Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.61■□□□□ 0.73
YLL054CQ12244 NSR1YGR159C 1245 nt19.59■□□□□ 0.73
YLL054CQ12244 NOP1YDL014W 984 nt19.05■□□□□ 0.64
YLL054CQ12244 MDJ1YFL016C 1536 nt17.47■□□□□ 0.39
YLL054CQ12244 YKL036CYKL036C 393 nt17.44■□□□□ 0.38
YLL054CQ12244 SRX1YKL086W 384 nt16.61■□□□□ 0.25
YLL054CQ12244 Q0297Q0297 156 nt16.6■□□□□ 0.25
YLL054CQ12244 YJL027CYJL027C 417 nt16.26■□□□□ 0.19
YLL054CQ12244 SSA3YBL075C 1950 nt15.88■□□□□ 0.13
YLL054CQ12244 SCS3YGL126W 1143 nt15.77■□□□□ 0.12
YLL054CQ12244 YCR051WYCR051W 669 nt15.76■□□□□ 0.11
YLL054CQ12244 DBP2YNL112W 1641 nt15.37■□□□□ 0.05
YLL054CQ12244 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.08■□□□□ 0
YLL054CQ12244 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.08■□□□□ 0
YLL054CQ12244 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.08■□□□□ 0
YLL054CQ12244 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.08■□□□□ 0
YLL054CQ12244 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.08■□□□□ 0
YLL054CQ12244 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.08■□□□□ 0
YLL054CQ12244 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.08■□□□□ 0
YLL054CQ12244 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.08■□□□□ 0
YLL054CQ12244 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.08■□□□□ 0
YLL054CQ12244 YOL085CYOL085C 342 nt15.08■□□□□ 0
YLL054CQ12244 YBR190WYBR190W 312 nt14.96□□□□□ -0.01
YLL054CQ12244 CCC1YLR220W 969 nt14.93□□□□□ -0.02
YLL054CQ12244 RPP1BYDL130W 321 nt14.89□□□□□ -0.03
YLL054CQ12244 PKP1YIL042C 1185 nt14.86□□□□□ -0.03
YLL054CQ12244 RTC3YHR087W 336 nt14.64□□□□□ -0.07
YLL054CQ12244 RVS167YDR388W 1449 nt14.55□□□□□ -0.08
YLL054CQ12244 SCJ1YMR214W 1134 nt14.34□□□□□ -0.11
YLL054CQ12244 PET122YER153C 765 nt14.23□□□□□ -0.13
YLL054CQ12244 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.22□□□□□ -0.13
YLL054CQ12244 SCR1SCR1 522 nt14.11□□□□□ -0.15
YLL054CQ12244 ATS1YAL020C 1002 nt14.07□□□□□ -0.16
YLL054CQ12244 SHR5YOL110W 714 nt13.97□□□□□ -0.17
YLL054CQ12244 PUT4YOR348C 1884 nt13.86□□□□□ -0.19
YLL054CQ12244 RRN5YLR141W 1092 nt13.81□□□□□ -0.2
YLL054CQ12244 YDJ1YNL064C 1230 nt13.78□□□□□ -0.2
YLL054CQ12244 URN1YPR152C 1398 nt13.64□□□□□ -0.23
YLL054CQ12244 PAC11YDR488C 1602 nt13.6□□□□□ -0.23
YLL054CQ12244 NVJ2YPR091C 2313 nt13.59□□□□□ -0.23
YLL054CQ12244 DEP1YAL013W 1218 nt13.59□□□□□ -0.23
YLL054CQ12244 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.52□□□□□ -0.25
YLL054CQ12244 RSB1YOR049C 1065 nt13.52□□□□□ -0.25
YLL054CQ12244 FPS1YLL043W 2010 nt13.5□□□□□ -0.25
YLL054CQ12244 GAR1YHR089C 618 nt13.48□□□□□ -0.25
YLL054CQ12244 RPN10YHR200W 807 nt13.48□□□□□ -0.25
YLL054CQ12244 OPI9YLR338W 858 nt13.46□□□□□ -0.25
YLL054CQ12244 YNL208WYNL208W 600 nt13.4□□□□□ -0.26
YLL054CQ12244 ARE1YCR048W 1833 nt13.4□□□□□ -0.26
YLL054CQ12244 SAH1YER043C 1350 nt13.38□□□□□ -0.27
YLL054CQ12244 POA1YBR022W 534 nt13.36□□□□□ -0.27
YLL054CQ12244 SSA1YAL005C 1929 nt13.28□□□□□ -0.28
YLL054CQ12244 SSA4YER103W 1929 nt13.23□□□□□ -0.29
YLL054CQ12244 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.23□□□□□ -0.29
YLL054CQ12244 BSC6YOL137W 1494 nt13.22□□□□□ -0.29
YLL054CQ12244 SPT5YML010W 3192 nt13.17□□□□□ -0.3
YLL054CQ12244 Q0182Q0182 405 nt13.11□□□□□ -0.31
YLL054CQ12244 PUN1YLR414C 792 nt13.11□□□□□ -0.31
YLL054CQ12244 PST2YDR032C 597 nt13.04□□□□□ -0.32
YLL054CQ12244 TIR1YER011W 765 nt13.03□□□□□ -0.32
YLL054CQ12244 YJR018WYJR018W 363 nt13.02□□□□□ -0.33
YLL054CQ12244 BDF1YLR399C 2061 nt12.95□□□□□ -0.34
YLL054CQ12244 PTC2YER089C 1395 nt12.94□□□□□ -0.34
YLL054CQ12244 BUD23YCR047C 828 nt12.91□□□□□ -0.34
YLL054CQ12244 NAB2YGL122C 1578 nt12.79□□□□□ -0.36
YLL054CQ12244 RPP2BYDR382W 333 nt12.77□□□□□ -0.37
YLL054CQ12244 MOT3YMR070W 1473 nt12.77□□□□□ -0.37
YLL054CQ12244 TAT1YBR069C 1860 nt12.72□□□□□ -0.37
YLL054CQ12244 YJR120WYJR120W 351 nt12.71□□□□□ -0.37
YLL054CQ12244 DAL1YIR027C 1383 nt12.6□□□□□ -0.39
YLL054CQ12244 INM2YDR287W 879 nt12.59□□□□□ -0.39
YLL054CQ12244 FPR4YLR449W 1179 nt12.59□□□□□ -0.39
YLL054CQ12244 SRB2YHR041C 633 nt12.56□□□□□ -0.4
YLL054CQ12244 FIS1YIL065C 468 nt12.56□□□□□ -0.4
YLL054CQ12244 SHU1YHL006C 453 nt12.53□□□□□ -0.4
YLL054CQ12244 UME6YDR207C 2511 nt12.52□□□□□ -0.41
YLL054CQ12244 YKL097CYKL097C 411 nt12.51□□□□□ -0.41
YLL054CQ12244 MEP2YNL142W 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
YLL054CQ12244 PHO4YFR034C 939 nt12.47□□□□□ -0.41
YLL054CQ12244 BDH2YAL061W 1254 nt12.45□□□□□ -0.42
YLL054CQ12244 YBL100CYBL100C 315 nt12.43□□□□□ -0.42
YLL054CQ12244 WWM1YFL010C 636 nt12.42□□□□□ -0.42
YLL054CQ12244 YGR021WYGR021W 873 nt12.37□□□□□ -0.43
YLL054CQ12244 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.37□□□□□ -0.43
YLL054CQ12244 DCW1YKL046C 1350 nt12.3□□□□□ -0.44
YLL054CQ12244 FUN26YAL022C 1554 nt12.27□□□□□ -0.44
YLL054CQ12244 HOM6YJR139C 1080 nt12.27□□□□□ -0.45
YLL054CQ12244 LSM3YLR438C-A 270 nt12.27□□□□□ -0.45
YLL054CQ12244 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.26□□□□□ -0.45
YLL054CQ12244 TRM9YML014W 840 nt12.26□□□□□ -0.45
YLL054CQ12244 YPS1YLR120C 1710 nt12.25□□□□□ -0.45
YLL054CQ12244 MNP1YGL068W 585 nt12.18□□□□□ -0.46
YLL054CQ12244 YDR095CYDR095C 411 nt12.17□□□□□ -0.46
YLL054CQ12244 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.17□□□□□ -0.46
YLL054CQ12244 ALF1YNL148C 765 nt12.17□□□□□ -0.46
YLL054CQ12244 CCT6YDR188W 1641 nt12.11□□□□□ -0.47
YLL054CQ12244 YBR220CYBR220C 1683 nt12.1□□□□□ -0.47
YLL054CQ12244 RKM5YLR137W 1104 nt12.1□□□□□ -0.47
YLL054CQ12244 EMI2YDR516C 1503 nt12.08□□□□□ -0.48
YLL054CQ12244 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.7 ms