27□□□□□ -0.45
SKM1Q12469 SSA4YER103W 1929 nt12.27□□□□□ -0.45
SKM1Q12469 MOT3YMR070W 1473 nt12.26□□□□□ -0.45
SKM1Q12469 BSC6YOL137W 1494 nt12.23□□□□□ -0.45
SKM1Q12469 SPT5YML010W 3192 nt12.22□□□□□ -0.45
SKM1Q12469 BDH2YAL061W 1254 nt12.2□□□□□ -0.46
SKM1Q12469 LSM3YLR438C-A 270 nt12.13□□□□□ -0.47
SKM1Q12469 PUS2YGL063W 1113 nt12.11□□□□□ -0.47
SKM1Q12469 YLR281CYLR281C 468 nt12.11□□□□□ -0.47
SKM1Q12469 NAB2YGL122C 1578 nt12.06□□□□□ -0.48
SKM1Q12469 BUD23YCR047C 828 nt12.06□□□□□ -0.48
SKM1Q12469 INM2YDR287W 879 nt12.06□□□□□ -0.48
SKM1Q12469 WHI5YOR083W 888 nt12.02□□□□□ -0.49
SKM1Q12469 YBL100CYBL100C 315 nt12□□□□□ -0.49
SKM1Q12469 DAL1YIR027C 1383 nt11.99□□□□□ -0.49
SKM1Q12469 FPR4YLR449W 1179 nt11.97□□□□□ -0.49
SKM1Q12469 TRM9YML014W 840 nt11.93□□□□□ -0.5
SKM1Q12469 FIS1YIL065C 468 nt11.89□□□□□ -0.51
SKM1Q12469 FUN26YAL022C 1554 nt11.86□□□□□ -0.51
SKM1Q12469 BDF1YLR399C 2061 nt11.86□□□□□ -0.51
SKM1Q12469 PHO4YFR034C 939 nt11.85□□□□□ -0.51
SKM1Q12469 DSK2YMR276W 1122 nt11.82□□□□□ -0.52
SKM1Q12469 FMP45YDL222C 930 nt11.81□□□□□ -0.52
SKM1Q12469 IMP2'YIL154C 1041 nt11.8□□□□□ -0.52
SKM1Q12469 CCT6YDR188W 1641 nt11.76□□□□□ -0.53
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