Protein–RNA interactions for Protein: P19807

HNM1, Choline transport protein, yeastyeast

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HNM1P19807 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.4■□□□□ 0.38
HNM1P19807 NSR1YGR159C 1245 nt17.38■□□□□ 0.37
HNM1P19807 NOP1YDL014W 984 nt17.01■□□□□ 0.31
HNM1P19807 MDJ1YFL016C 1536 nt15.81■□□□□ 0.12
HNM1P19807 YKL036CYKL036C 393 nt15.7■□□□□ 0.1
HNM1P19807 Q0297Q0297 156 nt14.85□□□□□ -0.03
HNM1P19807 SRX1YKL086W 384 nt14.81□□□□□ -0.04
HNM1P19807 YJL027CYJL027C 417 nt14.67□□□□□ -0.06
HNM1P19807 SCS3YGL126W 1143 nt14.27□□□□□ -0.13
HNM1P19807 YCR051WYCR051W 669 nt14.06□□□□□ -0.16
HNM1P19807 DBP2YNL112W 1641 nt13.85□□□□□ -0.19
HNM1P19807 SSA3YBL075C 1950 nt13.67□□□□□ -0.22
HNM1P19807 YBR190WYBR190W 312 nt13.59□□□□□ -0.23
HNM1P19807 YOL085CYOL085C 342 nt13.56□□□□□ -0.24
HNM1P19807 RPP1BYDL130W 321 nt13.33□□□□□ -0.28
HNM1P19807 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.33□□□□□ -0.28
HNM1P19807 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.33□□□□□ -0.28
HNM1P19807 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.33□□□□□ -0.28
HNM1P19807 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.33□□□□□ -0.28
HNM1P19807 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.33□□□□□ -0.28
HNM1P19807 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.33□□□□□ -0.28
HNM1P19807 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.33□□□□□ -0.28
HNM1P19807 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.33□□□□□ -0.28
HNM1P19807 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.33□□□□□ -0.28
HNM1P19807 PKP1YIL042C 1185 nt13.32□□□□□ -0.28
HNM1P19807 RTC3YHR087W 336 nt13.26□□□□□ -0.29
HNM1P19807 CCC1YLR220W 969 nt13.21□□□□□ -0.29
HNM1P19807 RVS167YDR388W 1449 nt12.89□□□□□ -0.35
HNM1P19807 ATS1YAL020C 1002 nt12.79□□□□□ -0.36
HNM1P19807 SCJ1YMR214W 1134 nt12.78□□□□□ -0.36
HNM1P19807 SSA1YAL005C 1929 nt12.69□□□□□ -0.38
HNM1P19807 PET122YER153C 765 nt12.69□□□□□ -0.38
HNM1P19807 PUT4YOR348C 1884 nt12.66□□□□□ -0.38
HNM1P19807 SCR1SCR1 522 nt12.66□□□□□ -0.38
HNM1P19807 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.64□□□□□ -0.39
HNM1P19807 FPS1YLL043W 2010 nt12.43□□□□□ -0.42
HNM1P19807 SHR5YOL110W 714 nt12.36□□□□□ -0.43
HNM1P19807 RRN5YLR141W 1092 nt12.33□□□□□ -0.44
HNM1P19807 ARE1YCR048W 1833 nt12.31□□□□□ -0.44
HNM1P19807 URN1YPR152C 1398 nt12.28□□□□□ -0.44
HNM1P19807 YDJ1YNL064C 1230 nt12.25□□□□□ -0.45
HNM1P19807 POA1YBR022W 534 nt12.24□□□□□ -0.45
HNM1P19807 SAH1YER043C 1350 nt12.21□□□□□ -0.45
HNM1P19807 OPI9YLR338W 858 nt12.18□□□□□ -0.46
HNM1P19807 DEP1YAL013W 1218 nt12.16□□□□□ -0.46
HNM1P19807 NVJ2YPR091C 2313 nt12.13□□□□□ -0.47
HNM1P19807 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.13□□□□□ -0.47
HNM1P19807 RSB1YOR049C 1065 nt12.13□□□□□ -0.47
HNM1P19807 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.09□□□□□ -0.47
HNM1P19807 Q0182Q0182 405 nt12.09□□□□□ -0.47
HNM1P19807 BSC6YOL137W 1494 nt12.04□□□□□ -0.48
HNM1P19807 RPN10YHR200W 807 nt11.97□□□□□ -0.49
HNM1P19807 PAC11YDR488C 1602 nt11.95□□□□□ -0.5
HNM1P19807 GAR1YHR089C 618 nt11.94□□□□□ -0.5
HNM1P19807 YNL208WYNL208W 600 nt11.9□□□□□ -0.5
HNM1P19807 BUD23YCR047C 828 nt11.83□□□□□ -0.52
HNM1P19807 PST2YDR032C 597 nt11.82□□□□□ -0.52
HNM1P19807 PUN1YLR414C 792 nt11.81□□□□□ -0.52
HNM1P19807 SPT5YML010W 3192 nt11.79□□□□□ -0.52
HNM1P19807 PTC2YER089C 1395 nt11.75□□□□□ -0.53
HNM1P19807 YJR018WYJR018W 363 nt11.68□□□□□ -0.54
HNM1P19807 NAB2YGL122C 1578 nt11.64□□□□□ -0.55
HNM1P19807 SSA4YER103W 1929 nt11.55□□□□□ -0.56
HNM1P19807 TIR1YER011W 765 nt11.55□□□□□ -0.56
HNM1P19807 FIS1YIL065C 468 nt11.43□□□□□ -0.58
HNM1P19807 YKL097CYKL097C 411 nt11.43□□□□□ -0.58
HNM1P19807 YJR120WYJR120W 351 nt11.42□□□□□ -0.58
HNM1P19807 DAL1YIR027C 1383 nt11.41□□□□□ -0.58
HNM1P19807 FPR4YLR449W 1179 nt11.38□□□□□ -0.59
HNM1P19807 MEP2YNL142W 1500 nt11.35□□□□□ -0.59
HNM1P19807 RPP2BYDR382W 333 nt11.32□□□□□ -0.6
HNM1P19807 INM2YDR287W 879 nt11.31□□□□□ -0.6
HNM1P19807 PHO4YFR034C 939 nt11.31□□□□□ -0.6
HNM1P19807 SHU1YHL006C 453 nt11.31□□□□□ -0.6
HNM1P19807 RPM1RPM1 483 nt11.24□□□□□ -0.61
HNM1P19807 YPS1YLR120C 1710 nt11.23□□□□□ -0.61
HNM1P19807 DCW1YKL046C 1350 nt11.16□□□□□ -0.62
HNM1P19807 BDF1YLR399C 2061 nt11.15□□□□□ -0.62
HNM1P19807 SRB2YHR041C 633 nt11.15□□□□□ -0.62
HNM1P19807 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.13□□□□□ -0.63
HNM1P19807 YBL100CYBL100C 315 nt11.13□□□□□ -0.63
HNM1P19807 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.1□□□□□ -0.63
HNM1P19807 YDR095CYDR095C 411 nt11.09□□□□□ -0.63
HNM1P19807 UME6YDR207C 2511 nt11.08□□□□□ -0.64
HNM1P19807 YGR021WYGR021W 873 nt11.06□□□□□ -0.64
HNM1P19807 BDH2YAL061W 1254 nt11.04□□□□□ -0.64
HNM1P19807 WWM1YFL010C 636 nt11.01□□□□□ -0.65
HNM1P19807 EMI2YDR516C 1503 nt11□□□□□ -0.65
HNM1P19807 FUN26YAL022C 1554 nt11□□□□□ -0.65
HNM1P19807 TAT1YBR069C 1860 nt10.99□□□□□ -0.65
HNM1P19807 MOT3YMR070W 1473 nt10.98□□□□□ -0.65
HNM1P19807 HOM6YJR139C 1080 nt10.95□□□□□ -0.66
HNM1P19807 YMR090WYMR090W 684 nt10.94□□□□□ -0.66
HNM1P19807 YBR220CYBR220C 1683 nt10.93□□□□□ -0.66
HNM1P19807 ALF1YNL148C 765 nt10.92□□□□□ -0.66
HNM1P19807 TRM9YML014W 840 nt10.91□□□□□ -0.66
HNM1P19807 PTP1YDL230W 1008 nt10.9□□□□□ -0.66
HNM1P19807 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.9□□□□□ -0.66
HNM1P19807 CAC2YML102W 1407 nt10.9□□□□□ -0.66
HNM1P19807 RPP2AYOL039W 321 nt10.89□□□□□ -0.67
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