Protein–RNA interactions for Protein: Q03254

FCP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, yeastyeast

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Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FCP1Q03254 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.22■■□□□ 1.63
FCP1Q03254 NSR1YGR159C 1245 nt24.77■■□□□ 1.56
FCP1Q03254 NOP1YDL014W 984 nt24.53■■□□□ 1.52
FCP1Q03254 YKL036CYKL036C 393 nt22.99■■□□□ 1.27
FCP1Q03254 MDJ1YFL016C 1536 nt21.83■■□□□ 1.09
FCP1Q03254 Q0297Q0297 156 nt21.67■■□□□ 1.06
FCP1Q03254 YJL027CYJL027C 417 nt21.52■■□□□ 1.04
FCP1Q03254 SRX1YKL086W 384 nt21.52■■□□□ 1.04
FCP1Q03254 SCS3YGL126W 1143 nt21.15■□□□□ 0.98
FCP1Q03254 YCR051WYCR051W 669 nt20.44■□□□□ 0.86
FCP1Q03254 YOL085CYOL085C 342 nt19.97■□□□□ 0.79
FCP1Q03254 PKP1YIL042C 1185 nt19.67■□□□□ 0.74
FCP1Q03254 DBP2YNL112W 1641 nt19.49■□□□□ 0.71
FCP1Q03254 RPP1BYDL130W 321 nt19.44■□□□□ 0.7
FCP1Q03254 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.33■□□□□ 0.68
FCP1Q03254 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.33■□□□□ 0.68
FCP1Q03254 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.33■□□□□ 0.68
FCP1Q03254 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.33■□□□□ 0.68
FCP1Q03254 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.33■□□□□ 0.68
FCP1Q03254 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.33■□□□□ 0.68
FCP1Q03254 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.33■□□□□ 0.68
FCP1Q03254 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.33■□□□□ 0.68
FCP1Q03254 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.33■□□□□ 0.68
FCP1Q03254 CCC1YLR220W 969 nt19.13■□□□□ 0.65
FCP1Q03254 SCJ1YMR214W 1134 nt19■□□□□ 0.63
FCP1Q03254 ATS1YAL020C 1002 nt18.99■□□□□ 0.63
FCP1Q03254 PET122YER153C 765 nt18.6■□□□□ 0.57
FCP1Q03254 YBR190WYBR190W 312 nt18.43■□□□□ 0.54
FCP1Q03254 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.38■□□□□ 0.53
FCP1Q03254 SCR1SCR1 522 nt18.33■□□□□ 0.52
FCP1Q03254 RVS167YDR388W 1449 nt18.16■□□□□ 0.5
FCP1Q03254 RRN5YLR141W 1092 nt18.08■□□□□ 0.48
FCP1Q03254 RTC3YHR087W 336 nt18.02■□□□□ 0.48
FCP1Q03254 RSB1YOR049C 1065 nt17.75■□□□□ 0.43
FCP1Q03254 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.74■□□□□ 0.43
FCP1Q03254 YDJ1YNL064C 1230 nt17.73■□□□□ 0.43
FCP1Q03254 SHR5YOL110W 714 nt17.68■□□□□ 0.42
FCP1Q03254 PST2YDR032C 597 nt17.56■□□□□ 0.4
FCP1Q03254 GAR1YHR089C 618 nt17.33■□□□□ 0.36
FCP1Q03254 DEP1YAL013W 1218 nt17.16■□□□□ 0.34
FCP1Q03254 URN1YPR152C 1398 nt17.04■□□□□ 0.32
FCP1Q03254 YKL097CYKL097C 411 nt16.95■□□□□ 0.3
FCP1Q03254 YNL208WYNL208W 600 nt16.83■□□□□ 0.28
FCP1Q03254 SHU1YHL006C 453 nt16.8■□□□□ 0.28
FCP1Q03254 TIR1YER011W 765 nt16.72■□□□□ 0.27
FCP1Q03254 OPI9YLR338W 858 nt16.72■□□□□ 0.27
FCP1Q03254 RPN10YHR200W 807 nt16.71■□□□□ 0.27
FCP1Q03254 PUT4YOR348C 1884 nt16.62■□□□□ 0.25
FCP1Q03254 SAH1YER043C 1350 nt16.59■□□□□ 0.25
FCP1Q03254 SSA1YAL005C 1929 nt16.55■□□□□ 0.24
FCP1Q03254 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.48■□□□□ 0.23
FCP1Q03254 SRB2YHR041C 633 nt16.46■□□□□ 0.23
FCP1Q03254 ARE1YCR048W 1833 nt16.42■□□□□ 0.22
FCP1Q03254 YOR139CYOR139C 393 nt16.34■□□□□ 0.21
FCP1Q03254 YJR018WYJR018W 363 nt16.25■□□□□ 0.19
FCP1Q03254 YJR120WYJR120W 351 nt16.23■□□□□ 0.19
FCP1Q03254 PUN1YLR414C 792 nt16.17■□□□□ 0.18
FCP1Q03254 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.15■□□□□ 0.18
FCP1Q03254 WWM1YFL010C 636 nt16.1■□□□□ 0.17
FCP1Q03254 POA1YBR022W 534 nt16.1■□□□□ 0.17
FCP1Q03254 MNP1YGL068W 585 nt16.05■□□□□ 0.16
FCP1Q03254 HOM6YJR139C 1080 nt16.03■□□□□ 0.16
FCP1Q03254 PTC2YER089C 1395 nt16■□□□□ 0.15
FCP1Q03254 NPL3YDR432W 1245 nt15.99■□□□□ 0.15
FCP1Q03254 YGR021WYGR021W 873 nt15.96■□□□□ 0.15
FCP1Q03254 SSA3YBL075C 1950 nt15.94■□□□□ 0.14
FCP1Q03254 RPP2BYDR382W 333 nt15.91■□□□□ 0.14
FCP1Q03254 RKM5YLR137W 1104 nt15.78■□□□□ 0.12
FCP1Q03254 BUD23YCR047C 828 nt15.77■□□□□ 0.12
FCP1Q03254 YOL037CYOL037C 354 nt15.76■□□□□ 0.11
FCP1Q03254 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.73■□□□□ 0.11
FCP1Q03254 BDH2YAL061W 1254 nt15.73■□□□□ 0.11
FCP1Q03254 NAB2YGL122C 1578 nt15.7■□□□□ 0.1
FCP1Q03254 BSC6YOL137W 1494 nt15.68■□□□□ 0.1
FCP1Q03254 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.66■□□□□ 0.1
FCP1Q03254 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.66■□□□□ 0.1
FCP1Q03254 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.66■□□□□ 0.1
FCP1Q03254 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.66■□□□□ 0.1
FCP1Q03254 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.66■□□□□ 0.1
FCP1Q03254 FIS1YIL065C 468 nt15.61■□□□□ 0.09
FCP1Q03254 INM2YDR287W 879 nt15.57■□□□□ 0.08
FCP1Q03254 DAL1YIR027C 1383 nt15.57■□□□□ 0.08
FCP1Q03254 LSM3YLR438C-A 270 nt15.54■□□□□ 0.08
FCP1Q03254 FPR4YLR449W 1179 nt15.54■□□□□ 0.08
FCP1Q03254 YBL100CYBL100C 315 nt15.53■□□□□ 0.08
FCP1Q03254 YLR281CYLR281C 468 nt15.46■□□□□ 0.07
FCP1Q03254 PHO4YFR034C 939 nt15.45■□□□□ 0.06
FCP1Q03254 PUS2YGL063W 1113 nt15.39■□□□□ 0.05
FCP1Q03254 FUN26YAL022C 1554 nt15.38■□□□□ 0.05
FCP1Q03254 WHI5YOR083W 888 nt15.36■□□□□ 0.05
FCP1Q03254 TRM9YML014W 840 nt15.34■□□□□ 0.05
FCP1Q03254 CCT6YDR188W 1641 nt15.23■□□□□ 0.03
FCP1Q03254 YPR011CYPR011C 981 nt15.21■□□□□ 0.03
FCP1Q03254 MOT3YMR070W 1473 nt15.14■□□□□ 0.01
FCP1Q03254 YLR236CYLR236C 324 nt15.11■□□□□ 0.01
FCP1Q03254 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.1■□□□□ 0.01
FCP1Q03254 YPS1YLR120C 1710 nt15.06■□□□□ 0
FCP1Q03254 DSK2YMR276W 1122 nt15.04■□□□□ -0
FCP1Q03254 FMP45YDL222C 930 nt15.01□□□□□ -0.01
FCP1Q03254 YDR095CYDR095C 411 nt15□□□□□ -0.01
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