RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0144	Q0144	YGR237C	P50089	785 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	YNR071C	P53757	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	YBR139W	P38109	508 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	THI3	Q07471	609 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	BZZ1	P38822	633 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	MAD2	P40958	196 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	MNN2	P38069	597 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	CRF1	Q04930	467 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	PDR8	Q06149	701 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	DIN7	Q12086	430 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	OCT1	P35999	772 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	STL1	P39932	569 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Q0144	Q0144	SIP1	P32578	815 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	ERC1	P38767	581 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	TIP41	Q12199	356 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	SWC3	P31376	625 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	VFA1	P40080	203 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	SPC105	P53148	917 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	HOL1	P53389	586 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	IZH1	Q03419	316 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	VPS41	P38959	992 aa		5	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	YJR142W	P47173	342 aa		5	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	TRS31	Q03337	283 aa		5	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	TAH18	Q12181	623 aa		5	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	CTT1	P06115	562 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	CDC1	P40986	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	UBP8	P50102	471 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	SND1	Q04007	877 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	ECI1	Q05871	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	YLR112W	Q12130	139 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	CDC23	P16522	626 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	YPR003C	P53394	754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	CAC2	Q04199	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	MCH4	Q08268	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	NIT2	P47016	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	SLD3	P53135	668 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	CRZ1	P53968	678 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	TRI1	Q05024	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	ARP9	Q05123	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	PIG1	Q06216	648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	POS5	Q06892	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0144	Q0144	PDE1	P22434	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	ASG1	P40467	964 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	SWF1	Q04629	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	PSF3	Q12146	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	NPA3	P47122	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	CUL3	P53202	744 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	ESBP6	P53918	673 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	YMR254C	Q04838	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	LAC1	P28496	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	EFM2	P38347	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	POL31	P46957	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	FCP1	Q03254	732 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	SMA2	Q04658	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	EMP65	P40085	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	YLR352W	Q06479	807 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	YGL081W	P53156	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	PEX15	Q08215	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Q0144	Q0144	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	YJL070C	P40361	888 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	HNM1	P19807	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	YNL034W	P53963	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	VPS64	Q03944	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	FRE3	Q08905	711 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	YML002W	P0CF17	737 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	YCR006C	P25350	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	TAF5	P38129	798 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	IML2	P47031	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	RSA1	Q08932	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	TRE2	Q08693	809 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	COX1	P00401	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	PMS1	P14242	873 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.4 ms