Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 NSR1YGR159C 1245 nt22.01■■□□□ 1.11
VFA1P40080 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.98■■□□□ 1.11
VFA1P40080 NOP1YDL014W 984 nt21.18■□□□□ 0.98
VFA1P40080 MDJ1YFL016C 1536 nt19.9■□□□□ 0.78
VFA1P40080 YKL036CYKL036C 393 nt19.31■□□□□ 0.68
VFA1P40080 SRX1YKL086W 384 nt18.52■□□□□ 0.56
VFA1P40080 Q0297Q0297 156 nt18.46■□□□□ 0.55
VFA1P40080 YJL027CYJL027C 417 nt18.29■□□□□ 0.52
VFA1P40080 YCR051WYCR051W 669 nt17.59■□□□□ 0.41
VFA1P40080 DBP2YNL112W 1641 nt17.47■□□□□ 0.39
VFA1P40080 SCS3YGL126W 1143 nt17.47■□□□□ 0.39
VFA1P40080 YBR190WYBR190W 312 nt16.96■□□□□ 0.31
VFA1P40080 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.94■□□□□ 0.3
VFA1P40080 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.94■□□□□ 0.3
VFA1P40080 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.94■□□□□ 0.3
VFA1P40080 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.94■□□□□ 0.3
VFA1P40080 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.94■□□□□ 0.3
VFA1P40080 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.94■□□□□ 0.3
VFA1P40080 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.94■□□□□ 0.3
VFA1P40080 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.94■□□□□ 0.3
VFA1P40080 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.94■□□□□ 0.3
VFA1P40080 CCC1YLR220W 969 nt16.8■□□□□ 0.28
VFA1P40080 YOL085CYOL085C 342 nt16.76■□□□□ 0.27
VFA1P40080 RTC3YHR087W 336 nt16.61■□□□□ 0.25
VFA1P40080 PKP1YIL042C 1185 nt16.59■□□□□ 0.25
VFA1P40080 RPP1BYDL130W 321 nt16.58■□□□□ 0.24
VFA1P40080 RVS167YDR388W 1449 nt16.31■□□□□ 0.2
VFA1P40080 SCJ1YMR214W 1134 nt16.26■□□□□ 0.19
VFA1P40080 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.93■□□□□ 0.14
VFA1P40080 PET122YER153C 765 nt15.91■□□□□ 0.14
VFA1P40080 SHR5YOL110W 714 nt15.69■□□□□ 0.1
VFA1P40080 PUT4YOR348C 1884 nt15.65■□□□□ 0.1
VFA1P40080 SCR1SCR1 522 nt15.61■□□□□ 0.09
VFA1P40080 ATS1YAL020C 1002 nt15.52■□□□□ 0.08
VFA1P40080 URN1YPR152C 1398 nt15.45■□□□□ 0.06
VFA1P40080 DEP1YAL013W 1218 nt15.41■□□□□ 0.06
VFA1P40080 RRN5YLR141W 1092 nt15.41■□□□□ 0.06
VFA1P40080 YDJ1YNL064C 1230 nt15.38■□□□□ 0.05
VFA1P40080 ARE1YCR048W 1833 nt15.29■□□□□ 0.04
VFA1P40080 SAH1YER043C 1350 nt15.27■□□□□ 0.04
VFA1P40080 OPI9YLR338W 858 nt15.26■□□□□ 0.03
VFA1P40080 SSA3YBL075C 1950 nt15.24■□□□□ 0.03
VFA1P40080 POA1YBR022W 534 nt15.15■□□□□ 0.02
VFA1P40080 GAR1YHR089C 618 nt15.14■□□□□ 0.01
VFA1P40080 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.11■□□□□ 0.01
VFA1P40080 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.11■□□□□ 0.01
VFA1P40080 RPN10YHR200W 807 nt15.1■□□□□ 0.01
VFA1P40080 YNL208WYNL208W 600 nt15.06■□□□□ 0
VFA1P40080 RSB1YOR049C 1065 nt15.02■□□□□ -0
VFA1P40080 BSC6YOL137W 1494 nt14.88□□□□□ -0.03
VFA1P40080 PUN1YLR414C 792 nt14.79□□□□□ -0.04
VFA1P40080 BUD23YCR047C 828 nt14.74□□□□□ -0.05
VFA1P40080 PTC2YER089C 1395 nt14.71□□□□□ -0.06
VFA1P40080 YJR018WYJR018W 363 nt14.7□□□□□ -0.06
VFA1P40080 TIR1YER011W 765 nt14.62□□□□□ -0.07
VFA1P40080 SSA1YAL005C 1929 nt14.53□□□□□ -0.08
VFA1P40080 NAB2YGL122C 1578 nt14.51□□□□□ -0.09
VFA1P40080 YJR120WYJR120W 351 nt14.47□□□□□ -0.09
VFA1P40080 PST2YDR032C 597 nt14.42□□□□□ -0.1
VFA1P40080 SPT5YML010W 3192 nt14.36□□□□□ -0.11
VFA1P40080 FIS1YIL065C 468 nt14.33□□□□□ -0.12
VFA1P40080 RPP2BYDR382W 333 nt14.31□□□□□ -0.12
VFA1P40080 SRB2YHR041C 633 nt14.3□□□□□ -0.12
VFA1P40080 FPR4YLR449W 1179 nt14.29□□□□□ -0.12
VFA1P40080 DAL1YIR027C 1383 nt14.29□□□□□ -0.12
VFA1P40080 INM2YDR287W 879 nt14.17□□□□□ -0.14
VFA1P40080 PHO4YFR034C 939 nt14.17□□□□□ -0.14
VFA1P40080 YBL100CYBL100C 315 nt14.04□□□□□ -0.16
VFA1P40080 BDH2YAL061W 1254 nt13.99□□□□□ -0.17
VFA1P40080 YPS1YLR120C 1710 nt13.98□□□□□ -0.17
VFA1P40080 MEP2YNL142W 1500 nt13.97□□□□□ -0.17
VFA1P40080 SSA4YER103W 1929 nt13.97□□□□□ -0.17
VFA1P40080 WWM1YFL010C 636 nt13.96□□□□□ -0.17
VFA1P40080 SHU1YHL006C 453 nt13.94□□□□□ -0.18
VFA1P40080 FUN26YAL022C 1554 nt13.87□□□□□ -0.19
VFA1P40080 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.86□□□□□ -0.19
VFA1P40080 YDR095CYDR095C 411 nt13.85□□□□□ -0.19
VFA1P40080 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.84□□□□□ -0.19
VFA1P40080 DCW1YKL046C 1350 nt13.8□□□□□ -0.2
VFA1P40080 TRM9YML014W 840 nt13.76□□□□□ -0.21
VFA1P40080 YGR021WYGR021W 873 nt13.74□□□□□ -0.21
VFA1P40080 LSM3YLR438C-A 270 nt13.72□□□□□ -0.21
VFA1P40080 ALF1YNL148C 765 nt13.72□□□□□ -0.21
VFA1P40080 HOM6YJR139C 1080 nt13.71□□□□□ -0.21
VFA1P40080 YKL097CYKL097C 411 nt13.71□□□□□ -0.21
VFA1P40080 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.68□□□□□ -0.22
VFA1P40080 MNP1YGL068W 585 nt13.66□□□□□ -0.22
VFA1P40080 CCT6YDR188W 1641 nt13.65□□□□□ -0.22
VFA1P40080 PTP1YDL230W 1008 nt13.59□□□□□ -0.23
VFA1P40080 RPP2AYOL039W 321 nt13.58□□□□□ -0.24
VFA1P40080 EMI2YDR516C 1503 nt13.57□□□□□ -0.24
VFA1P40080 CAC2YML102W 1407 nt13.55□□□□□ -0.24
VFA1P40080 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.53□□□□□ -0.24
VFA1P40080 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.53□□□□□ -0.24
VFA1P40080 RKM5YLR137W 1104 nt13.51□□□□□ -0.25
VFA1P40080 SIS1YNL007C 1059 nt13.51□□□□□ -0.25
VFA1P40080 YDL221WYDL221W 552 nt13.45□□□□□ -0.26
VFA1P40080 YMR090WYMR090W 684 nt13.44□□□□□ -0.26
VFA1P40080 BDF1YLR399C 2061 nt13.44□□□□□ -0.26
VFA1P40080 YBR220CYBR220C 1683 nt13.4□□□□□ -0.26
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