Protein–RNA interactions for Protein: P36160

RPF2, Ribosome biogenesis protein RPF2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPF2P36160 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.12■□□□□ 0.81
RPF2P36160 NSR1YGR159C 1245 nt19.97■□□□□ 0.79
RPF2P36160 NOP1YDL014W 984 nt19.63■□□□□ 0.73
RPF2P36160 YKL036CYKL036C 393 nt18.12■□□□□ 0.49
RPF2P36160 MDJ1YFL016C 1536 nt17.65■□□□□ 0.42
RPF2P36160 Q0297Q0297 156 nt17.16■□□□□ 0.34
RPF2P36160 SRX1YKL086W 384 nt17.12■□□□□ 0.33
RPF2P36160 YJL027CYJL027C 417 nt16.92■□□□□ 0.3
RPF2P36160 SCS3YGL126W 1143 nt16.48■□□□□ 0.23
RPF2P36160 YCR051WYCR051W 669 nt16.24■□□□□ 0.19
RPF2P36160 YOL085CYOL085C 342 nt15.66■□□□□ 0.1
RPF2P36160 DBP2YNL112W 1641 nt15.61■□□□□ 0.09
RPF2P36160 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.44■□□□□ 0.06
RPF2P36160 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.44■□□□□ 0.06
RPF2P36160 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.44■□□□□ 0.06
RPF2P36160 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.44■□□□□ 0.06
RPF2P36160 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.44■□□□□ 0.06
RPF2P36160 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.44■□□□□ 0.06
RPF2P36160 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.44■□□□□ 0.06
RPF2P36160 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.44■□□□□ 0.06
RPF2P36160 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.44■□□□□ 0.06
RPF2P36160 PKP1YIL042C 1185 nt15.4■□□□□ 0.06
RPF2P36160 RPP1BYDL130W 321 nt15.39■□□□□ 0.05
RPF2P36160 CCC1YLR220W 969 nt15.27■□□□□ 0.04
RPF2P36160 YBR190WYBR190W 312 nt15.08■□□□□ 0
RPF2P36160 RVS167YDR388W 1449 nt14.79□□□□□ -0.04
RPF2P36160 RTC3YHR087W 336 nt14.75□□□□□ -0.05
RPF2P36160 ATS1YAL020C 1002 nt14.75□□□□□ -0.05
RPF2P36160 SCJ1YMR214W 1134 nt14.69□□□□□ -0.06
RPF2P36160 PET122YER153C 765 nt14.68□□□□□ -0.06
RPF2P36160 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RPF2P36160 SCR1SCR1 522 nt14.6□□□□□ -0.07
RPF2P36160 RRN5YLR141W 1092 nt14.26□□□□□ -0.13
RPF2P36160 SHR5YOL110W 714 nt14.25□□□□□ -0.13
RPF2P36160 YDJ1YNL064C 1230 nt14.16□□□□□ -0.14
RPF2P36160 RSB1YOR049C 1065 nt14□□□□□ -0.17
RPF2P36160 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.98□□□□□ -0.17
RPF2P36160 GAR1YHR089C 618 nt13.82□□□□□ -0.2
RPF2P36160 URN1YPR152C 1398 nt13.81□□□□□ -0.2
RPF2P36160 DEP1YAL013W 1218 nt13.79□□□□□ -0.2
RPF2P36160 SSA3YBL075C 1950 nt13.71□□□□□ -0.21
RPF2P36160 RPN10YHR200W 807 nt13.68□□□□□ -0.22
RPF2P36160 PST2YDR032C 597 nt13.64□□□□□ -0.23
RPF2P36160 YNL208WYNL208W 600 nt13.62□□□□□ -0.23
RPF2P36160 OPI9YLR338W 858 nt13.61□□□□□ -0.23
RPF2P36160 PUT4YOR348C 1884 nt13.61□□□□□ -0.23
RPF2P36160 SAH1YER043C 1350 nt13.48□□□□□ -0.25
RPF2P36160 ARE1YCR048W 1833 nt13.37□□□□□ -0.27
RPF2P36160 TIR1YER011W 765 nt13.36□□□□□ -0.27
RPF2P36160 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.24□□□□□ -0.29
RPF2P36160 PUN1YLR414C 792 nt13.24□□□□□ -0.29
RPF2P36160 YJR018WYJR018W 363 nt13.19□□□□□ -0.3
RPF2P36160 POA1YBR022W 534 nt13.19□□□□□ -0.3
RPF2P36160 YKL097CYKL097C 411 nt13.16□□□□□ -0.3
RPF2P36160 SSA1YAL005C 1929 nt13.15□□□□□ -0.3
RPF2P36160 SHU1YHL006C 453 nt13.07□□□□□ -0.32
RPF2P36160 PTC2YER089C 1395 nt13.03□□□□□ -0.32
RPF2P36160 RPP2BYDR382W 333 nt12.98□□□□□ -0.33
RPF2P36160 BUD23YCR047C 828 nt12.94□□□□□ -0.34
RPF2P36160 YJR120WYJR120W 351 nt12.93□□□□□ -0.34
RPF2P36160 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
RPF2P36160 SRB2YHR041C 633 nt12.89□□□□□ -0.35
RPF2P36160 NAB2YGL122C 1578 nt12.87□□□□□ -0.35
RPF2P36160 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.83□□□□□ -0.36
RPF2P36160 YGR021WYGR021W 873 nt12.76□□□□□ -0.37
RPF2P36160 WWM1YFL010C 636 nt12.75□□□□□ -0.37
RPF2P36160 INM2YDR287W 879 nt12.73□□□□□ -0.37
RPF2P36160 DAL1YIR027C 1383 nt12.72□□□□□ -0.37
RPF2P36160 BDH2YAL061W 1254 nt12.69□□□□□ -0.38
RPF2P36160 FIS1YIL065C 468 nt12.68□□□□□ -0.38
RPF2P36160 FPR4YLR449W 1179 nt12.68□□□□□ -0.38
RPF2P36160 HOM6YJR139C 1080 nt12.67□□□□□ -0.38
RPF2P36160 YBL100CYBL100C 315 nt12.61□□□□□ -0.39
RPF2P36160 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.59□□□□□ -0.39
RPF2P36160 MNP1YGL068W 585 nt12.59□□□□□ -0.39
RPF2P36160 PHO4YFR034C 939 nt12.58□□□□□ -0.4
RPF2P36160 YOR139CYOR139C 393 nt12.57□□□□□ -0.4
RPF2P36160 LSM3YLR438C-A 270 nt12.55□□□□□ -0.4
RPF2P36160 NPL3YDR432W 1245 nt12.52□□□□□ -0.41
RPF2P36160 RKM5YLR137W 1104 nt12.49□□□□□ -0.41
RPF2P36160 YOL037CYOL037C 354 nt12.47□□□□□ -0.41
RPF2P36160 TRM9YML014W 840 nt12.45□□□□□ -0.42
RPF2P36160 FUN26YAL022C 1554 nt12.44□□□□□ -0.42
RPF2P36160 YPS1YLR120C 1710 nt12.31□□□□□ -0.44
RPF2P36160 CCT6YDR188W 1641 nt12.31□□□□□ -0.44
RPF2P36160 ALF1YNL148C 765 nt12.29□□□□□ -0.44
RPF2P36160 YDR095CYDR095C 411 nt12.25□□□□□ -0.45
RPF2P36160 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.24□□□□□ -0.45
RPF2P36160 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.24□□□□□ -0.45
RPF2P36160 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.19□□□□□ -0.46
RPF2P36160 SPT5YML010W 3192 nt12.18□□□□□ -0.46
RPF2P36160 YLR281CYLR281C 468 nt12.12□□□□□ -0.47
RPF2P36160 MEP2YNL142W 1500 nt12.11□□□□□ -0.47
RPF2P36160 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.09□□□□□ -0.47
RPF2P36160 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.09□□□□□ -0.47
RPF2P36160 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.09□□□□□ -0.47
RPF2P36160 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.09□□□□□ -0.47
RPF2P36160 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.09□□□□□ -0.47
RPF2P36160 WHI5YOR083W 888 nt12.08□□□□□ -0.48
RPF2P36160 SIS1YNL007C 1059 nt12.07□□□□□ -0.48
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