Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.97■■■■■ 5.11
NWD2Q9ULI1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.72■■■■■ 5.07
NWD2Q9ULI1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
NWD2Q9ULI1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
NWD2Q9ULI1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
NWD2Q9ULI1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
NWD2Q9ULI1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
NWD2Q9ULI1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
NWD2Q9ULI1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
NWD2Q9ULI1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
NWD2Q9ULI1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
NWD2Q9ULI1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.5■■■■■ 4.71
NWD2Q9ULI1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
NWD2Q9ULI1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NWD2Q9ULI1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
NWD2Q9ULI1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
NWD2Q9ULI1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
NWD2Q9ULI1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
NWD2Q9ULI1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
NWD2Q9ULI1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
NWD2Q9ULI1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
NWD2Q9ULI1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
NWD2Q9ULI1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
NWD2Q9ULI1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
NWD2Q9ULI1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
NWD2Q9ULI1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
NWD2Q9ULI1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
NWD2Q9ULI1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
NWD2Q9ULI1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.47
NWD2Q9ULI1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
NWD2Q9ULI1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
NWD2Q9ULI1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
NWD2Q9ULI1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NWD2Q9ULI1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
NWD2Q9ULI1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
NWD2Q9ULI1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
NWD2Q9ULI1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
NWD2Q9ULI1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
NWD2Q9ULI1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
NWD2Q9ULI1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.28
NWD2Q9ULI1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NWD2Q9ULI1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
NWD2Q9ULI1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
NWD2Q9ULI1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
NWD2Q9ULI1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NWD2Q9ULI1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
NWD2Q9ULI1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NWD2Q9ULI1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
NWD2Q9ULI1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NWD2Q9ULI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NWD2Q9ULI1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NWD2Q9ULI1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NWD2Q9ULI1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NWD2Q9ULI1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
NWD2Q9ULI1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
NWD2Q9ULI1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
NWD2Q9ULI1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
NWD2Q9ULI1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
NWD2Q9ULI1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NWD2Q9ULI1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NWD2Q9ULI1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NWD2Q9ULI1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
NWD2Q9ULI1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
NWD2Q9ULI1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NWD2Q9ULI1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NWD2Q9ULI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NWD2Q9ULI1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NWD2Q9ULI1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
NWD2Q9ULI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
NWD2Q9ULI1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NWD2Q9ULI1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
NWD2Q9ULI1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
NWD2Q9ULI1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
NWD2Q9ULI1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NWD2Q9ULI1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NWD2Q9ULI1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
NWD2Q9ULI1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NWD2Q9ULI1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NWD2Q9ULI1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NWD2Q9ULI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NWD2Q9ULI1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NWD2Q9ULI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NWD2Q9ULI1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NWD2Q9ULI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
NWD2Q9ULI1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NWD2Q9ULI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NWD2Q9ULI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
NWD2Q9ULI1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
NWD2Q9ULI1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
NWD2Q9ULI1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
NWD2Q9ULI1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NWD2Q9ULI1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
NWD2Q9ULI1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NWD2Q9ULI1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NWD2Q9ULI1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NWD2Q9ULI1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NWD2Q9ULI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NWD2Q9ULI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NWD2Q9ULI1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NWD2Q9ULI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms