Protein–RNA interactions for Protein: Q12199

TIP41, Type 2A phosphatase activator TIP41, yeastyeast

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIP41Q12199 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.1■■□□□ 1.29
TIP41Q12199 NSR1YGR159C 1245 nt22.96■■□□□ 1.27
TIP41Q12199 NOP1YDL014W 984 nt22.44■■□□□ 1.18
TIP41Q12199 YKL036CYKL036C 393 nt20.66■□□□□ 0.9
TIP41Q12199 MDJ1YFL016C 1536 nt20.43■□□□□ 0.86
TIP41Q12199 Q0297Q0297 156 nt19.61■□□□□ 0.73
TIP41Q12199 SRX1YKL086W 384 nt19.59■□□□□ 0.73
TIP41Q12199 YJL027CYJL027C 417 nt19.29■□□□□ 0.68
TIP41Q12199 SCS3YGL126W 1143 nt18.76■□□□□ 0.59
TIP41Q12199 YCR051WYCR051W 669 nt18.6■□□□□ 0.57
TIP41Q12199 DBP2YNL112W 1641 nt18.02■□□□□ 0.48
TIP41Q12199 YOL085CYOL085C 342 nt17.88■□□□□ 0.45
TIP41Q12199 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.72■□□□□ 0.43
TIP41Q12199 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.72■□□□□ 0.43
TIP41Q12199 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.72■□□□□ 0.43
TIP41Q12199 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.72■□□□□ 0.43
TIP41Q12199 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.72■□□□□ 0.43
TIP41Q12199 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.72■□□□□ 0.43
TIP41Q12199 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.72■□□□□ 0.43
TIP41Q12199 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.72■□□□□ 0.43
TIP41Q12199 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.72■□□□□ 0.43
TIP41Q12199 PKP1YIL042C 1185 nt17.63■□□□□ 0.41
TIP41Q12199 RPP1BYDL130W 321 nt17.6■□□□□ 0.41
TIP41Q12199 CCC1YLR220W 969 nt17.58■□□□□ 0.4
TIP41Q12199 YBR190WYBR190W 312 nt17.43■□□□□ 0.38
TIP41Q12199 RTC3YHR087W 336 nt17.08■□□□□ 0.32
TIP41Q12199 RVS167YDR388W 1449 nt17.01■□□□□ 0.31
TIP41Q12199 SCJ1YMR214W 1134 nt16.86■□□□□ 0.29
TIP41Q12199 PET122YER153C 765 nt16.82■□□□□ 0.28
TIP41Q12199 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.77■□□□□ 0.28
TIP41Q12199 ATS1YAL020C 1002 nt16.77■□□□□ 0.28
TIP41Q12199 SCR1SCR1 522 nt16.66■□□□□ 0.26
TIP41Q12199 SHR5YOL110W 714 nt16.38■□□□□ 0.21
TIP41Q12199 RRN5YLR141W 1092 nt16.33■□□□□ 0.2
TIP41Q12199 YDJ1YNL064C 1230 nt16.21■□□□□ 0.19
TIP41Q12199 RSB1YOR049C 1065 nt16.01■□□□□ 0.15
TIP41Q12199 YER088W-BYER088W-B 147 nt16■□□□□ 0.15
TIP41Q12199 URN1YPR152C 1398 nt15.95■□□□□ 0.14
TIP41Q12199 DEP1YAL013W 1218 nt15.94■□□□□ 0.14
TIP41Q12199 GAR1YHR089C 618 nt15.88■□□□□ 0.13
TIP41Q12199 PUT4YOR348C 1884 nt15.82■□□□□ 0.12
TIP41Q12199 RPN10YHR200W 807 nt15.73■□□□□ 0.11
TIP41Q12199 OPI9YLR338W 858 nt15.71■□□□□ 0.11
TIP41Q12199 YNL208WYNL208W 600 nt15.68■□□□□ 0.1
TIP41Q12199 SAH1YER043C 1350 nt15.62■□□□□ 0.09
TIP41Q12199 ARE1YCR048W 1833 nt15.53■□□□□ 0.08
TIP41Q12199 PST2YDR032C 597 nt15.53■□□□□ 0.08
TIP41Q12199 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.36■□□□□ 0.05
TIP41Q12199 POA1YBR022W 534 nt15.35■□□□□ 0.05
TIP41Q12199 TIR1YER011W 765 nt15.34■□□□□ 0.05
TIP41Q12199 PUN1YLR414C 792 nt15.27■□□□□ 0.04
TIP41Q12199 YJR018WYJR018W 363 nt15.22■□□□□ 0.03
TIP41Q12199 SSA1YAL005C 1929 nt15.14■□□□□ 0.01
TIP41Q12199 PTC2YER089C 1395 nt15.09■□□□□ 0.01
TIP41Q12199 BUD23YCR047C 828 nt15.03■□□□□ -0
TIP41Q12199 BSC6YOL137W 1494 nt15.02■□□□□ -0
TIP41Q12199 SSA3YBL075C 1950 nt14.93□□□□□ -0.02
TIP41Q12199 RPP2BYDR382W 333 nt14.92□□□□□ -0.02
TIP41Q12199 YJR120WYJR120W 351 nt14.92□□□□□ -0.02
TIP41Q12199 YKL097CYKL097C 411 nt14.92□□□□□ -0.02
TIP41Q12199 SHU1YHL006C 453 nt14.91□□□□□ -0.02
TIP41Q12199 NAB2YGL122C 1578 nt14.9□□□□□ -0.02
TIP41Q12199 SRB2YHR041C 633 nt14.86□□□□□ -0.03
TIP41Q12199 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.71□□□□□ -0.05
TIP41Q12199 FPR4YLR449W 1179 nt14.69□□□□□ -0.06
TIP41Q12199 DAL1YIR027C 1383 nt14.69□□□□□ -0.06
TIP41Q12199 INM2YDR287W 879 nt14.68□□□□□ -0.06
TIP41Q12199 WWM1YFL010C 636 nt14.66□□□□□ -0.06
TIP41Q12199 FIS1YIL065C 468 nt14.66□□□□□ -0.06
TIP41Q12199 BDH2YAL061W 1254 nt14.59□□□□□ -0.07
TIP41Q12199 YGR021WYGR021W 873 nt14.58□□□□□ -0.08
TIP41Q12199 PHO4YFR034C 939 nt14.55□□□□□ -0.08
TIP41Q12199 YBL100CYBL100C 315 nt14.54□□□□□ -0.08
TIP41Q12199 HOM6YJR139C 1080 nt14.5□□□□□ -0.09
TIP41Q12199 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.43□□□□□ -0.1
TIP41Q12199 MNP1YGL068W 585 nt14.43□□□□□ -0.1
TIP41Q12199 LSM3YLR438C-A 270 nt14.39□□□□□ -0.11
TIP41Q12199 FUN26YAL022C 1554 nt14.35□□□□□ -0.11
TIP41Q12199 TRM9YML014W 840 nt14.34□□□□□ -0.11
TIP41Q12199 YOR139CYOR139C 393 nt14.31□□□□□ -0.12
TIP41Q12199 RKM5YLR137W 1104 nt14.29□□□□□ -0.12
TIP41Q12199 YPS1YLR120C 1710 nt14.26□□□□□ -0.13
TIP41Q12199 NPL3YDR432W 1245 nt14.24□□□□□ -0.13
TIP41Q12199 SPT5YML010W 3192 nt14.24□□□□□ -0.13
TIP41Q12199 ALF1YNL148C 765 nt14.19□□□□□ -0.14
TIP41Q12199 YOL037CYOL037C 354 nt14.18□□□□□ -0.14
TIP41Q12199 CCT6YDR188W 1641 nt14.17□□□□□ -0.14
TIP41Q12199 YDR095CYDR095C 411 nt14.17□□□□□ -0.14
TIP41Q12199 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.14□□□□□ -0.15
TIP41Q12199 MEP2YNL142W 1500 nt14.1□□□□□ -0.15
TIP41Q12199 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.08□□□□□ -0.16
TIP41Q12199 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.08□□□□□ -0.16
TIP41Q12199 SIS1YNL007C 1059 nt13.93□□□□□ -0.18
TIP41Q12199 RPP2AYOL039W 321 nt13.92□□□□□ -0.18
TIP41Q12199 DCW1YKL046C 1350 nt13.86□□□□□ -0.19
TIP41Q12199 YLR281CYLR281C 468 nt13.84□□□□□ -0.19
TIP41Q12199 PTP1YDL230W 1008 nt13.83□□□□□ -0.2
TIP41Q12199 WHI5YOR083W 888 nt13.82□□□□□ -0.2
TIP41Q12199 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.81□□□□□ -0.2
TIP41Q12199 SSA4YER103W 1929 nt13.77□□□□□ -0.21
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