Protein–RNA interactions for Protein: Q04930

CRF1, Transcription factor CRF1, yeastyeast

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CRF1Q04930 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.48■■□□□ 1.51
CRF1Q04930 NOP1YDL014W 984 nt24.07■■□□□ 1.44
CRF1Q04930 NSR1YGR159C 1245 nt23.85■■□□□ 1.41
CRF1Q04930 YKL036CYKL036C 393 nt22.69■■□□□ 1.22
CRF1Q04930 YJL027CYJL027C 417 nt21.3■■□□□ 1
CRF1Q04930 Q0297Q0297 156 nt21.19■□□□□ 0.98
CRF1Q04930 SRX1YKL086W 384 nt20.98■□□□□ 0.95
CRF1Q04930 SCS3YGL126W 1143 nt20.88■□□□□ 0.93
CRF1Q04930 MDJ1YFL016C 1536 nt20.6■□□□□ 0.89
CRF1Q04930 YCR051WYCR051W 669 nt19.99■□□□□ 0.79
CRF1Q04930 YOL085CYOL085C 342 nt19.6■□□□□ 0.73
CRF1Q04930 PKP1YIL042C 1185 nt19.24■□□□□ 0.67
CRF1Q04930 SCJ1YMR214W 1134 nt19.24■□□□□ 0.67
CRF1Q04930 RPP1BYDL130W 321 nt19.03■□□□□ 0.64
CRF1Q04930 ATS1YAL020C 1002 nt18.85■□□□□ 0.61
CRF1Q04930 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.61■□□□□ 0.57
CRF1Q04930 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.61■□□□□ 0.57
CRF1Q04930 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.61■□□□□ 0.57
CRF1Q04930 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.61■□□□□ 0.57
CRF1Q04930 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.61■□□□□ 0.57
CRF1Q04930 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.61■□□□□ 0.57
CRF1Q04930 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.61■□□□□ 0.57
CRF1Q04930 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.61■□□□□ 0.57
CRF1Q04930 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.61■□□□□ 0.57
CRF1Q04930 CCC1YLR220W 969 nt18.49■□□□□ 0.55
CRF1Q04930 DBP2YNL112W 1641 nt18.39■□□□□ 0.53
CRF1Q04930 SCR1SCR1 522 nt18.13■□□□□ 0.49
CRF1Q04930 PET122YER153C 765 nt18.08■□□□□ 0.48
CRF1Q04930 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.8■□□□□ 0.44
CRF1Q04930 RRN5YLR141W 1092 nt17.64■□□□□ 0.41
CRF1Q04930 RVS167YDR388W 1449 nt17.58■□□□□ 0.41
CRF1Q04930 RTC3YHR087W 336 nt17.5■□□□□ 0.39
CRF1Q04930 RSB1YOR049C 1065 nt17.47■□□□□ 0.39
CRF1Q04930 YBR190WYBR190W 312 nt17.46■□□□□ 0.39
CRF1Q04930 PST2YDR032C 597 nt17.34■□□□□ 0.37
CRF1Q04930 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.28■□□□□ 0.36
CRF1Q04930 YDJ1YNL064C 1230 nt17.24■□□□□ 0.35
CRF1Q04930 SHR5YOL110W 714 nt17.04■□□□□ 0.32
CRF1Q04930 YKL097CYKL097C 411 nt17■□□□□ 0.31
CRF1Q04930 GAR1YHR089C 618 nt16.77■□□□□ 0.28
CRF1Q04930 SHU1YHL006C 453 nt16.5■□□□□ 0.23
CRF1Q04930 DEP1YAL013W 1218 nt16.36■□□□□ 0.21
CRF1Q04930 URN1YPR152C 1398 nt16.22■□□□□ 0.19
CRF1Q04930 YNL208WYNL208W 600 nt16.19■□□□□ 0.18
CRF1Q04930 TIR1YER011W 765 nt16.18■□□□□ 0.18
CRF1Q04930 RPN10YHR200W 807 nt16.18■□□□□ 0.18
CRF1Q04930 YOR139CYOR139C 393 nt16.14■□□□□ 0.17
CRF1Q04930 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.09■□□□□ 0.17
CRF1Q04930 NPL3YDR432W 1245 nt15.98■□□□□ 0.15
CRF1Q04930 OPI9YLR338W 858 nt15.86■□□□□ 0.13
CRF1Q04930 SSA1YAL005C 1929 nt15.82■□□□□ 0.12
CRF1Q04930 YGR021WYGR021W 873 nt15.68■□□□□ 0.1
CRF1Q04930 SAH1YER043C 1350 nt15.61■□□□□ 0.09
CRF1Q04930 YOL037CYOL037C 354 nt15.6■□□□□ 0.09
CRF1Q04930 MNP1YGL068W 585 nt15.58■□□□□ 0.08
CRF1Q04930 SRB2YHR041C 633 nt15.58■□□□□ 0.08
CRF1Q04930 HOM6YJR139C 1080 nt15.58■□□□□ 0.08
CRF1Q04930 WWM1YFL010C 636 nt15.54■□□□□ 0.08
CRF1Q04930 YJR018WYJR018W 363 nt15.52■□□□□ 0.08
CRF1Q04930 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.49■□□□□ 0.07
CRF1Q04930 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.49■□□□□ 0.07
CRF1Q04930 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.49■□□□□ 0.07
CRF1Q04930 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.49■□□□□ 0.07
CRF1Q04930 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.49■□□□□ 0.07
CRF1Q04930 PUN1YLR414C 792 nt15.44■□□□□ 0.06
CRF1Q04930 RPP2BYDR382W 333 nt15.41■□□□□ 0.06
CRF1Q04930 RKM5YLR137W 1104 nt15.37■□□□□ 0.05
CRF1Q04930 PUT4YOR348C 1884 nt15.35■□□□□ 0.05
CRF1Q04930 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.31■□□□□ 0.04
CRF1Q04930 YJR120WYJR120W 351 nt15.28■□□□□ 0.04
CRF1Q04930 ARE1YCR048W 1833 nt15.25■□□□□ 0.03
CRF1Q04930 PUS2YGL063W 1113 nt15.22■□□□□ 0.03
CRF1Q04930 YLR281CYLR281C 468 nt15.16■□□□□ 0.02
CRF1Q04930 BDH2YAL061W 1254 nt15.14■□□□□ 0.01
CRF1Q04930 PTC2YER089C 1395 nt15.12■□□□□ 0.01
CRF1Q04930 MOT3YMR070W 1473 nt15.11■□□□□ 0.01
CRF1Q04930 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.09■□□□□ 0.01
CRF1Q04930 LSM3YLR438C-A 270 nt15.07■□□□□ 0
CRF1Q04930 WHI5YOR083W 888 nt15.04■□□□□ -0
CRF1Q04930 BSC6YOL137W 1494 nt15.03■□□□□ -0
CRF1Q04930 SSA3YBL075C 1950 nt15.01□□□□□ -0.01
CRF1Q04930 POA1YBR022W 534 nt14.97□□□□□ -0.01
CRF1Q04930 INM2YDR287W 879 nt14.93□□□□□ -0.02
CRF1Q04930 NAB2YGL122C 1578 nt14.86□□□□□ -0.03
CRF1Q04930 BUD23YCR047C 828 nt14.85□□□□□ -0.03
CRF1Q04930 YBL100CYBL100C 315 nt14.84□□□□□ -0.03
CRF1Q04930 FMP45YDL222C 930 nt14.83□□□□□ -0.04
CRF1Q04930 TRM9YML014W 840 nt14.81□□□□□ -0.04
CRF1Q04930 FPR4YLR449W 1179 nt14.8□□□□□ -0.04
CRF1Q04930 DSK2YMR276W 1122 nt14.8□□□□□ -0.04
CRF1Q04930 DAL1YIR027C 1383 nt14.77□□□□□ -0.04
CRF1Q04930 IMP2'YIL154C 1041 nt14.77□□□□□ -0.05
CRF1Q04930 MRPL8YJL063C 717 nt14.75□□□□□ -0.05
CRF1Q04930 YCH1YGR203W 447 nt14.73□□□□□ -0.05
CRF1Q04930 YPR011CYPR011C 981 nt14.7□□□□□ -0.06
CRF1Q04930 FUN26YAL022C 1554 nt14.68□□□□□ -0.06
CRF1Q04930 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.65□□□□□ -0.06
CRF1Q04930 YLR236CYLR236C 324 nt14.64□□□□□ -0.07
CRF1Q04930 FIS1YIL065C 468 nt14.63□□□□□ -0.07
CRF1Q04930 PHO4YFR034C 939 nt14.6□□□□□ -0.07
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