Protein–RNA interactions for Protein: P53394

YPR003C, Putative sulfate transporter YPR003C, yeastyeast

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR003CP53394 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.89■□□□□ 0.93
YPR003CP53394 NSR1YGR159C 1245 nt20.79■□□□□ 0.92
YPR003CP53394 NOP1YDL014W 984 nt20.2■□□□□ 0.82
YPR003CP53394 MDJ1YFL016C 1536 nt18.67■□□□□ 0.58
YPR003CP53394 YKL036CYKL036C 393 nt18.52■□□□□ 0.56
YPR003CP53394 SRX1YKL086W 384 nt17.62■□□□□ 0.41
YPR003CP53394 Q0297Q0297 156 nt17.59■□□□□ 0.41
YPR003CP53394 YJL027CYJL027C 417 nt17.29■□□□□ 0.36
YPR003CP53394 YCR051WYCR051W 669 nt16.79■□□□□ 0.28
YPR003CP53394 SCS3YGL126W 1143 nt16.78■□□□□ 0.28
YPR003CP53394 DBP2YNL112W 1641 nt16.39■□□□□ 0.21
YPR003CP53394 YOL085CYOL085C 342 nt16.04■□□□□ 0.16
YPR003CP53394 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.02■□□□□ 0.16
YPR003CP53394 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.02■□□□□ 0.16
YPR003CP53394 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.02■□□□□ 0.16
YPR003CP53394 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.02■□□□□ 0.16
YPR003CP53394 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.02■□□□□ 0.16
YPR003CP53394 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.02■□□□□ 0.16
YPR003CP53394 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.02■□□□□ 0.16
YPR003CP53394 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.02■□□□□ 0.16
YPR003CP53394 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.02■□□□□ 0.16
YPR003CP53394 CCC1YLR220W 969 nt15.95■□□□□ 0.14
YPR003CP53394 YBR190WYBR190W 312 nt15.89■□□□□ 0.13
YPR003CP53394 PKP1YIL042C 1185 nt15.87■□□□□ 0.13
YPR003CP53394 RPP1BYDL130W 321 nt15.82■□□□□ 0.12
YPR003CP53394 RTC3YHR087W 336 nt15.62■□□□□ 0.09
YPR003CP53394 RVS167YDR388W 1449 nt15.43■□□□□ 0.06
YPR003CP53394 SCJ1YMR214W 1134 nt15.32■□□□□ 0.04
YPR003CP53394 PET122YER153C 765 nt15.16■□□□□ 0.02
YPR003CP53394 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.13■□□□□ 0.01
YPR003CP53394 ATS1YAL020C 1002 nt14.96□□□□□ -0.01
YPR003CP53394 SCR1SCR1 522 nt14.96□□□□□ -0.01
YPR003CP53394 SHR5YOL110W 714 nt14.84□□□□□ -0.03
YPR003CP53394 RRN5YLR141W 1092 nt14.7□□□□□ -0.06
YPR003CP53394 YDJ1YNL064C 1230 nt14.6□□□□□ -0.07
YPR003CP53394 DEP1YAL013W 1218 nt14.54□□□□□ -0.08
YPR003CP53394 URN1YPR152C 1398 nt14.54□□□□□ -0.08
YPR003CP53394 PUT4YOR348C 1884 nt14.52□□□□□ -0.08
YPR003CP53394 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.4□□□□□ -0.1
YPR003CP53394 RSB1YOR049C 1065 nt14.39□□□□□ -0.11
YPR003CP53394 GAR1YHR089C 618 nt14.38□□□□□ -0.11
YPR003CP53394 OPI9YLR338W 858 nt14.31□□□□□ -0.12
YPR003CP53394 SAH1YER043C 1350 nt14.3□□□□□ -0.12
YPR003CP53394 RPN10YHR200W 807 nt14.28□□□□□ -0.12
YPR003CP53394 ARE1YCR048W 1833 nt14.24□□□□□ -0.13
YPR003CP53394 YNL208WYNL208W 600 nt14.23□□□□□ -0.13
YPR003CP53394 POA1YBR022W 534 nt14.12□□□□□ -0.15
YPR003CP53394 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.1□□□□□ -0.15
YPR003CP53394 PUN1YLR414C 792 nt13.91□□□□□ -0.18
YPR003CP53394 TIR1YER011W 765 nt13.87□□□□□ -0.19
YPR003CP53394 PST2YDR032C 597 nt13.85□□□□□ -0.19
YPR003CP53394 YJR018WYJR018W 363 nt13.84□□□□□ -0.19
YPR003CP53394 BSC6YOL137W 1494 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR003CP53394 SSA3YBL075C 1950 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR003CP53394 BUD23YCR047C 828 nt13.8□□□□□ -0.2
YPR003CP53394 PTC2YER089C 1395 nt13.79□□□□□ -0.2
YPR003CP53394 SSA1YAL005C 1929 nt13.72□□□□□ -0.21
YPR003CP53394 NAB2YGL122C 1578 nt13.6□□□□□ -0.23
YPR003CP53394 YJR120WYJR120W 351 nt13.57□□□□□ -0.24
YPR003CP53394 RPP2BYDR382W 333 nt13.55□□□□□ -0.24
YPR003CP53394 SRB2YHR041C 633 nt13.48□□□□□ -0.25
YPR003CP53394 FPR4YLR449W 1179 nt13.45□□□□□ -0.26
YPR003CP53394 DAL1YIR027C 1383 nt13.41□□□□□ -0.26
YPR003CP53394 FIS1YIL065C 468 nt13.4□□□□□ -0.26
YPR003CP53394 INM2YDR287W 879 nt13.35□□□□□ -0.27
YPR003CP53394 SHU1YHL006C 453 nt13.35□□□□□ -0.27
YPR003CP53394 PHO4YFR034C 939 nt13.29□□□□□ -0.28
YPR003CP53394 YKL097CYKL097C 411 nt13.28□□□□□ -0.28
YPR003CP53394 WWM1YFL010C 636 nt13.25□□□□□ -0.29
YPR003CP53394 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.24□□□□□ -0.29
YPR003CP53394 YBL100CYBL100C 315 nt13.23□□□□□ -0.29
YPR003CP53394 BDH2YAL061W 1254 nt13.22□□□□□ -0.29
YPR003CP53394 SPT5YML010W 3192 nt13.14□□□□□ -0.31
YPR003CP53394 YGR021WYGR021W 873 nt13.1□□□□□ -0.31
YPR003CP53394 FUN26YAL022C 1554 nt13.07□□□□□ -0.32
YPR003CP53394 YPS1YLR120C 1710 nt13.05□□□□□ -0.32
YPR003CP53394 HOM6YJR139C 1080 nt13.04□□□□□ -0.32
YPR003CP53394 TRM9YML014W 840 nt13.02□□□□□ -0.33
YPR003CP53394 MNP1YGL068W 585 nt13.01□□□□□ -0.33
YPR003CP53394 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13□□□□□ -0.33
YPR003CP53394 LSM3YLR438C-A 270 nt13□□□□□ -0.33
YPR003CP53394 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.98□□□□□ -0.33
YPR003CP53394 MEP2YNL142W 1500 nt12.96□□□□□ -0.33
YPR003CP53394 YDR095CYDR095C 411 nt12.94□□□□□ -0.34
YPR003CP53394 ALF1YNL148C 765 nt12.94□□□□□ -0.34
YPR003CP53394 RKM5YLR137W 1104 nt12.87□□□□□ -0.35
YPR003CP53394 CCT6YDR188W 1641 nt12.85□□□□□ -0.35
YPR003CP53394 SSA4YER103W 1929 nt12.79□□□□□ -0.36
YPR003CP53394 DCW1YKL046C 1350 nt12.79□□□□□ -0.36
YPR003CP53394 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.78□□□□□ -0.36
YPR003CP53394 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.78□□□□□ -0.36
YPR003CP53394 YOR139CYOR139C 393 nt12.75□□□□□ -0.37
YPR003CP53394 RPP2AYOL039W 321 nt12.72□□□□□ -0.37
YPR003CP53394 NPL3YDR432W 1245 nt12.71□□□□□ -0.37
YPR003CP53394 YOL037CYOL037C 354 nt12.7□□□□□ -0.38
YPR003CP53394 SIS1YNL007C 1059 nt12.67□□□□□ -0.38
YPR003CP53394 PTP1YDL230W 1008 nt12.66□□□□□ -0.38
YPR003CP53394 EMI2YDR516C 1503 nt12.61□□□□□ -0.39
YPR003CP53394 CAC2YML102W 1407 nt12.6□□□□□ -0.39
YPR003CP53394 YMR090WYMR090W 684 nt12.54□□□□□ -0.4
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