Protein–RNA interactions for Protein: P53148

SPC105, Spindle pole body component SPC105, yeastyeast

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105P53148 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.58■□□□□ 0.89
SPC105P53148 NSR1YGR159C 1245 nt20.37■□□□□ 0.85
SPC105P53148 NOP1YDL014W 984 nt20.09■□□□□ 0.81
SPC105P53148 YKL036CYKL036C 393 nt18.62■□□□□ 0.57
SPC105P53148 MDJ1YFL016C 1536 nt17.93■□□□□ 0.46
SPC105P53148 Q0297Q0297 156 nt17.61■□□□□ 0.41
SPC105P53148 SRX1YKL086W 384 nt17.53■□□□□ 0.4
SPC105P53148 YJL027CYJL027C 417 nt17.4■□□□□ 0.38
SPC105P53148 SCS3YGL126W 1143 nt16.98■□□□□ 0.31
SPC105P53148 YCR051WYCR051W 669 nt16.63■□□□□ 0.25
SPC105P53148 YOL085CYOL085C 342 nt16.1■□□□□ 0.17
SPC105P53148 DBP2YNL112W 1641 nt15.9■□□□□ 0.14
SPC105P53148 PKP1YIL042C 1185 nt15.82■□□□□ 0.12
SPC105P53148 RPP1BYDL130W 321 nt15.79■□□□□ 0.12
SPC105P53148 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SPC105P53148 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SPC105P53148 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SPC105P53148 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SPC105P53148 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SPC105P53148 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SPC105P53148 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SPC105P53148 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SPC105P53148 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SPC105P53148 CCC1YLR220W 969 nt15.6■□□□□ 0.09
SPC105P53148 YBR190WYBR190W 312 nt15.3■□□□□ 0.04
SPC105P53148 SCJ1YMR214W 1134 nt15.23■□□□□ 0.03
SPC105P53148 ATS1YAL020C 1002 nt15.22■□□□□ 0.03
SPC105P53148 PET122YER153C 765 nt15.06■□□□□ 0
SPC105P53148 RVS167YDR388W 1449 nt15.06■□□□□ 0
SPC105P53148 SCR1SCR1 522 nt14.98□□□□□ -0.01
SPC105P53148 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.96□□□□□ -0.01
SPC105P53148 RTC3YHR087W 336 nt14.96□□□□□ -0.01
SPC105P53148 SSA3YBL075C 1950 nt14.82□□□□□ -0.04
SPC105P53148 RRN5YLR141W 1092 nt14.63□□□□□ -0.07
SPC105P53148 SHR5YOL110W 714 nt14.54□□□□□ -0.08
SPC105P53148 YDJ1YNL064C 1230 nt14.5□□□□□ -0.09
SPC105P53148 RSB1YOR049C 1065 nt14.38□□□□□ -0.11
SPC105P53148 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.34□□□□□ -0.11
SPC105P53148 Q0182Q0182 405 nt14.17□□□□□ -0.14
SPC105P53148 GAR1YHR089C 618 nt14.12□□□□□ -0.15
SPC105P53148 PST2YDR032C 597 nt14.07□□□□□ -0.16
SPC105P53148 URN1YPR152C 1398 nt14.05□□□□□ -0.16
SPC105P53148 DEP1YAL013W 1218 nt14.04□□□□□ -0.16
SPC105P53148 RPN10YHR200W 807 nt13.92□□□□□ -0.18
SPC105P53148 YNL208WYNL208W 600 nt13.88□□□□□ -0.19
SPC105P53148 OPI9YLR338W 858 nt13.82□□□□□ -0.2
SPC105P53148 PUT4YOR348C 1884 nt13.76□□□□□ -0.21
SPC105P53148 SAH1YER043C 1350 nt13.68□□□□□ -0.22
SPC105P53148 TIR1YER011W 765 nt13.66□□□□□ -0.22
SPC105P53148 YKL097CYKL097C 411 nt13.6□□□□□ -0.23
SPC105P53148 MOT3YMR070W 1473 nt13.55□□□□□ -0.24
SPC105P53148 ARE1YCR048W 1833 nt13.55□□□□□ -0.24
SPC105P53148 SHU1YHL006C 453 nt13.46□□□□□ -0.25
SPC105P53148 PUN1YLR414C 792 nt13.45□□□□□ -0.26
SPC105P53148 SSA1YAL005C 1929 nt13.44□□□□□ -0.26
SPC105P53148 YJR018WYJR018W 363 nt13.42□□□□□ -0.26
SPC105P53148 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.39□□□□□ -0.27
SPC105P53148 POA1YBR022W 534 nt13.34□□□□□ -0.27
SPC105P53148 PTC2YER089C 1395 nt13.22□□□□□ -0.29
SPC105P53148 RPP2BYDR382W 333 nt13.21□□□□□ -0.29
SPC105P53148 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.2□□□□□ -0.3
SPC105P53148 YJR120WYJR120W 351 nt13.19□□□□□ -0.3
SPC105P53148 SRB2YHR041C 633 nt13.18□□□□□ -0.3
SPC105P53148 BUD23YCR047C 828 nt13.09□□□□□ -0.31
SPC105P53148 YGR021WYGR021W 873 nt13.08□□□□□ -0.32
SPC105P53148 NAB2YGL122C 1578 nt13.06□□□□□ -0.32
SPC105P53148 WWM1YFL010C 636 nt13.05□□□□□ -0.32
SPC105P53148 BSC6YOL137W 1494 nt13.04□□□□□ -0.32
SPC105P53148 YOR139CYOR139C 393 nt13□□□□□ -0.33
SPC105P53148 HOM6YJR139C 1080 nt12.99□□□□□ -0.33
SPC105P53148 INM2YDR287W 879 nt12.94□□□□□ -0.34
SPC105P53148 BDH2YAL061W 1254 nt12.94□□□□□ -0.34
SPC105P53148 MNP1YGL068W 585 nt12.93□□□□□ -0.34
SPC105P53148 NPL3YDR432W 1245 nt12.91□□□□□ -0.34
SPC105P53148 DAL1YIR027C 1383 nt12.91□□□□□ -0.34
SPC105P53148 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.89□□□□□ -0.35
SPC105P53148 FPR4YLR449W 1179 nt12.87□□□□□ -0.35
SPC105P53148 FIS1YIL065C 468 nt12.86□□□□□ -0.35
SPC105P53148 SPT5YML010W 3192 nt12.85□□□□□ -0.35
SPC105P53148 YBL100CYBL100C 315 nt12.83□□□□□ -0.36
SPC105P53148 SSA4YER103W 1929 nt12.83□□□□□ -0.36
SPC105P53148 YOL037CYOL037C 354 nt12.82□□□□□ -0.36
SPC105P53148 LSM3YLR438C-A 270 nt12.81□□□□□ -0.36
SPC105P53148 RKM5YLR137W 1104 nt12.8□□□□□ -0.36
SPC105P53148 PHO4YFR034C 939 nt12.78□□□□□ -0.36
SPC105P53148 TRM9YML014W 840 nt12.68□□□□□ -0.38
SPC105P53148 FUN26YAL022C 1554 nt12.66□□□□□ -0.38
SPC105P53148 CCT6YDR188W 1641 nt12.54□□□□□ -0.4
SPC105P53148 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.49□□□□□ -0.41
SPC105P53148 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.49□□□□□ -0.41
SPC105P53148 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.49□□□□□ -0.41
SPC105P53148 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.49□□□□□ -0.41
SPC105P53148 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.49□□□□□ -0.41
SPC105P53148 ALF1YNL148C 765 nt12.49□□□□□ -0.41
SPC105P53148 YLR281CYLR281C 468 nt12.47□□□□□ -0.41
SPC105P53148 YPS1YLR120C 1710 nt12.47□□□□□ -0.41
SPC105P53148 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.45□□□□□ -0.42
SPC105P53148 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.45□□□□□ -0.42
SPC105P53148 BDF1YLR399C 2061 nt12.44□□□□□ -0.42
SPC105P53148 PAC11YDR488C 1602 nt12.44□□□□□ -0.42
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