Protein–RNA interactions for Protein: Q04838

YMR254C, Uncharacterized protein YMR254C, yeastyeast

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR254CQ04838 NSR1YGR159C 1245 nt17.34■□□□□ 0.37
YMR254CQ04838 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.31■□□□□ 0.36
YMR254CQ04838 NOP1YDL014W 984 nt16.86■□□□□ 0.29
YMR254CQ04838 MDJ1YFL016C 1536 nt15.45■□□□□ 0.06
YMR254CQ04838 YKL036CYKL036C 393 nt15.41■□□□□ 0.06
YMR254CQ04838 SRX1YKL086W 384 nt14.68□□□□□ -0.06
YMR254CQ04838 Q0297Q0297 156 nt14.67□□□□□ -0.06
YMR254CQ04838 YJL027CYJL027C 417 nt14.35□□□□□ -0.11
YMR254CQ04838 YCR051WYCR051W 669 nt13.91□□□□□ -0.18
YMR254CQ04838 SCS3YGL126W 1143 nt13.9□□□□□ -0.18
YMR254CQ04838 DBP2YNL112W 1641 nt13.57□□□□□ -0.24
YMR254CQ04838 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.31□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.31□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.31□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.31□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.31□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.31□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.31□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.31□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.31□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 YOL085CYOL085C 342 nt13.31□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 YBR190WYBR190W 312 nt13.29□□□□□ -0.28
YMR254CQ04838 CCC1YLR220W 969 nt13.17□□□□□ -0.3
YMR254CQ04838 RPP1BYDL130W 321 nt13.16□□□□□ -0.3
YMR254CQ04838 PKP1YIL042C 1185 nt13.08□□□□□ -0.32
YMR254CQ04838 RTC3YHR087W 336 nt12.98□□□□□ -0.33
YMR254CQ04838 RVS167YDR388W 1449 nt12.88□□□□□ -0.35
YMR254CQ04838 SCJ1YMR214W 1134 nt12.63□□□□□ -0.39
YMR254CQ04838 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.57□□□□□ -0.4
YMR254CQ04838 PET122YER153C 765 nt12.54□□□□□ -0.4
YMR254CQ04838 SCR1SCR1 522 nt12.48□□□□□ -0.41
YMR254CQ04838 ATS1YAL020C 1002 nt12.42□□□□□ -0.42
YMR254CQ04838 SHR5YOL110W 714 nt12.35□□□□□ -0.43
YMR254CQ04838 RRN5YLR141W 1092 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR254CQ04838 YDJ1YNL064C 1230 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR254CQ04838 PUT4YOR348C 1884 nt12.14□□□□□ -0.47
YMR254CQ04838 URN1YPR152C 1398 nt12.06□□□□□ -0.48
YMR254CQ04838 DEP1YAL013W 1218 nt11.98□□□□□ -0.49
YMR254CQ04838 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.94□□□□□ -0.5
YMR254CQ04838 RPN10YHR200W 807 nt11.94□□□□□ -0.5
YMR254CQ04838 OPI9YLR338W 858 nt11.93□□□□□ -0.5
YMR254CQ04838 RSB1YOR049C 1065 nt11.92□□□□□ -0.5
YMR254CQ04838 GAR1YHR089C 618 nt11.89□□□□□ -0.51
YMR254CQ04838 SAH1YER043C 1350 nt11.87□□□□□ -0.51
YMR254CQ04838 ARE1YCR048W 1833 nt11.86□□□□□ -0.51
YMR254CQ04838 YNL208WYNL208W 600 nt11.85□□□□□ -0.51
YMR254CQ04838 POA1YBR022W 534 nt11.76□□□□□ -0.53
YMR254CQ04838 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.73□□□□□ -0.53
YMR254CQ04838 SSA3YBL075C 1950 nt11.7□□□□□ -0.54
YMR254CQ04838 PUN1YLR414C 792 nt11.62□□□□□ -0.55
YMR254CQ04838 BSC6YOL137W 1494 nt11.54□□□□□ -0.56
YMR254CQ04838 PST2YDR032C 597 nt11.51□□□□□ -0.57
YMR254CQ04838 TIR1YER011W 765 nt11.51□□□□□ -0.57
YMR254CQ04838 YJR018WYJR018W 363 nt11.51□□□□□ -0.57
YMR254CQ04838 BUD23YCR047C 828 nt11.47□□□□□ -0.57
YMR254CQ04838 PTC2YER089C 1395 nt11.46□□□□□ -0.57
YMR254CQ04838 NAB2YGL122C 1578 nt11.37□□□□□ -0.59
YMR254CQ04838 SSA1YAL005C 1929 nt11.34□□□□□ -0.59
YMR254CQ04838 RPP2BYDR382W 333 nt11.31□□□□□ -0.6
YMR254CQ04838 YJR120WYJR120W 351 nt11.2□□□□□ -0.62
YMR254CQ04838 DAL1YIR027C 1383 nt11.17□□□□□ -0.62
YMR254CQ04838 INM2YDR287W 879 nt11.16□□□□□ -0.62
YMR254CQ04838 FPR4YLR449W 1179 nt11.14□□□□□ -0.63
YMR254CQ04838 FIS1YIL065C 468 nt11.13□□□□□ -0.63
YMR254CQ04838 PHO4YFR034C 939 nt11.05□□□□□ -0.64
YMR254CQ04838 SPT5YML010W 3192 nt11.04□□□□□ -0.64
YMR254CQ04838 SHU1YHL006C 453 nt11.04□□□□□ -0.64
YMR254CQ04838 SRB2YHR041C 633 nt11.04□□□□□ -0.64
YMR254CQ04838 YKL097CYKL097C 411 nt11.04□□□□□ -0.64
YMR254CQ04838 BDH2YAL061W 1254 nt11.01□□□□□ -0.65
YMR254CQ04838 YBL100CYBL100C 315 nt11□□□□□ -0.65
YMR254CQ04838 WWM1YFL010C 636 nt10.95□□□□□ -0.66
YMR254CQ04838 YGR021WYGR021W 873 nt10.95□□□□□ -0.66
YMR254CQ04838 YPS1YLR120C 1710 nt10.89□□□□□ -0.67
YMR254CQ04838 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.89□□□□□ -0.67
YMR254CQ04838 LSM3YLR438C-A 270 nt10.87□□□□□ -0.67
YMR254CQ04838 MEP2YNL142W 1500 nt10.85□□□□□ -0.67
YMR254CQ04838 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.85□□□□□ -0.67
YMR254CQ04838 TRM9YML014W 840 nt10.85□□□□□ -0.67
YMR254CQ04838 FUN26YAL022C 1554 nt10.84□□□□□ -0.67
YMR254CQ04838 HOM6YJR139C 1080 nt10.83□□□□□ -0.68
YMR254CQ04838 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.82□□□□□ -0.68
YMR254CQ04838 YDR095CYDR095C 411 nt10.81□□□□□ -0.68
YMR254CQ04838 SSA4YER103W 1929 nt10.78□□□□□ -0.68
YMR254CQ04838 ALF1YNL148C 765 nt10.77□□□□□ -0.69
YMR254CQ04838 CCT6YDR188W 1641 nt10.71□□□□□ -0.69
YMR254CQ04838 MNP1YGL068W 585 nt10.71□□□□□ -0.69
YMR254CQ04838 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.7□□□□□ -0.7
YMR254CQ04838 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.7□□□□□ -0.7
YMR254CQ04838 RKM5YLR137W 1104 nt10.68□□□□□ -0.7
YMR254CQ04838 DCW1YKL046C 1350 nt10.64□□□□□ -0.71
YMR254CQ04838 RPP2AYOL039W 321 nt10.62□□□□□ -0.71
YMR254CQ04838 YOL037CYOL037C 354 nt10.59□□□□□ -0.71
YMR254CQ04838 YMR090WYMR090W 684 nt10.58□□□□□ -0.72
YMR254CQ04838 NPL3YDR432W 1245 nt10.57□□□□□ -0.72
YMR254CQ04838 SIS1YNL007C 1059 nt10.57□□□□□ -0.72
YMR254CQ04838 EMI2YDR516C 1503 nt10.54□□□□□ -0.72
YMR254CQ04838 PTP1YDL230W 1008 nt10.53□□□□□ -0.72
YMR254CQ04838 YOR139CYOR139C 393 nt10.53□□□□□ -0.72
YMR254CQ04838 YDL221WYDL221W 552 nt10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms