Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.81■■■■■ 5.89
CNTLNQ9NXG0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC51.51■■■■■ 5.84
CNTLNQ9NXG0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.13■■■■■ 5.78
CNTLNQ9NXG0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
CNTLNQ9NXG0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
CNTLNQ9NXG0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.43■■■■■ 5.5
CNTLNQ9NXG0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
CNTLNQ9NXG0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.34■■■■■ 5.49
CNTLNQ9NXG0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.25■■■■■ 5.48
CNTLNQ9NXG0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
CNTLNQ9NXG0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
CNTLNQ9NXG0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.91■■■■■ 5.42
CNTLNQ9NXG0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
CNTLNQ9NXG0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
CNTLNQ9NXG0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
CNTLNQ9NXG0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
CNTLNQ9NXG0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.1■■■■■ 5.29
CNTLNQ9NXG0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
CNTLNQ9NXG0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
CNTLNQ9NXG0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
CNTLNQ9NXG0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
CNTLNQ9NXG0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
CNTLNQ9NXG0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.76■■■■■ 5.24
CNTLNQ9NXG0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.73■■■■■ 5.23
CNTLNQ9NXG0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
CNTLNQ9NXG0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.21
CNTLNQ9NXG0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.4■■■■■ 5.18
CNTLNQ9NXG0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
CNTLNQ9NXG0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
CNTLNQ9NXG0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.18■■■■■ 5.14
CNTLNQ9NXG0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
CNTLNQ9NXG0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
CNTLNQ9NXG0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
CNTLNQ9NXG0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CNTLNQ9NXG0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
CNTLNQ9NXG0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.63■■■■■ 5.06
CNTLNQ9NXG0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
CNTLNQ9NXG0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
CNTLNQ9NXG0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
CNTLNQ9NXG0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
CNTLNQ9NXG0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
CNTLNQ9NXG0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
CNTLNQ9NXG0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
CNTLNQ9NXG0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CNTLNQ9NXG0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
CNTLNQ9NXG0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
CNTLNQ9NXG0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
CNTLNQ9NXG0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.91
CNTLNQ9NXG0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
CNTLNQ9NXG0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CNTLNQ9NXG0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CNTLNQ9NXG0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CNTLNQ9NXG0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.53■■■■■ 4.88
CNTLNQ9NXG0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CNTLNQ9NXG0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CNTLNQ9NXG0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.87
CNTLNQ9NXG0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CNTLNQ9NXG0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
CNTLNQ9NXG0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CNTLNQ9NXG0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CNTLNQ9NXG0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CNTLNQ9NXG0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CNTLNQ9NXG0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.83
CNTLNQ9NXG0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.83
CNTLNQ9NXG0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CNTLNQ9NXG0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CNTLNQ9NXG0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CNTLNQ9NXG0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CNTLNQ9NXG0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
CNTLNQ9NXG0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CNTLNQ9NXG0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CNTLNQ9NXG0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CNTLNQ9NXG0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CNTLNQ9NXG0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
CNTLNQ9NXG0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CNTLNQ9NXG0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
CNTLNQ9NXG0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.72■■■■■ 4.75
CNTLNQ9NXG0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
CNTLNQ9NXG0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CNTLNQ9NXG0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CNTLNQ9NXG0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CNTLNQ9NXG0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
CNTLNQ9NXG0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
CNTLNQ9NXG0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CNTLNQ9NXG0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
CNTLNQ9NXG0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
CNTLNQ9NXG0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
CNTLNQ9NXG0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CNTLNQ9NXG0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC44.44■■■■■ 4.7
CNTLNQ9NXG0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CNTLNQ9NXG0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CNTLNQ9NXG0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CNTLNQ9NXG0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
CNTLNQ9NXG0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CNTLNQ9NXG0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
CNTLNQ9NXG0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
CNTLNQ9NXG0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.69
CNTLNQ9NXG0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
CNTLNQ9NXG0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CNTLNQ9NXG0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms