RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0144Q0144 MTC1P47018 478 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Q0144Q0144 DRS1P32892 752 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Q0144Q0144 FAP1P53971 965 aa21.29■■□□□ 1
Q0144Q0144 PRY3P47033 881 aa20■□□□□ 0.79
Q0144Q0144 PRI1P10363 409 aa19.76■□□□□ 0.75
Q0144Q0144 AAD16Q02895 342 aa19.69■□□□□ 0.74
Q0144Q0144 ISW2Q08773 1120 aa19.37■□□□□ 0.69
Q0144Q0144 RPG1P38249 964 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
Q0144Q0144 DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
Q0144Q0144 YCK3P39962 524 aa18.78■□□□□ 0.6
Q0144Q0144 HAA1Q12753 694 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
Q0144Q0144 TSR3Q12094 313 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
Q0144Q0144 RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
Q0144Q0144 AVT3P36062 692 aa18.06■□□□□ 0.48
Q0144Q0144 MRPL32P25348 183 aa17.97■□□□□ 0.47
Q0144Q0144 RPL17AP05740 184 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Q0144Q0144 RPL17BP46990 184 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Q0144Q0144 REB1P21538 810 aa17.75■□□□□ 0.43
Q0144Q0144 BFR2Q06631 534 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
Q0144Q0144 YGL015CP33199 130 aa17.32■□□□□ 0.36
Q0144Q0144 SPT21P35209 758 aa16.95■□□□□ 0.3
Q0144Q0144 CDC27P38042 758 aa16.94■□□□□ 0.3
Q0144Q0144 YKR023WP36119 530 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
Q0144Q0144 UBP10P53874 792 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
Q0144Q0144 TFC8Q12308 588 aa16.5■□□□□ 0.23
Q0144Q0144 HOP09932 586 aa16.48■□□□□ 0.23
Q0144Q0144 MAP2P38174 421 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Q0144Q0144 DCD1P06773 312 aa16.4■□□□□ 0.22
Q0144Q0144 RIM101P33400 625 aa16.3■□□□□ 0.2
Q0144Q0144 SCY1P53009 804 aa16.1■□□□□ 0.17
Q0144Q0144 BUD31P25337 157 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
Q0144Q0144 SLX5P32828 619 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Q0144Q0144 BCH2P36122 765 aa15.94■□□□□ 0.14
Q0144Q0144 TIF4632P39936 914 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Q0144Q0144 TGL3P40308 642 aa15.83■□□□□ 0.12
Q0144Q0144 OXP1P28273 1286 aa15.7■□□□□ 0.1
Q0144Q0144 YIL055CP40523 627 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Q0144Q0144 PTP3P40048 928 aa15.55■□□□□ 0.08
Q0144Q0144 EPS1P40557 701 aa15.54■□□□□ 0.08
Q0144Q0144 UBP9P39967 754 aa15.49■□□□□ 0.07
Q0144Q0144 BDF1P35817 686 aa15.47■□□□□ 0.07
Q0144Q0144 TFA1P36100 482 aa15.35■□□□□ 0.05
Q0144Q0144 RSM7P47150 247 aa15.3■□□□□ 0.04
Q0144Q0144 BBC1P47068 1157 aa15.27■□□□□ 0.04
Q0144Q0144 YAH1Q12184 172 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
Q0144Q0144 SIS1P25294 352 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Q0144Q0144 AI2P03876 854 aa15.18■□□□□ 0.02
Q0144Q0144 MST1P07236 462 aa15.11■□□□□ 0.01
Q0144Q0144 YOR238WQ08634 303 aa15.08■□□□□ 0
Q0144Q0144 NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data15.07■□□□□ 0not detected
Q0144Q0144 YLR271WQ06152 274 aa14.95□□□□□ -0.02
Q0144Q0144 YAP5P40574 245 aa14.94□□□□□ -0.02
Q0144Q0144 YBL029C-AQ3E756 94 aa14.91□□□□□ -0.02
Q0144Q0144 PSD2P53037 1138 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Q0144Q0144 VNX1P42839 908 aa14.75□□□□□ -0.05
Q0144Q0144 SSP1P38871 571 aa14.72□□□□□ -0.05
Q0144Q0144 ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data14.71□□□□□ -0.05not detected
Q0144Q0144 WSC3Q12215 556 aa14.65□□□□□ -0.06
Q0144Q0144 GTT3P39996 337 aa14.64□□□□□ -0.07
Q0144Q0144 SPP1Q03012 353 aa14.64□□□□□ -0.07
Q0144Q0144 MRM1P25270 412 aa14.61□□□□□ -0.07
Q0144Q0144 TIF11P38912 153 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Q0144Q0144 PIB1Q06651 286 aa14.48□□□□□ -0.09
Q0144Q0144 MGA2P40578 1113 aa14.41□□□□□ -0.1
Q0144Q0144 CST9Q06032 482 aa14.4□□□□□ -0.1
Q0144Q0144 FKH1P40466 484 aa14.32□□□□□ -0.12
Q0144Q0144 YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data14.32□□□□□ -0.12not detected
Q0144Q0144 RTG3P38165 486 aa14.31□□□□□ -0.12
Q0144Q0144 ULI1P43604 169 aa14.3□□□□□ -0.12
Q0144Q0144 AIR2Q12476 344 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
Q0144Q0144 MSB4Q12317 492 aa14.29□□□□□ -0.12
Q0144Q0144 VPS29P38759 282 aa14.27□□□□□ -0.13
Q0144Q0144 LDB19Q12502 818 aa14.26□□□□□ -0.13
Q0144Q0144 YJL171CP46992 396 aa14.25□□□□□ -0.13
Q0144Q0144 DBP1P24784 617 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
Q0144Q0144 IOC2Q12072 812 aa14.23□□□□□ -0.13
Q0144Q0144 EAP1P36041 632 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
Q0144Q0144 YFR006WP43590 535 aa14.17□□□□□ -0.14
Q0144Q0144 YOL036WQ08206 761 aa14.17□□□□□ -0.14
Q0144Q0144 STS1P38637 319 aa14.14□□□□□ -0.15
Q0144Q0144 SET4P42948 560 aa14.14□□□□□ -0.15
Q0144Q0144 VMA1P17255 1071 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
Q0144Q0144 RCR1P38212 213 aa14.07□□□□□ -0.16
Q0144Q0144 SAM3Q08986 587 aa14.05□□□□□ -0.16
Q0144Q0144 TRP5P00931 707 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
Q0144Q0144 BMT6Q12291 365 aa14.04□□□□□ -0.16
Q0144Q0144 RTG1P32607 177 aa14□□□□□ -0.17
Q0144Q0144 YNL035CP53962 389 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
Q0144Q0144 NCR1Q12200 1170 aa13.91□□□□□ -0.18
Q0144Q0144 SEC61P32915 480 aa13.89□□□□□ -0.19
Q0144Q0144 ABP1P15891 592 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
Q0144Q0144 GYP5Q12344 894 aa13.85□□□□□ -0.19
Q0144Q0144 TFG1P41895 735 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
Q0144Q0144 JIP4Q03361 876 aa13.78□□□□□ -0.2
Q0144Q0144 HTA1P04911 132 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
Q0144Q0144 HTA2P04912 132 aa13.76□□□□□ -0.21
Q0144Q0144 DCW1P36091 449 aa13.72□□□□□ -0.21
Q0144Q0144 DAN4P47179 1161 aa13.72□□□□□ -0.21
Q0144Q0144 MAK11P20484 414 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
Q0144Q0144 YEL023CP39992 682 aa13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.2 ms