Protein–RNA interactions for Protein: Q05123

ARP9, Actin-like protein ARP9, yeastyeast

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP9Q05123 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.84■□□□□ 0.93
ARP9Q05123 NSR1YGR159C 1245 nt20.76■□□□□ 0.91
ARP9Q05123 NOP1YDL014W 984 nt20.18■□□□□ 0.82
ARP9Q05123 YKL036CYKL036C 393 nt18.61■□□□□ 0.57
ARP9Q05123 MDJ1YFL016C 1536 nt18.53■□□□□ 0.56
ARP9Q05123 Q0297Q0297 156 nt17.7■□□□□ 0.42
ARP9Q05123 SRX1YKL086W 384 nt17.68■□□□□ 0.42
ARP9Q05123 YJL027CYJL027C 417 nt17.36■□□□□ 0.37
ARP9Q05123 SCS3YGL126W 1143 nt16.92■□□□□ 0.3
ARP9Q05123 YCR051WYCR051W 669 nt16.78■□□□□ 0.28
ARP9Q05123 DBP2YNL112W 1641 nt16.4■□□□□ 0.22
ARP9Q05123 YOL085CYOL085C 342 nt16.16■□□□□ 0.18
ARP9Q05123 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.03■□□□□ 0.16
ARP9Q05123 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.03■□□□□ 0.16
ARP9Q05123 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.03■□□□□ 0.16
ARP9Q05123 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.03■□□□□ 0.16
ARP9Q05123 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.03■□□□□ 0.16
ARP9Q05123 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.03■□□□□ 0.16
ARP9Q05123 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.03■□□□□ 0.16
ARP9Q05123 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.03■□□□□ 0.16
ARP9Q05123 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.03■□□□□ 0.16
ARP9Q05123 PKP1YIL042C 1185 nt15.95■□□□□ 0.14
ARP9Q05123 CCC1YLR220W 969 nt15.89■□□□□ 0.13
ARP9Q05123 RPP1BYDL130W 321 nt15.88■□□□□ 0.13
ARP9Q05123 YBR190WYBR190W 312 nt15.78■□□□□ 0.12
ARP9Q05123 RTC3YHR087W 336 nt15.42■□□□□ 0.06
ARP9Q05123 SCJ1YMR214W 1134 nt15.3■□□□□ 0.04
ARP9Q05123 RVS167YDR388W 1449 nt15.28■□□□□ 0.04
ARP9Q05123 PET122YER153C 765 nt15.21■□□□□ 0.03
ARP9Q05123 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.16■□□□□ 0.02
ARP9Q05123 ATS1YAL020C 1002 nt15.13■□□□□ 0.01
ARP9Q05123 SCR1SCR1 522 nt14.95□□□□□ -0.02
ARP9Q05123 SSA3YBL075C 1950 nt14.88□□□□□ -0.03
ARP9Q05123 RRN5YLR141W 1092 nt14.78□□□□□ -0.04
ARP9Q05123 SHR5YOL110W 714 nt14.78□□□□□ -0.04
ARP9Q05123 YDJ1YNL064C 1230 nt14.65□□□□□ -0.06
ARP9Q05123 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.47□□□□□ -0.09
ARP9Q05123 DEP1YAL013W 1218 nt14.45□□□□□ -0.1
ARP9Q05123 URN1YPR152C 1398 nt14.44□□□□□ -0.1
ARP9Q05123 RSB1YOR049C 1065 nt14.42□□□□□ -0.1
ARP9Q05123 PUT4YOR348C 1884 nt14.4□□□□□ -0.1
ARP9Q05123 GAR1YHR089C 618 nt14.36□□□□□ -0.11
ARP9Q05123 OPI9YLR338W 858 nt14.24□□□□□ -0.13
ARP9Q05123 SAH1YER043C 1350 nt14.19□□□□□ -0.14
ARP9Q05123 YNL208WYNL208W 600 nt14.15□□□□□ -0.14
ARP9Q05123 RPN10YHR200W 807 nt14.13□□□□□ -0.15
ARP9Q05123 ARE1YCR048W 1833 nt14.13□□□□□ -0.15
ARP9Q05123 PST2YDR032C 597 nt14.04□□□□□ -0.16
ARP9Q05123 POA1YBR022W 534 nt13.97□□□□□ -0.17
ARP9Q05123 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.93□□□□□ -0.18
ARP9Q05123 TIR1YER011W 765 nt13.87□□□□□ -0.19
ARP9Q05123 PUN1YLR414C 792 nt13.79□□□□□ -0.2
ARP9Q05123 YJR018WYJR018W 363 nt13.77□□□□□ -0.21
ARP9Q05123 SSA1YAL005C 1929 nt13.74□□□□□ -0.21
ARP9Q05123 PTC2YER089C 1395 nt13.67□□□□□ -0.22
ARP9Q05123 BSC6YOL137W 1494 nt13.66□□□□□ -0.22
ARP9Q05123 BUD23YCR047C 828 nt13.61□□□□□ -0.23
ARP9Q05123 YJR120WYJR120W 351 nt13.61□□□□□ -0.23
ARP9Q05123 SRB2YHR041C 633 nt13.58□□□□□ -0.24
ARP9Q05123 SHU1YHL006C 453 nt13.49□□□□□ -0.25
ARP9Q05123 NAB2YGL122C 1578 nt13.46□□□□□ -0.25
ARP9Q05123 RPP2BYDR382W 333 nt13.41□□□□□ -0.26
ARP9Q05123 YKL097CYKL097C 411 nt13.4□□□□□ -0.26
ARP9Q05123 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.34□□□□□ -0.27
ARP9Q05123 FIS1YIL065C 468 nt13.29□□□□□ -0.28
ARP9Q05123 DAL1YIR027C 1383 nt13.29□□□□□ -0.28
ARP9Q05123 WWM1YFL010C 636 nt13.28□□□□□ -0.28
ARP9Q05123 FPR4YLR449W 1179 nt13.27□□□□□ -0.29
ARP9Q05123 INM2YDR287W 879 nt13.26□□□□□ -0.29
ARP9Q05123 PHO4YFR034C 939 nt13.17□□□□□ -0.3
ARP9Q05123 BDH2YAL061W 1254 nt13.17□□□□□ -0.3
ARP9Q05123 SPT5YML010W 3192 nt13.14□□□□□ -0.31
ARP9Q05123 YBL100CYBL100C 315 nt13.12□□□□□ -0.31
ARP9Q05123 HOM6YJR139C 1080 nt13.11□□□□□ -0.31
ARP9Q05123 YGR021WYGR021W 873 nt13.09□□□□□ -0.31
ARP9Q05123 MNP1YGL068W 585 nt13.06□□□□□ -0.32
ARP9Q05123 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13□□□□□ -0.33
ARP9Q05123 FUN26YAL022C 1554 nt12.99□□□□□ -0.33
ARP9Q05123 SSA4YER103W 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
ARP9Q05123 LSM3YLR438C-A 270 nt12.98□□□□□ -0.33
ARP9Q05123 YOR139CYOR139C 393 nt12.95□□□□□ -0.34
ARP9Q05123 TRM9YML014W 840 nt12.94□□□□□ -0.34
ARP9Q05123 YPS1YLR120C 1710 nt12.93□□□□□ -0.34
ARP9Q05123 RKM5YLR137W 1104 nt12.9□□□□□ -0.34
ARP9Q05123 YDR095CYDR095C 411 nt12.85□□□□□ -0.35
ARP9Q05123 MEP2YNL142W 1500 nt12.82□□□□□ -0.36
ARP9Q05123 CCT6YDR188W 1641 nt12.8□□□□□ -0.36
ARP9Q05123 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.79□□□□□ -0.36
ARP9Q05123 ALF1YNL148C 765 nt12.78□□□□□ -0.36
ARP9Q05123 NPL3YDR432W 1245 nt12.77□□□□□ -0.37
ARP9Q05123 Q0182Q0182 405 nt12.77□□□□□ -0.37
ARP9Q05123 YOL037CYOL037C 354 nt12.74□□□□□ -0.37
ARP9Q05123 DCW1YKL046C 1350 nt12.67□□□□□ -0.38
ARP9Q05123 BDF1YLR399C 2061 nt12.66□□□□□ -0.38
ARP9Q05123 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.66□□□□□ -0.38
ARP9Q05123 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.66□□□□□ -0.38
ARP9Q05123 SIS1YNL007C 1059 nt12.64□□□□□ -0.39
ARP9Q05123 PTP1YDL230W 1008 nt12.63□□□□□ -0.39
ARP9Q05123 RPP2AYOL039W 321 nt12.62□□□□□ -0.39
ARP9Q05123 CAC2YML102W 1407 nt12.54□□□□□ -0.4
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