Protein–RNA interactions for Protein: P38308

COS111, F-box protein COS111, yeastyeast

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COS111P38308 NSR1YGR159C 1245 nt19.56■□□□□ 0.72
COS111P38308 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.48■□□□□ 0.71
COS111P38308 NOP1YDL014W 984 nt18.9■□□□□ 0.62
COS111P38308 MDJ1YFL016C 1536 nt17.47■□□□□ 0.39
COS111P38308 YKL036CYKL036C 393 nt17.28■□□□□ 0.36
COS111P38308 SRX1YKL086W 384 nt16.52■□□□□ 0.24
COS111P38308 Q0297Q0297 156 nt16.51■□□□□ 0.23
COS111P38308 YJL027CYJL027C 417 nt16.13■□□□□ 0.17
COS111P38308 YCR051WYCR051W 669 nt15.64■□□□□ 0.09
COS111P38308 SCS3YGL126W 1143 nt15.63■□□□□ 0.09
COS111P38308 DBP2YNL112W 1641 nt15.43■□□□□ 0.06
COS111P38308 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.03■□□□□ -0
COS111P38308 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.03■□□□□ -0
COS111P38308 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.03■□□□□ -0
COS111P38308 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.03■□□□□ -0
COS111P38308 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.03■□□□□ -0
COS111P38308 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.03■□□□□ -0
COS111P38308 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.03■□□□□ -0
COS111P38308 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.03■□□□□ -0
COS111P38308 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.03■□□□□ -0
COS111P38308 YOL085CYOL085C 342 nt14.98□□□□□ -0.01
COS111P38308 YBR190WYBR190W 312 nt14.98□□□□□ -0.01
COS111P38308 CCC1YLR220W 969 nt14.86□□□□□ -0.03
COS111P38308 RPP1BYDL130W 321 nt14.8□□□□□ -0.04
COS111P38308 PKP1YIL042C 1185 nt14.75□□□□□ -0.05
COS111P38308 RTC3YHR087W 336 nt14.6□□□□□ -0.07
COS111P38308 RVS167YDR388W 1449 nt14.44□□□□□ -0.1
COS111P38308 SCJ1YMR214W 1134 nt14.33□□□□□ -0.12
COS111P38308 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.16□□□□□ -0.14
COS111P38308 PET122YER153C 765 nt14.15□□□□□ -0.14
COS111P38308 ATS1YAL020C 1002 nt13.95□□□□□ -0.18
COS111P38308 SCR1SCR1 522 nt13.95□□□□□ -0.18
COS111P38308 SHR5YOL110W 714 nt13.91□□□□□ -0.18
COS111P38308 SSA3YBL075C 1950 nt13.76□□□□□ -0.21
COS111P38308 PUT4YOR348C 1884 nt13.74□□□□□ -0.21
COS111P38308 RRN5YLR141W 1092 nt13.73□□□□□ -0.21
COS111P38308 YDJ1YNL064C 1230 nt13.72□□□□□ -0.21
COS111P38308 URN1YPR152C 1398 nt13.62□□□□□ -0.23
COS111P38308 DEP1YAL013W 1218 nt13.55□□□□□ -0.24
COS111P38308 OPI9YLR338W 858 nt13.48□□□□□ -0.25
COS111P38308 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.47□□□□□ -0.25
COS111P38308 ARE1YCR048W 1833 nt13.43□□□□□ -0.26
COS111P38308 SAH1YER043C 1350 nt13.43□□□□□ -0.26
COS111P38308 GAR1YHR089C 618 nt13.41□□□□□ -0.26
COS111P38308 RPN10YHR200W 807 nt13.38□□□□□ -0.27
COS111P38308 RSB1YOR049C 1065 nt13.38□□□□□ -0.27
COS111P38308 YNL208WYNL208W 600 nt13.34□□□□□ -0.27
COS111P38308 POA1YBR022W 534 nt13.27□□□□□ -0.29
COS111P38308 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.22□□□□□ -0.29
COS111P38308 PUN1YLR414C 792 nt13.07□□□□□ -0.32
COS111P38308 BSC6YOL137W 1494 nt13.01□□□□□ -0.33
COS111P38308 YJR018WYJR018W 363 nt13□□□□□ -0.33
COS111P38308 TIR1YER011W 765 nt12.98□□□□□ -0.33
COS111P38308 PST2YDR032C 597 nt12.97□□□□□ -0.33
COS111P38308 PTC2YER089C 1395 nt12.94□□□□□ -0.34
COS111P38308 BUD23YCR047C 828 nt12.91□□□□□ -0.34
COS111P38308 SSA1YAL005C 1929 nt12.87□□□□□ -0.35
COS111P38308 NAB2YGL122C 1578 nt12.81□□□□□ -0.36
COS111P38308 YJR120WYJR120W 351 nt12.76□□□□□ -0.37
COS111P38308 RPP2BYDR382W 333 nt12.67□□□□□ -0.38
COS111P38308 SRB2YHR041C 633 nt12.61□□□□□ -0.39
COS111P38308 DAL1YIR027C 1383 nt12.6□□□□□ -0.39
COS111P38308 SPT5YML010W 3192 nt12.59□□□□□ -0.39
COS111P38308 FIS1YIL065C 468 nt12.58□□□□□ -0.4
COS111P38308 INM2YDR287W 879 nt12.57□□□□□ -0.4
COS111P38308 FPR4YLR449W 1179 nt12.53□□□□□ -0.4
COS111P38308 PHO4YFR034C 939 nt12.47□□□□□ -0.41
COS111P38308 SHU1YHL006C 453 nt12.46□□□□□ -0.41
COS111P38308 BDH2YAL061W 1254 nt12.41□□□□□ -0.42
COS111P38308 YBL100CYBL100C 315 nt12.39□□□□□ -0.43
COS111P38308 WWM1YFL010C 636 nt12.38□□□□□ -0.43
COS111P38308 YKL097CYKL097C 411 nt12.33□□□□□ -0.44
COS111P38308 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.31□□□□□ -0.44
COS111P38308 YPS1YLR120C 1710 nt12.31□□□□□ -0.44
COS111P38308 YGR021WYGR021W 873 nt12.26□□□□□ -0.45
COS111P38308 FUN26YAL022C 1554 nt12.26□□□□□ -0.45
COS111P38308 MEP2YNL142W 1500 nt12.25□□□□□ -0.45
COS111P38308 LSM3YLR438C-A 270 nt12.23□□□□□ -0.45
COS111P38308 HOM6YJR139C 1080 nt12.21□□□□□ -0.45
COS111P38308 TRM9YML014W 840 nt12.21□□□□□ -0.45
COS111P38308 YDR095CYDR095C 411 nt12.2□□□□□ -0.46
COS111P38308 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.19□□□□□ -0.46
COS111P38308 SSA4YER103W 1929 nt12.15□□□□□ -0.46
COS111P38308 Q0182Q0182 405 nt12.15□□□□□ -0.46
COS111P38308 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.15□□□□□ -0.46
COS111P38308 MNP1YGL068W 585 nt12.1□□□□□ -0.47
COS111P38308 CCT6YDR188W 1641 nt12.1□□□□□ -0.47
COS111P38308 ALF1YNL148C 765 nt12.09□□□□□ -0.47
COS111P38308 DCW1YKL046C 1350 nt12.05□□□□□ -0.48
COS111P38308 RKM5YLR137W 1104 nt12.03□□□□□ -0.48
COS111P38308 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.99□□□□□ -0.49
COS111P38308 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.99□□□□□ -0.49
COS111P38308 RPP2AYOL039W 321 nt11.97□□□□□ -0.49
COS111P38308 SIS1YNL007C 1059 nt11.96□□□□□ -0.49
COS111P38308 PTP1YDL230W 1008 nt11.95□□□□□ -0.5
COS111P38308 EMI2YDR516C 1503 nt11.89□□□□□ -0.51
COS111P38308 YOR139CYOR139C 393 nt11.88□□□□□ -0.51
COS111P38308 CAC2YML102W 1407 nt11.87□□□□□ -0.51
COS111P38308 YOL037CYOL037C 354 nt11.85□□□□□ -0.51
COS111P38308 YMR090WYMR090W 684 nt11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.9 ms