Protein–RNA interactions for Protein: P53389

HOL1, Protein HOL1, yeastyeast

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOL1P53389 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.62■□□□□ 0.57
HOL1P53389 NSR1YGR159C 1245 nt18.29■□□□□ 0.52
HOL1P53389 NOP1YDL014W 984 nt18.26■□□□□ 0.51
HOL1P53389 YKL036CYKL036C 393 nt17.04■□□□□ 0.32
HOL1P53389 Q0297Q0297 156 nt16■□□□□ 0.15
HOL1P53389 YJL027CYJL027C 417 nt15.96■□□□□ 0.15
HOL1P53389 MDJ1YFL016C 1536 nt15.94■□□□□ 0.14
HOL1P53389 SRX1YKL086W 384 nt15.9■□□□□ 0.14
HOL1P53389 SCS3YGL126W 1143 nt15.58■□□□□ 0.08
HOL1P53389 YCR051WYCR051W 669 nt15.13■□□□□ 0.01
HOL1P53389 YOL085CYOL085C 342 nt14.71□□□□□ -0.05
HOL1P53389 PKP1YIL042C 1185 nt14.45□□□□□ -0.1
HOL1P53389 RPP1BYDL130W 321 nt14.37□□□□□ -0.11
HOL1P53389 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.19□□□□□ -0.14
HOL1P53389 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.19□□□□□ -0.14
HOL1P53389 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.19□□□□□ -0.14
HOL1P53389 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.19□□□□□ -0.14
HOL1P53389 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.19□□□□□ -0.14
HOL1P53389 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.19□□□□□ -0.14
HOL1P53389 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.19□□□□□ -0.14
HOL1P53389 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.19□□□□□ -0.14
HOL1P53389 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.19□□□□□ -0.14
HOL1P53389 SCJ1YMR214W 1134 nt14.17□□□□□ -0.14
HOL1P53389 DBP2YNL112W 1641 nt14.15□□□□□ -0.14
HOL1P53389 CCC1YLR220W 969 nt14.1□□□□□ -0.15
HOL1P53389 ATS1YAL020C 1002 nt14.02□□□□□ -0.17
HOL1P53389 SCR1SCR1 522 nt13.68□□□□□ -0.22
HOL1P53389 PET122YER153C 765 nt13.66□□□□□ -0.22
HOL1P53389 YBR190WYBR190W 312 nt13.58□□□□□ -0.24
HOL1P53389 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.53□□□□□ -0.24
HOL1P53389 RVS167YDR388W 1449 nt13.53□□□□□ -0.24
HOL1P53389 Q0182Q0182 405 nt13.42□□□□□ -0.26
HOL1P53389 RTC3YHR087W 336 nt13.33□□□□□ -0.28
HOL1P53389 RRN5YLR141W 1092 nt13.31□□□□□ -0.28
HOL1P53389 RSB1YOR049C 1065 nt13.15□□□□□ -0.3
HOL1P53389 YDJ1YNL064C 1230 nt13.1□□□□□ -0.31
HOL1P53389 SHR5YOL110W 714 nt13.06□□□□□ -0.32
HOL1P53389 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.04□□□□□ -0.32
HOL1P53389 PST2YDR032C 597 nt12.92□□□□□ -0.34
HOL1P53389 MOT3YMR070W 1473 nt12.78□□□□□ -0.36
HOL1P53389 GAR1YHR089C 618 nt12.77□□□□□ -0.37
HOL1P53389 SSA1YAL005C 1929 nt12.7□□□□□ -0.38
HOL1P53389 SSA3YBL075C 1950 nt12.64□□□□□ -0.39
HOL1P53389 YKL097CYKL097C 411 nt12.6□□□□□ -0.39
HOL1P53389 DEP1YAL013W 1218 nt12.58□□□□□ -0.4
HOL1P53389 URN1YPR152C 1398 nt12.53□□□□□ -0.4
HOL1P53389 RPN10YHR200W 807 nt12.49□□□□□ -0.41
HOL1P53389 YNL208WYNL208W 600 nt12.45□□□□□ -0.42
HOL1P53389 PUT4YOR348C 1884 nt12.42□□□□□ -0.42
HOL1P53389 TIR1YER011W 765 nt12.33□□□□□ -0.44
HOL1P53389 SHU1YHL006C 453 nt12.33□□□□□ -0.44
HOL1P53389 OPI9YLR338W 858 nt12.29□□□□□ -0.44
HOL1P53389 FPS1YLL043W 2010 nt12.13□□□□□ -0.47
HOL1P53389 SAH1YER043C 1350 nt12.12□□□□□ -0.47
HOL1P53389 ARE1YCR048W 1833 nt12.1□□□□□ -0.47
HOL1P53389 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.06□□□□□ -0.48
HOL1P53389 YJR018WYJR018W 363 nt11.99□□□□□ -0.49
HOL1P53389 PUN1YLR414C 792 nt11.98□□□□□ -0.49
HOL1P53389 YOR139CYOR139C 393 nt11.96□□□□□ -0.49
HOL1P53389 POA1YBR022W 534 nt11.94□□□□□ -0.5
HOL1P53389 NPL3YDR432W 1245 nt11.91□□□□□ -0.5
HOL1P53389 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.9□□□□□ -0.5
HOL1P53389 RPP2BYDR382W 333 nt11.88□□□□□ -0.51
HOL1P53389 YGR021WYGR021W 873 nt11.88□□□□□ -0.51
HOL1P53389 SRB2YHR041C 633 nt11.83□□□□□ -0.52
HOL1P53389 WWM1YFL010C 636 nt11.8□□□□□ -0.52
HOL1P53389 HOM6YJR139C 1080 nt11.78□□□□□ -0.52
HOL1P53389 BSC6YOL137W 1494 nt11.76□□□□□ -0.53
HOL1P53389 PTC2YER089C 1395 nt11.75□□□□□ -0.53
HOL1P53389 MNP1YGL068W 585 nt11.74□□□□□ -0.53
HOL1P53389 YJR120WYJR120W 351 nt11.73□□□□□ -0.53
HOL1P53389 YOL037CYOL037C 354 nt11.72□□□□□ -0.53
HOL1P53389 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.65□□□□□ -0.54
HOL1P53389 BDH2YAL061W 1254 nt11.62□□□□□ -0.55
HOL1P53389 RKM5YLR137W 1104 nt11.62□□□□□ -0.55
HOL1P53389 BUD23YCR047C 828 nt11.6□□□□□ -0.55
HOL1P53389 NVJ2YPR091C 2313 nt11.58□□□□□ -0.56
HOL1P53389 NAB2YGL122C 1578 nt11.58□□□□□ -0.56
HOL1P53389 INM2YDR287W 879 nt11.56□□□□□ -0.56
HOL1P53389 LSM3YLR438C-A 270 nt11.54□□□□□ -0.56
HOL1P53389 SPT5YML010W 3192 nt11.52□□□□□ -0.57
HOL1P53389 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.5□□□□□ -0.57
HOL1P53389 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.5□□□□□ -0.57
HOL1P53389 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.5□□□□□ -0.57
HOL1P53389 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.5□□□□□ -0.57
HOL1P53389 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.5□□□□□ -0.57
HOL1P53389 FPR4YLR449W 1179 nt11.48□□□□□ -0.57
HOL1P53389 DAL1YIR027C 1383 nt11.46□□□□□ -0.57
HOL1P53389 YBL100CYBL100C 315 nt11.46□□□□□ -0.57
HOL1P53389 TRM9YML014W 840 nt11.4□□□□□ -0.58
HOL1P53389 PUS2YGL063W 1113 nt11.38□□□□□ -0.59
HOL1P53389 YLR281CYLR281C 468 nt11.38□□□□□ -0.59
HOL1P53389 FIS1YIL065C 468 nt11.37□□□□□ -0.59
HOL1P53389 PHO4YFR034C 939 nt11.34□□□□□ -0.59
HOL1P53389 WHI5YOR083W 888 nt11.32□□□□□ -0.6
HOL1P53389 FUN26YAL022C 1554 nt11.32□□□□□ -0.6
HOL1P53389 RPM1RPM1 483 nt11.25□□□□□ -0.61
HOL1P53389 CCT6YDR188W 1641 nt11.2□□□□□ -0.62
HOL1P53389 PAC11YDR488C 1602 nt11.2□□□□□ -0.62
HOL1P53389 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.17□□□□□ -0.62
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