Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GMEB2Q9UKD1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GMEB2Q9UKD1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GMEB2Q9UKD1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GMEB2Q9UKD1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GMEB2Q9UKD1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GMEB2Q9UKD1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GMEB2Q9UKD1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GMEB2Q9UKD1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GMEB2Q9UKD1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GMEB2Q9UKD1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GMEB2Q9UKD1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GMEB2Q9UKD1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GMEB2Q9UKD1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GMEB2Q9UKD1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
GMEB2Q9UKD1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GMEB2Q9UKD1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GMEB2Q9UKD1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GMEB2Q9UKD1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GMEB2Q9UKD1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GMEB2Q9UKD1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GMEB2Q9UKD1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GMEB2Q9UKD1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GMEB2Q9UKD1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GMEB2Q9UKD1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GMEB2Q9UKD1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GMEB2Q9UKD1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
GMEB2Q9UKD1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GMEB2Q9UKD1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
GMEB2Q9UKD1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GMEB2Q9UKD1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GMEB2Q9UKD1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GMEB2Q9UKD1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GMEB2Q9UKD1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GMEB2Q9UKD1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GMEB2Q9UKD1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
GMEB2Q9UKD1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GMEB2Q9UKD1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GMEB2Q9UKD1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GMEB2Q9UKD1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GMEB2Q9UKD1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GMEB2Q9UKD1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GMEB2Q9UKD1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GMEB2Q9UKD1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GMEB2Q9UKD1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GMEB2Q9UKD1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GMEB2Q9UKD1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GMEB2Q9UKD1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GMEB2Q9UKD1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GMEB2Q9UKD1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GMEB2Q9UKD1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GMEB2Q9UKD1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GMEB2Q9UKD1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GMEB2Q9UKD1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GMEB2Q9UKD1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GMEB2Q9UKD1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GMEB2Q9UKD1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GMEB2Q9UKD1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GMEB2Q9UKD1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GMEB2Q9UKD1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GMEB2Q9UKD1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GMEB2Q9UKD1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GMEB2Q9UKD1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GMEB2Q9UKD1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GMEB2Q9UKD1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GMEB2Q9UKD1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GMEB2Q9UKD1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GMEB2Q9UKD1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GMEB2Q9UKD1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GMEB2Q9UKD1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GMEB2Q9UKD1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GMEB2Q9UKD1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GMEB2Q9UKD1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GMEB2Q9UKD1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GMEB2Q9UKD1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GMEB2Q9UKD1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GMEB2Q9UKD1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GMEB2Q9UKD1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GMEB2Q9UKD1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GMEB2Q9UKD1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GMEB2Q9UKD1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GMEB2Q9UKD1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GMEB2Q9UKD1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GMEB2Q9UKD1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GMEB2Q9UKD1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GMEB2Q9UKD1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GMEB2Q9UKD1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GMEB2Q9UKD1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GMEB2Q9UKD1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GMEB2Q9UKD1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GMEB2Q9UKD1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GMEB2Q9UKD1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GMEB2Q9UKD1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GMEB2Q9UKD1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GMEB2Q9UKD1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GMEB2Q9UKD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GMEB2Q9UKD1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GMEB2Q9UKD1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GMEB2Q9UKD1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GMEB2Q9UKD1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms