Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.47■□□□□ 0.71
PDR8Q06149 NSR1YGR159C 1245 nt19.39■□□□□ 0.69
PDR8Q06149 NOP1YDL014W 984 nt18.93■□□□□ 0.62
PDR8Q06149 YKL036CYKL036C 393 nt17.43■□□□□ 0.38
PDR8Q06149 MDJ1YFL016C 1536 nt17.23■□□□□ 0.35
PDR8Q06149 Q0297Q0297 156 nt16.56■□□□□ 0.24
PDR8Q06149 SRX1YKL086W 384 nt16.54■□□□□ 0.24
PDR8Q06149 YJL027CYJL027C 417 nt16.26■□□□□ 0.19
PDR8Q06149 SCS3YGL126W 1143 nt15.85■□□□□ 0.13
PDR8Q06149 YCR051WYCR051W 669 nt15.67■□□□□ 0.1
PDR8Q06149 DBP2YNL112W 1641 nt15.25■□□□□ 0.03
PDR8Q06149 YOL085CYOL085C 342 nt15.09■□□□□ 0.01
PDR8Q06149 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PDR8Q06149 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PDR8Q06149 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PDR8Q06149 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PDR8Q06149 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PDR8Q06149 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PDR8Q06149 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PDR8Q06149 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PDR8Q06149 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PDR8Q06149 RPP1BYDL130W 321 nt14.86□□□□□ -0.03
PDR8Q06149 PKP1YIL042C 1185 nt14.85□□□□□ -0.03
PDR8Q06149 CCC1YLR220W 969 nt14.8□□□□□ -0.04
PDR8Q06149 YBR190WYBR190W 312 nt14.71□□□□□ -0.05
PDR8Q06149 RTC3YHR087W 336 nt14.37□□□□□ -0.11
PDR8Q06149 RVS167YDR388W 1449 nt14.34□□□□□ -0.11
PDR8Q06149 SCJ1YMR214W 1134 nt14.26□□□□□ -0.13
PDR8Q06149 SSA3YBL075C 1950 nt14.2□□□□□ -0.14
PDR8Q06149 PET122YER153C 765 nt14.19□□□□□ -0.14
PDR8Q06149 ATS1YAL020C 1002 nt14.15□□□□□ -0.14
PDR8Q06149 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.14□□□□□ -0.15
PDR8Q06149 SCR1SCR1 522 nt14.04□□□□□ -0.16
PDR8Q06149 SHR5YOL110W 714 nt13.83□□□□□ -0.2
PDR8Q06149 RRN5YLR141W 1092 nt13.76□□□□□ -0.21
PDR8Q06149 YDJ1YNL064C 1230 nt13.69□□□□□ -0.22
PDR8Q06149 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.51□□□□□ -0.25
PDR8Q06149 RSB1YOR049C 1065 nt13.47□□□□□ -0.25
PDR8Q06149 URN1YPR152C 1398 nt13.45□□□□□ -0.26
PDR8Q06149 DEP1YAL013W 1218 nt13.42□□□□□ -0.26
PDR8Q06149 PUT4YOR348C 1884 nt13.39□□□□□ -0.27
PDR8Q06149 GAR1YHR089C 618 nt13.37□□□□□ -0.27
PDR8Q06149 RPN10YHR200W 807 nt13.26□□□□□ -0.29
PDR8Q06149 OPI9YLR338W 858 nt13.26□□□□□ -0.29
PDR8Q06149 YNL208WYNL208W 600 nt13.23□□□□□ -0.29
PDR8Q06149 SAH1YER043C 1350 nt13.19□□□□□ -0.3
PDR8Q06149 ARE1YCR048W 1833 nt13.14□□□□□ -0.31
PDR8Q06149 PST2YDR032C 597 nt13.12□□□□□ -0.31
PDR8Q06149 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.97□□□□□ -0.33
PDR8Q06149 TIR1YER011W 765 nt12.94□□□□□ -0.34
PDR8Q06149 POA1YBR022W 534 nt12.94□□□□□ -0.34
PDR8Q06149 PUN1YLR414C 792 nt12.88□□□□□ -0.35
PDR8Q06149 YJR018WYJR018W 363 nt12.82□□□□□ -0.36
PDR8Q06149 SSA1YAL005C 1929 nt12.8□□□□□ -0.36
PDR8Q06149 PTC2YER089C 1395 nt12.72□□□□□ -0.37
PDR8Q06149 BSC6YOL137W 1494 nt12.68□□□□□ -0.38
PDR8Q06149 BUD23YCR047C 828 nt12.64□□□□□ -0.39
PDR8Q06149 YJR120WYJR120W 351 nt12.63□□□□□ -0.39
PDR8Q06149 SHU1YHL006C 453 nt12.59□□□□□ -0.39
PDR8Q06149 YKL097CYKL097C 411 nt12.58□□□□□ -0.4
PDR8Q06149 NAB2YGL122C 1578 nt12.57□□□□□ -0.4
PDR8Q06149 RPP2BYDR382W 333 nt12.57□□□□□ -0.4
PDR8Q06149 SRB2YHR041C 633 nt12.56□□□□□ -0.4
PDR8Q06149 SPT5YML010W 3192 nt12.51□□□□□ -0.41
PDR8Q06149 SSA4YER103W 1929 nt12.41□□□□□ -0.42
PDR8Q06149 FIS1YIL065C 468 nt12.41□□□□□ -0.42
PDR8Q06149 DAL1YIR027C 1383 nt12.41□□□□□ -0.42
PDR8Q06149 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.38□□□□□ -0.43
PDR8Q06149 INM2YDR287W 879 nt12.37□□□□□ -0.43
PDR8Q06149 WWM1YFL010C 636 nt12.35□□□□□ -0.43
PDR8Q06149 FPR4YLR449W 1179 nt12.35□□□□□ -0.43
PDR8Q06149 BDH2YAL061W 1254 nt12.32□□□□□ -0.44
PDR8Q06149 YGR021WYGR021W 873 nt12.3□□□□□ -0.44
PDR8Q06149 PHO4YFR034C 939 nt12.29□□□□□ -0.44
PDR8Q06149 YBL100CYBL100C 315 nt12.27□□□□□ -0.45
PDR8Q06149 HOM6YJR139C 1080 nt12.25□□□□□ -0.45
PDR8Q06149 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.18□□□□□ -0.46
PDR8Q06149 MNP1YGL068W 585 nt12.17□□□□□ -0.46
PDR8Q06149 LSM3YLR438C-A 270 nt12.16□□□□□ -0.46
PDR8Q06149 FUN26YAL022C 1554 nt12.11□□□□□ -0.47
PDR8Q06149 BDF1YLR399C 2061 nt12.08□□□□□ -0.48
PDR8Q06149 YOR139CYOR139C 393 nt12.08□□□□□ -0.48
PDR8Q06149 RKM5YLR137W 1104 nt12.07□□□□□ -0.48
PDR8Q06149 TRM9YML014W 840 nt12.07□□□□□ -0.48
PDR8Q06149 YPS1YLR120C 1710 nt12.06□□□□□ -0.48
PDR8Q06149 NPL3YDR432W 1245 nt11.99□□□□□ -0.49
PDR8Q06149 YOL037CYOL037C 354 nt11.99□□□□□ -0.49
PDR8Q06149 CCT6YDR188W 1641 nt11.98□□□□□ -0.49
PDR8Q06149 YDR095CYDR095C 411 nt11.98□□□□□ -0.49
PDR8Q06149 ALF1YNL148C 765 nt11.94□□□□□ -0.5
PDR8Q06149 MEP2YNL142W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
PDR8Q06149 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.91□□□□□ -0.5
PDR8Q06149 TAT1YBR069C 1860 nt11.91□□□□□ -0.5
PDR8Q06149 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.87□□□□□ -0.51
PDR8Q06149 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.87□□□□□ -0.51
PDR8Q06149 PAC11YDR488C 1602 nt11.81□□□□□ -0.52
PDR8Q06149 SIS1YNL007C 1059 nt11.77□□□□□ -0.53
PDR8Q06149 RPP2AYOL039W 321 nt11.75□□□□□ -0.53
PDR8Q06149 DCW1YKL046C 1350 nt11.72□□□□□ -0.53
PDR8Q06149 PTP1YDL230W 1008 nt11.7□□□□□ -0.54
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