Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.21■■■■■ 4.35
GJA3Q9Y6H8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
GJA3Q9Y6H8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
GJA3Q9Y6H8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
GJA3Q9Y6H8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
GJA3Q9Y6H8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
GJA3Q9Y6H8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
GJA3Q9Y6H8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
GJA3Q9Y6H8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
GJA3Q9Y6H8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
GJA3Q9Y6H8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
GJA3Q9Y6H8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.06■■■■■ 4
GJA3Q9Y6H8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
GJA3Q9Y6H8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
GJA3Q9Y6H8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
GJA3Q9Y6H8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
GJA3Q9Y6H8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GJA3Q9Y6H8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
GJA3Q9Y6H8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
GJA3Q9Y6H8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
GJA3Q9Y6H8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
GJA3Q9Y6H8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
GJA3Q9Y6H8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
GJA3Q9Y6H8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
GJA3Q9Y6H8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GJA3Q9Y6H8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
GJA3Q9Y6H8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
GJA3Q9Y6H8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GJA3Q9Y6H8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
GJA3Q9Y6H8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
GJA3Q9Y6H8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GJA3Q9Y6H8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GJA3Q9Y6H8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
GJA3Q9Y6H8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
GJA3Q9Y6H8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GJA3Q9Y6H8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
GJA3Q9Y6H8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
GJA3Q9Y6H8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
GJA3Q9Y6H8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
GJA3Q9Y6H8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GJA3Q9Y6H8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GJA3Q9Y6H8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GJA3Q9Y6H8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
GJA3Q9Y6H8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GJA3Q9Y6H8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GJA3Q9Y6H8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GJA3Q9Y6H8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GJA3Q9Y6H8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GJA3Q9Y6H8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GJA3Q9Y6H8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
GJA3Q9Y6H8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
GJA3Q9Y6H8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GJA3Q9Y6H8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GJA3Q9Y6H8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GJA3Q9Y6H8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GJA3Q9Y6H8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GJA3Q9Y6H8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GJA3Q9Y6H8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GJA3Q9Y6H8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
GJA3Q9Y6H8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GJA3Q9Y6H8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GJA3Q9Y6H8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GJA3Q9Y6H8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GJA3Q9Y6H8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GJA3Q9Y6H8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
GJA3Q9Y6H8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GJA3Q9Y6H8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GJA3Q9Y6H8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
GJA3Q9Y6H8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GJA3Q9Y6H8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GJA3Q9Y6H8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GJA3Q9Y6H8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GJA3Q9Y6H8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
GJA3Q9Y6H8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GJA3Q9Y6H8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GJA3Q9Y6H8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GJA3Q9Y6H8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GJA3Q9Y6H8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GJA3Q9Y6H8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GJA3Q9Y6H8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GJA3Q9Y6H8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GJA3Q9Y6H8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GJA3Q9Y6H8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GJA3Q9Y6H8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GJA3Q9Y6H8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GJA3Q9Y6H8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GJA3Q9Y6H8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GJA3Q9Y6H8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GJA3Q9Y6H8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
GJA3Q9Y6H8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GJA3Q9Y6H8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GJA3Q9Y6H8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
GJA3Q9Y6H8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GJA3Q9Y6H8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GJA3Q9Y6H8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GJA3Q9Y6H8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GJA3Q9Y6H8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GJA3Q9Y6H8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GJA3Q9Y6H8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GJA3Q9Y6H8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms