Protein–RNA interactions for Protein: Q04658

SMA2, Spore membrane assembly protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMA2Q04658 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.02■□□□□ 0.64
SMA2Q04658 NSR1YGR159C 1245 nt18.87■□□□□ 0.61
SMA2Q04658 NOP1YDL014W 984 nt18.48■□□□□ 0.55
SMA2Q04658 YKL036CYKL036C 393 nt17.02■□□□□ 0.32
SMA2Q04658 MDJ1YFL016C 1536 nt16.78■□□□□ 0.28
SMA2Q04658 Q0297Q0297 156 nt16.12■□□□□ 0.17
SMA2Q04658 SRX1YKL086W 384 nt16.11■□□□□ 0.17
SMA2Q04658 YJL027CYJL027C 417 nt15.91■□□□□ 0.14
SMA2Q04658 SCS3YGL126W 1143 nt15.46■□□□□ 0.07
SMA2Q04658 YCR051WYCR051W 669 nt15.33■□□□□ 0.04
SMA2Q04658 DBP2YNL112W 1641 nt14.79□□□□□ -0.04
SMA2Q04658 YOL085CYOL085C 342 nt14.73□□□□□ -0.05
SMA2Q04658 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.57□□□□□ -0.08
SMA2Q04658 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.57□□□□□ -0.08
SMA2Q04658 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.57□□□□□ -0.08
SMA2Q04658 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.57□□□□□ -0.08
SMA2Q04658 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.57□□□□□ -0.08
SMA2Q04658 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.57□□□□□ -0.08
SMA2Q04658 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.57□□□□□ -0.08
SMA2Q04658 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.57□□□□□ -0.08
SMA2Q04658 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.57□□□□□ -0.08
SMA2Q04658 PKP1YIL042C 1185 nt14.53□□□□□ -0.08
SMA2Q04658 RPP1BYDL130W 321 nt14.49□□□□□ -0.09
SMA2Q04658 CCC1YLR220W 969 nt14.48□□□□□ -0.09
SMA2Q04658 YBR190WYBR190W 312 nt14.3□□□□□ -0.12
SMA2Q04658 RTC3YHR087W 336 nt14.05□□□□□ -0.16
SMA2Q04658 RVS167YDR388W 1449 nt13.98□□□□□ -0.17
SMA2Q04658 SCJ1YMR214W 1134 nt13.86□□□□□ -0.19
SMA2Q04658 PET122YER153C 765 nt13.84□□□□□ -0.19
SMA2Q04658 ATS1YAL020C 1002 nt13.83□□□□□ -0.2
SMA2Q04658 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.79□□□□□ -0.2
SMA2Q04658 SCR1SCR1 522 nt13.73□□□□□ -0.21
SMA2Q04658 SSA3YBL075C 1950 nt13.56□□□□□ -0.24
SMA2Q04658 SHR5YOL110W 714 nt13.46□□□□□ -0.25
SMA2Q04658 RRN5YLR141W 1092 nt13.45□□□□□ -0.26
SMA2Q04658 YDJ1YNL064C 1230 nt13.33□□□□□ -0.28
SMA2Q04658 RSB1YOR049C 1065 nt13.2□□□□□ -0.3
SMA2Q04658 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.17□□□□□ -0.3
SMA2Q04658 DEP1YAL013W 1218 nt13.12□□□□□ -0.31
SMA2Q04658 URN1YPR152C 1398 nt13.11□□□□□ -0.31
SMA2Q04658 GAR1YHR089C 618 nt13.08□□□□□ -0.32
SMA2Q04658 PUT4YOR348C 1884 nt12.96□□□□□ -0.33
SMA2Q04658 RPN10YHR200W 807 nt12.94□□□□□ -0.34
SMA2Q04658 OPI9YLR338W 858 nt12.9□□□□□ -0.34
SMA2Q04658 YNL208WYNL208W 600 nt12.89□□□□□ -0.35
SMA2Q04658 SAH1YER043C 1350 nt12.83□□□□□ -0.36
SMA2Q04658 PST2YDR032C 597 nt12.79□□□□□ -0.36
SMA2Q04658 ARE1YCR048W 1833 nt12.73□□□□□ -0.37
SMA2Q04658 TIR1YER011W 765 nt12.62□□□□□ -0.39
SMA2Q04658 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.61□□□□□ -0.39
SMA2Q04658 POA1YBR022W 534 nt12.6□□□□□ -0.39
SMA2Q04658 PUN1YLR414C 792 nt12.55□□□□□ -0.4
SMA2Q04658 YJR018WYJR018W 363 nt12.51□□□□□ -0.41
SMA2Q04658 SSA1YAL005C 1929 nt12.45□□□□□ -0.42
SMA2Q04658 PTC2YER089C 1395 nt12.4□□□□□ -0.42
SMA2Q04658 BUD23YCR047C 828 nt12.35□□□□□ -0.43
SMA2Q04658 YKL097CYKL097C 411 nt12.32□□□□□ -0.44
SMA2Q04658 BSC6YOL137W 1494 nt12.32□□□□□ -0.44
SMA2Q04658 RPP2BYDR382W 333 nt12.28□□□□□ -0.44
SMA2Q04658 SHU1YHL006C 453 nt12.28□□□□□ -0.44
SMA2Q04658 YJR120WYJR120W 351 nt12.24□□□□□ -0.45
SMA2Q04658 NAB2YGL122C 1578 nt12.22□□□□□ -0.45
SMA2Q04658 SRB2YHR041C 633 nt12.21□□□□□ -0.45
SMA2Q04658 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.13□□□□□ -0.47
SMA2Q04658 FPR4YLR449W 1179 nt12.09□□□□□ -0.47
SMA2Q04658 DAL1YIR027C 1383 nt12.06□□□□□ -0.48
SMA2Q04658 INM2YDR287W 879 nt12.06□□□□□ -0.48
SMA2Q04658 WWM1YFL010C 636 nt12.06□□□□□ -0.48
SMA2Q04658 FIS1YIL065C 468 nt12.03□□□□□ -0.48
SMA2Q04658 BDH2YAL061W 1254 nt12□□□□□ -0.49
SMA2Q04658 YGR021WYGR021W 873 nt11.99□□□□□ -0.49
SMA2Q04658 PHO4YFR034C 939 nt11.95□□□□□ -0.5
SMA2Q04658 YBL100CYBL100C 315 nt11.95□□□□□ -0.5
SMA2Q04658 HOM6YJR139C 1080 nt11.92□□□□□ -0.5
SMA2Q04658 MNP1YGL068W 585 nt11.88□□□□□ -0.51
SMA2Q04658 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.86□□□□□ -0.51
SMA2Q04658 LSM3YLR438C-A 270 nt11.83□□□□□ -0.52
SMA2Q04658 TRM9YML014W 840 nt11.8□□□□□ -0.52
SMA2Q04658 FUN26YAL022C 1554 nt11.79□□□□□ -0.52
SMA2Q04658 YOR139CYOR139C 393 nt11.78□□□□□ -0.52
SMA2Q04658 RKM5YLR137W 1104 nt11.76□□□□□ -0.53
SMA2Q04658 NPL3YDR432W 1245 nt11.75□□□□□ -0.53
SMA2Q04658 YPS1YLR120C 1710 nt11.69□□□□□ -0.54
SMA2Q04658 YOL037CYOL037C 354 nt11.68□□□□□ -0.54
SMA2Q04658 ALF1YNL148C 765 nt11.67□□□□□ -0.54
SMA2Q04658 SSA4YER103W 1929 nt11.66□□□□□ -0.54
SMA2Q04658 Q0182Q0182 405 nt11.65□□□□□ -0.54
SMA2Q04658 CCT6YDR188W 1641 nt11.63□□□□□ -0.55
SMA2Q04658 YDR095CYDR095C 411 nt11.62□□□□□ -0.55
SMA2Q04658 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.62□□□□□ -0.55
SMA2Q04658 SPT5YML010W 3192 nt11.61□□□□□ -0.55
SMA2Q04658 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.58□□□□□ -0.56
SMA2Q04658 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.58□□□□□ -0.56
SMA2Q04658 MEP2YNL142W 1500 nt11.55□□□□□ -0.56
SMA2Q04658 PAC11YDR488C 1602 nt11.44□□□□□ -0.58
SMA2Q04658 SIS1YNL007C 1059 nt11.43□□□□□ -0.58
SMA2Q04658 RPP2AYOL039W 321 nt11.43□□□□□ -0.58
SMA2Q04658 YLR281CYLR281C 468 nt11.39□□□□□ -0.59
SMA2Q04658 WHI5YOR083W 888 nt11.38□□□□□ -0.59
SMA2Q04658 DCW1YKL046C 1350 nt11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.3 ms